Summary

Изоляция и биофизических исследований фруктов кутикул

Published: March 30, 2012
doi:

Summary

Воздушная органов растений защищены кутикулой, супрамолекулярных biopolyester восковой сборки. Мы представляем протоколы для мониторинга селективное удаление эпи-и intracuticular воск от кутикулы плодов томата на молекулярном и микро уровнях путем твердотельный ЯМР и атомно-силовой микроскопии, соответственно, и оценить сшивания мощность инженерных кутикулярной biopolyesters.

Abstract

The cuticle, a hydrophobic protective layer on the aerial parts of terrestrial plants, functions as a versatile defensive barrier to various biotic and abiotic stresses and also regulates water flow from the external environment.1 A biopolyester (cutin) and long-chain fatty acids (waxes) form the principal structural framework of the cuticle; the functional integrity of the cuticular layer depends on the outer ‘epicuticular’ layer as well as the blend consisting of the cutin biopolymer and ‘intracuticular’ waxes.2 Herein, we describe a comprehensive protocol to extract waxes exhaustively from commercial tomato (Solanum lycopersicum) fruit cuticles or to remove epicuticular and intracuticular waxes sequentially and selectively from the cuticle composite. The method of Jetter and Schäffer (2001) was adapted for the stepwise extraction of epicuticular and intracuticular waxes from the fruit cuticle.3,4 To monitor the process of sequential wax removal, solid-state cross-polarization magic-angle-spinning (CPMAS) 13C NMR spectroscopy was used in parallel with atomic force microscopy (AFM), providing molecular-level structural profiles of the bulk materials complemented by information on the microscale topography and roughness of the cuticular surfaces. To evaluate the cross-linking capabilities of dewaxed cuticles from cultivated wild-type and single-gene mutant tomato fruits, MAS 13C NMR was used to compare the relative proportions of oxygenated aliphatic (CHO and CH2O) chemical moieties.

Exhaustive dewaxing by stepwise Soxhlet extraction with a panel of solvents of varying polarity provides an effective means to isolate wax moieties based on the hydrophobic characteristics of their aliphatic and aromatic constituents, while preserving the chemical structure of the cutin biopolyester. The mechanical extraction of epicuticular waxes and selective removal of intracuticular waxes, when monitored by complementary physical methodologies, provides an unprecedented means to investigate the cuticle assembly: this approach reveals the supramolecular organization and structural integration of various types of waxes, the architecture of the cutin-wax matrix, and the chemical composition of each constituent. In addition, solid-state 13C NMR reveals differences in the relative numbers of CHO and CH2O chemical moieties for wild-type and mutant red ripe tomato fruits. The NMR techniques offer exceptional tools to fingerprint the molecular structure of cuticular materials that are insoluble, amorphous, and chemically heterogeneous. As a noninvasive surface-selective imaging technique, AFM furnishes an effective and direct means to probe the structural organization of the cuticular assembly on the nm-μm length scale.

Protocol

1. Ферментативный изоляция томата смазывают 5 Поместите несколько коммерческих или томатов в миску. Очистите кожу от фруктов в больших разделов, отбросить внутренние ткани околоплодника. Вымыть помидор скинов деионизированной водой и сохранить их под воду в стакане. Подготовьте 50 мМ рН 4,0 буферного раствора ацетата натрия (при 31 ° C), положив 1,22 г тригидрата ацетата натрия (М р. 136,08 г / моль) и 2,34 мл ледяной уксусной кислоты (17,485 м) в стакан, добавить 200 мл деионизированной воды, а затем отрегулировать рН до 4,0 при 31 ° C. Приготовить смесь, содержащую 4 мл пектиназы (EC 3.2.1.15, 10 U мл -1, TCI Америки), 0,2 г целлюлозы (ЕС 232.734.4; 1,3 ед / мг твердых, Sigma Aldrich) и 13 мг NaN 3, , а затем добавьте 196 мл натрий ацетатного буфера с ферментом смеси для получения 200 мл окончательного коктейль фермента 5. Полностью погрузиться очищенный помидор коже фермента коктейль и инкубироватьпри 31 ° С в течение 24 часов с постоянной тряски (G24 экологической инкубатор Шейкер, New Brunswick Scientific Co.) Соберите шкуры томат помощью фильтра кухне или Бюхнера воронку и промыть их дистиллированной водой. Затем поместите их в вакуумной печи при комнатной температуре в течение часа. Сохранение сухие шкурки помидор помечены, максимум бутылка для последующих процедур депарафинизации. 2. Исчерпывающая Депарафинизация по Сокслета Добыча 6 Оборудование, используемое для исчерпывающего депарафинизации состоит из источника тепла (нагрев мантии и Variac контроллер), круглодонную колбу для растворителя водохранилища, экстрактор Сокслета, спеченного стекла наперсток или одноразовый наконечник добычи, анти-натыкаясь чипов и конденсатор (см. рис. 1). Обратите внимание, что узкая рука сифон (части 6 и 7 на рис. 1) очень тонкая и склонна к поломке, требующей осторожного обращения. Положите 0,5-1 г томатной кожи (полученные вШаг 1.) в ступе, и измельчить образец грубого порошка с пестиком, если образцы будут использоваться для измерения АСМ (раздел 5). Заполните спеченного стекла или одноразовые наперсток примерно на полпути с образцом и использовать пинцет, чтобы поместить его в тайне на основании извлечения столбцов. Установите конденсатор и обернуть ее фольгой. Нагрейте метанол (ACS класса) в присутствии нескольких анти-натыкаясь чипов до кипения осторожно и отливы на стенках колбы. Накройте емкость с растворителем и стекловолокна и алюминиевой фольги. Проверьте процесс в течение часа, регулируя Variac напряжение так, чтобы резервуар накапливается около одной капле в секунду и отборе происходит в аппарате Сокслета, когда наперсток полон. Продолжить процесс извлечения в течение 12 ч, затем опустите отопления мантии и позволяет аппарату остыть. Снимите экстрактор и водохранилища, как единое целое, чтобы избавиться от растворителя. Используйте выщипыватьRS поднять наперсток чуть ниже шеи экстракционной колонны, слейте излишки растворителя из нее, и поместите наконечник на чистую поверхность. Наклоните экстракционной колонны, чтобы отборе в колбу ниже. Отключите колбу и заливают отходы в помечены отходы растворителей сосуд. Повторите шаги 2.3 и 2.4 для последовательного растворители постепенно уменьшается полярность, например, хлороформ и гексана в течение 12 ч в каждом конкретном случае. Дайте пример помидор кутина сушить в наперсток, либо дует поток азота над ним или, поместив его в вакуумной печи при комнатной температуре. Наконец, измерения массы сухого образца и храните его при комнатной температуре в завинчивающейся банке запечатанный парафильмом. 3. Селективного выделения эпикутикулы и Intracuticular воски 3,4 Во-первых, мыть все помидоры (отдельные партии томатов от описанных в 1.) С дистиллированной водой. Высушите их папэ полотенца и Kimwipes, и место их остановить вниз на лист алюминиевой фольги. Краска все помидоры с 120% (в / в, отношение масс) гуммиарабика в водном растворе сверху вниз моды и позволит около часа, гуммиарабик высохнуть на коже фруктов, оставляя тонкую пленку. Удалить пленку с помощью пинцета, стараясь не проколоть кожу томатным. Повторите эту процедуру еще раз. Добавить фильмов флаконах, содержащих 1:1 (объем / объем) хлороформ воды и перемешать в течение трех минут. После интенсивном перемешивании и фазовое разделение, пипетка из хлороформа фракций и их испарения в отдельных обнаружили флаконы, оставляя эпикутикулы воска. Помидоры останутся нетронутыми физически. Опустите их в хлороформе в течение двух минут при комнатной температуре и собирать intracuticular воска после испарения растворителя. Теперь, очистить от кожуры помидоры и относиться к ним ферментативно (с целлюлазы и пектиназы натрия ацетатного буфера) для удаления клетчатки и пектина, соответственно (как описано в <strОнг> 1). При необходимости, выполнить исчерпывающий депарафинизации на эти ферментативно изолированной кутикулы путем экстракции Сокслета (см. шаг 2), с помощью трех растворителях различной полярности (метанол, хлороформ и гексана, соответственно). 4. Молекулярная характеристика Томатный кутина фруктов по кросс-поляризации Magic-угол прядильной твердотельные ядерного магнитного резонанса (CPMAS ssNMR) 6 Место 4-6 мг полностью депарафинированных помидор кутикулы (cutins) в 1,6 мм fastMAS циркония ротора помощи от поставщика упаковки инструмента. (Или земля депарафинированных кутикулы помидор или очень маленькие кусочки частично депарафинированных кутикулы подходит.) Убедитесь, что образец упакован равномерно, но не слишком плотно, в роторе. После сдачи на верхней крышке, краска половине шапки с черными чернилами маркером для облегчения измерения скорости вращения. Отрегулируйте шиммирования ЯМР-спектрометра для минимальной ширины спектральной линии на половине высотый калибровки протона (1 Н) и углерода (13 C) 90 ° шириной импульса с использованием стандартного соединения, такие как адамантана. Использование глицина или глютамин в качестве модельных соединений, получить максимальную интенсивность сигнала за счет оптимизации всех параметров (Hartmann-Хан соответствующие уровни мощности, 1 H – 13 C время контакта, гетероядерных 1 H развязки прочности) кросс-поляризации магическим углом спиннинг (CPMAS) эксперимента. Для спектры, полученные в 1 H частотой 600 МГц, рекомендуется условия включают в себя 10 кГц или 15 кГц частотой вращается, 3-секундная задержка между приобретениями и спинного гетероядерных протон развязки 7 при напряженности магнитного поля эквивалентно частоте 185 кГц. Вставьте кутина упаковке ротора в зонд. Затем поместите датчик в магнит. Увеличить скорость отжима до 10 кГц постепенно, чтобы проверить хороший образец упаковки и ротор стабильности. Убедитесь, что окончательное вращающийся стабильность ротора с точностью до± 20 Гц. Установите настройки и соответствующие конденсаторы зонда итеративно до достижения минимальной отражающей способности как на 1 H и 13 C ЯМР. Установить экспериментальной температуры до 25 ° C (или комнатной температуры). Запустите предварительно оптимизированные CPMAS эксперимент соответствующие Hartmann-Хан соответствующие условия определяются на 10 кГц частотой вращается. Приобретать 4096 переходных процессов, состояние спектра с экспоненциальным (лоренцевой) уширение линий 50-100 Гц, и сделать преобразование Фурье для получения спектра ЯМР интенсивности сигнала от химической защиты (частей на миллион). Ссылка 13 С химические сдвиги извне с помощью адамантана набор на 38,4 промилле (-CH 2 – группа) 8 в качестве стандарта. Увеличение ротор, вращающийся частоты до 15 кГц и повторить измерения CPMAS (шаги 4.6-4.8), соответствующие Hartmann-Хан соответствующие условия определяются на последнем спиннинг частоты. REPEна CPMAS экспериментов (шаги 4.1-4.9) с естественным (восковой) и частично депарафинированных образцы фруктов кутикулы. 5. Зондирования поверхности кутикулы томатный с атомно-силовой микроскопии (цифровые инструменты Наноскоп IIIa, процедуры будут немного отличаться среди микроскопов) 6 Включите сканирующего зондового микроскопа (СЗМ) (рис. 2) и убедитесь, что микроскоп режиме переключатель установлен в контакте атомно-силовой микроскопии (АСМ) режиме. Вручную поднять голову СПУ, превратив его два пользовательских регулируемые ручки фронт. Снимите tipholder АСМ от СПУ голову, повернув зажимной винт в задней части головы. Используйте пинцет, чтобы удалить существующий консольный АСМ от tipholder, затем осторожно возьмите новый консольный нитрида кремния (АСМ зонд) из упаковки и установите ее на место старой консоли. С помощью светового микроскопа, чтобы убедиться, что вновь установленные АСМ-кантилевера не нарушена. Прикрепить йэлектронной помидор кутикулы образца (раздел частично депарафинированных помидор кутикулы ~ 10 мм х 10 мм) из нержавеющей стали диска (пример шайба) с двухсторонней ленты. С помощью светового микроскопа, чтобы убедиться, что кутикула поверхность остается ровной и гладкой после размещения образца на шайбу. Поместите шайбу с образцом помидор кутикулы на магнитные области в верхней части СЗМ сканер. Установите два передних ручной регулировкой винта сканер высокой поворотом ручки, установить моторизованных винт обратно корректировка примерно на том же уровне, как и другие два передних винта. Убедитесь, что все три винта установлены достаточно высоко, чтобы избежать нарушения иглой АСМ при размещении tipholder в РП головы. Вставьте tipholder в РП головы и закрепите ее, затянув зажимной винт в задней части головы. После включения лазера, выравнивание лазерного пятна на консоли АСМ с помощью центрального (у) и правой (х) ручки лазерной коррекции на верхней части головы.Мониторинг отраженного лазерного луча на листке бумаги, чтобы позиционировать лазерное пятно именно в конце кантилевера АСМ. Отрегулируйте положение подвижного зеркала итеративно помощью ручки регулировки фотоприемник для достижения максимального сигнала (сигнал SUM), тем самым гарантируя, что отраженный лазерный луч в настоящее время получили ровно по четыре квадранта фотоприемника. Опустите кончик AFM стягиванием руководство винта спереди и моторизованных винт обратно настройка СЗМ сканер, визуально мониторинга подход иглой АСМ к поверхности образца с помощью инвертированного микроскопа. Убедитесь, что все три винта на том же уровне, чтобы избежать артефактов изображения наклонной образца. Возьмите наконечник к образцу, но не так близко, что кончик касается и прорывается через поверхность образца. На данный момент, лазерный луч отражается от кантилевера АСМ будет отскакивать от подвижного зеркала на фотодетектор. Для режима АСМ с кремниякон нитрида АСМ, установить выходной сигнал (вертикальное отклонение напряжения) до -2 В для 0 В уставки и сигнала DIFF (вертикальное / горизонтальное разницы) до 0 В, регулируя положение зеркала. Использование Наноскоп программного обеспечения, нажмите на значок микроскоп и выбрать подходящий профиль (контактный режим АСМ). Использование "Scan управления Настройки" панели, установить скорость сканирования и сканирования, например, размер, 10 микрон, размер сканируемого оригинала и 2 Гц частота сканирования. Позвольте иглой АСМ заниматься поверхности образца, нажав на участие наконечником значок. Управляя моторизованных задний винт базе СЗМ, программа теперь будет снизить наконечник, пока он занимается поверхности образца. Процесс сканирования будет автоматически запускаться один раз верхушка занимается успешно. Следить за процессом сканирования с использованием как образ и сферы режимы программного обеспечения, настройка параметров, таких как уставки, интегральной составляющей, пропорциональной выгоды, размер сканирования, скорость сканирования, линий и образцы / линия многократно для достижения высокихразрешение изображения. Начать сканирование с большой оси диапазон (по данным шкалы), а затем тщательно снизить стоимость данных масштабе наблюдать за лучший контраст поверхности особенностей на изображении. Свернуть появление белых областей на отсканированном изображении, которые показывают, что высота поверхности функции превышает имеющиеся оси диапазона. Запись изображения, чтобы сохранить файл данных, а затем обрабатывают данные с помощью функции сжатия для удаления артефактов изображения за счет вертикальной (Z) сканер дрейф, изображения луков, и вертикальное смещение между строк развертки, 9, наконец, вычислить среднюю шероховатость. После сохранения данных, убрать иглой АСМ, поменяв действие с компьютерным управлением винт двигателя, который был использован для его участия. Обработка изображения может осуществляться в автономном режиме анализа изображений и / или используя другой компьютер. Используйте перед серым ручки металлические наконечник держателя для изменения х и у позициям область сканирования, а затем повторить измерение в пять образцов LocaTIONS проверить воспроизводимость, заменив кантилевера АСМ, если качество изображения ухудшается. 6. Представитель Результаты Химический сдвиг анализ CPMAS 13 С-ЯМР (рис. 3) определены основные функциональные группы, присутствующие в исчерпывающе депарафинированных помидор кутикулы (кутина). Ключевым фрагментов углерода в кутина biopolyester оказались длинноцепочечных алифатических соединений (0-45 т), кислородом алифатические (45-110 частей на миллион), многократно связями и ароматических соединений (110-160 частей на миллион), и карбонилы (160-220 частей на миллион). Кислородом алкильных фрагментов (СНО + CH 2 O) играют ключевую роль в создании ковалентной связи между звеньев биополимера кутина, образуя молекулярную архитектуру матрицы кутина. Различия в относительной области пик наблюдается в спектральной области между промилле 45 до 100 показывают, что мутант кутина имеет относительно большую долю сшивки формирования СНО Structura л остатков по сравнению с диким типом кутина; осторожны количественных измерений с использованием прямого поляризации (DPMAS) ЯМР 5 методов поддержки этого вывода (данные не представлены). CPMAS 13 С-ЯМР показал также постепенно уменьшается воск пик на 31 страниц в минуту (рис. 4), что свидетельствует о последовательном удаление эпи-и intracuticular воск от кутина восковой композитный, сохраняя при этом основную архитектуру химической кутина биополимера. Параллельный анализ АСМ-изображения (рис. 5) показал, неровности поверхности за счет ступенчатого извлечения эпи-и intracuticular воск из плодов кутикулы, показывая изменения в организации кутикулярной сборки. На рис. 1 экстрактор Сокслета (изображение Источник: Википедия). "/> Рисунок 2.) Сканирующий зондовый микроскоп. Б) глава СПУ (взято из руководства АСМ обучения, предоставляемого цифровых инструментов). Рисунок 3. 150 МГц CPMAS 13 С спектров ЯМР исчерпывающе депарафинированных красный фрукт спелый помидор кутикулы (cutins) от дикого типа (M82) и мутантной (CM15) показывают резонансы химических сдвигов соответствующих функциональных групп сшитого hydroxyfatty кислоты на основе полиэстера, а также некоторые многократно связанных фрагментов. Все спектры были получены с 10 кГц частотой вращается. Рисунок 4. 150 МГц 13 CCPMAS спектров ЯМР коммерческие красный спелый помидор кутикулы фрукты демонстрируют изменения состава на последовательное устранение эпикутикулы и intracuticular воски гуммиарабика механической добычи и TWо минуты хлороформ падение, соответственно. Все спектры были получены с 15 кГц частотой вращается. Рисунок 5. АСМ изображения и шероховатости оценки частично депарафинированных коммерческих помидор смазывают показано на рис 4 после ступенчатого удаления эпикутикулы (слева) и intracuticular (справа) воска.

Discussion

Протоколы, описанные здесь позволяют подробную молекулярную и микромасштабной характеристики комплекса неразрешимых растительного сырья без разрушительных пробоя химических веществ. Для исследования смешения biopolyester кутина различных липидов (восков), которые контролируют структурной организации кутикулярной сборки, 10 мы провели мониторинг и процедуры для селективного удаления эпикутикулы и intracuticular воски из гетерогенных кутикулярной смеси. Твердотельный ЯМР 13 С был использован для оценки добычи воск молекулярных компонентов, а также атомно-силовой микроскопии служил для изучения сопутствующих изменений в шероховатости поверхности. 6,11 Для сравнения сшивания возможности cutins из культивируемых дикого типа и одного гена мутанта плоды томатов, твердотельный ЯМР 13 С была использована для оценки относительного количества углеводов и CH 2 O химических остатков.

Ряд конструктивных функцийс этого протокола отличаются. Как воск материалы охватывают широкий спектр липидов, рассматривая плод кутикулы с рядом растворители, имеющие различные полярности имеет важное значение для достижения исчерпывающего депарафинизации. Кроме того, депарафинизации время может варьироваться от 8 часов до 24 часов, в зависимости от характера кутикулы образцов. Чтобы извлечь эпикутикулы воска последовательно с нетронутой кутикулы плоды, необходимо наносить клей покрытие равномерно на поверхность.

Твердотельные CPMAS ЯМР 13 С 12 быстрый качественный метод идентификации различных структурных компонентов весьма неоднородны и нерастворимых биополимеров завод при сохранении родного физические характеристики, 13 традиционных решений состоянии ЯМР также может быть использована для характеристики извлеченного смеси воска. Если количественная оценка функциональных групп, желательно на неповрежденную полимеров завод, 5 высококачественный прямой поляризации магическим углом спиннинг (DКБП) 13 C ЯМР 5,14 следует использовать в качестве дополнительного метода. Точный количественный анализ функциональных групп требует тщательной оптимизации раза рециркуляции, длина импульса возбуждения и силы гетероядерных развязки. 15 гетероядерных развязка может быть установлен на 1 H поля в диапазоне от 50 кГц до 185 кГц с помощью TPPM 16 или СПИННОГО 7 методик. В дополнение к этим параметрам чувствительности измерений CPMAS зависит от спин-блокировки времени и Hartmann-Хан условие согласования 15. Вместо традиционных CPMAS, увеличили амплитуды СР (RAMP-CP) метод может быть реализован в максимально крест поляризации эффективности путем изменения амплитуды 1 H линейно (~ 20-50%) или касательной, сохраняя при этом амплитуда 13 С поля постоянного во время спин-блокировки периода (или наоборот). 17,18 Проведение измерений на CPMAS как минимум два различных роТор-прядильной частот необходимо различать вращающийся боковые из основных спектральных пиков.

Параллельное измерение АСМ проводится в контактном режиме обеспечивает прямую визуализацию состояния поверхности кутикулы с высокой скоростью сканирования и высоким разрешением, 19, например, при последовательном удалении восковых компонентов. Операционная AFM в освоении (бесконтактный режим) может быть использована в качестве альтернативы для поверхностных характеристик тонких "мягкие" материалы растительного происхождения, чтобы избежать возможных повреждений из-за боковой (сдвиг), силы и очищая от поверхности образца. 5,20 В любом случае , последовательное приобретение нескольких изображений одного и того же места на поверхности служит для выявления любой поверхности повреждения в результате "зонд-поверхность взаимодействия" в измерениях АСМ. 6,21 Для оптимальной воспроизводимости АСМ зондов с весны констант подходит для мягкой кутикулярной поверхности должны быть используется, и постоянство температуры и влажности должны быть сохранены. 6,15,20 </sдо> В то время как твердотельный ЯМР предлагает молекулярного профиля среднее по ансамблю (объемных) свойств кутикулы плодов томата, атомная сила изображения обеспечивает дополнительный датчик неинвазивного 22,23 для отслеживания рельефа поверхности этих изысканно сложных сборок макромолекулярных. 1,2

Offenlegungen

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Эта работа была поддержана Национальным Научным Фондом США гранты # MCB-0741914 и MCB-0843627, дополнительные инфраструктурные поддержка была оказана в колледже Нью-Йорка на Национальные институты здравоохранения 2 RR03060 G12-26 из Национального центра по изучению ресурсов. Мы выражаем глубокую признательность JKC Роза группа в Корнельском университете департамента биологии растений для обеспечения M82 (дикий тип) и CM15 (мутантный) помидор кутикулы. Мы благодарим доктора Спирос Monastiriotis от CCNY группа химического машиностроения профессора Александра Couzis за его щедрую помощь в экспериментах АСМ. Мы благодарим г-жа Лорен Gohara для графической поддержки дизайна.

Materials

Name of the reagent Company Catalog no. Comments
Sodium acetate trihydrate Sigma-Aldrich S8625-500G  
Pectinase TCI America P0026 EC 3.2.1.15; 10 U ml-1, store in refrigerator
Cellulase Sigma-Aldrich C1184-100KU EC232.734.4; 1.3 units/mg, store in refrigerator
Glacial Acetic acid Sigma-Aldrich A9967  
Sodium azide Sigma-Aldrich S2002-100G Extremely hazardous
Incubator/shaker New Brunswick Scientific Co. Model No.G24 MFG No.M1036-000G
Vacuum Oven Precision Scientific 31566  
Variac Controller      
Sintered glass thimble (85 mm/25mm) VWR 89056  
Disposable extraction thimble ( 80 mm/ 25 mm) VWR 28320  
Methanol VWR EMD-MX0485-7  
Glass wool VWR RK20789  
Aluminum foil Fisher 01-213-100  
Tweezers VWR 82027-452  
Chloroform VWR EM-CX1050-1  
Hexane Fisher Scientific H302-4  
Nitrogen gas      
Parafilm VWR 52858  
Paper towels VWR 89002-984  
Kim wipes VWR 21905-026  
Gum arabic Sigma G9752  
1.6 mm fastMAS zirconia rotor Varian (Agilent)    
NMR spectrometer Varian 600 NMRS standard bore magnet  
Glycine Sigma-Aldrich 50046 Model compound for CPMAS
Glutamine Sigma-Aldrich 49419 Model compound for CPMAS
Adamantane Sigma-Aldrich 100277 To calibrate 90° pulse in NMR
Multimode Scanning Probe Microscope (Nanoscope IIIA) Digital Instruments (Bruker AXS)    
Nanoscope software Digital Instruments (Bruker AXS)   Version 5.30r3sr3 (2005)
AFM probe (Nonconductive silicon nitride tip) Veeco (Bruker AXS) Model NP-20  
Light microscope Digital Instruments    
Magnetic puck Digital Instruments    
Double sided tape VWR    
Fruit Peeler      
Büchner funnel VWR 89038  

Referenzen

  1. Dom#237;nguez, E., Heredia-Guerrero, J. A., Heredia, A. The biophysical design of plant cuticles: an overview. New Phytologist. 189, 938-949 (2011).
  2. Bargel, H., Koch, K., Cerman, Z., Neinhuis, C. Structure-function relationships of the plant cuticle and cuticular waxes – a smart material?. Functional Plant Biol. 33, 893-910 (2006).
  3. Jetter, R., Schäffer, S. Chemical Composition of the Prunus laurocerasus Leaf Surface. Dynamic Changes of the Epicuticular Wax Film during Leaf Development. Plant Physiol. 126, 1725-1737 (2001).
  4. Vogg, G. Tomato fruit cuticular waxes and their effects on transpiration barrier properties: functional characterization of a mutant deficient in a very-long-chain fatty acid β-ketoacyl-CoA synthase. J. Exper. Botany. 55, 1401-1410 (2004).
  5. Isaacson, T. Cutin deficiency in the tomato fruit cuticle consistently affects resistance to microbial infection and biomechanical properties, but not transpirational water loss. Plant J. 60, 363-377 (2009).
  6. Round, A. N. The Influence of Water on the Nanomechanical Behavior of the Plant Biopolyester Cutin as Studied by AFM and Solid-State NMR. Biophysical J. 79, 2761-2767 (2000).
  7. Fung, B. M., Khitrin, A. K., Ermolaev, K. An Improved Broadband Decoupling Sequence for Liquid Crystals and Solids. J. Magn. Reson. 142, 97-101 (2000).
  8. Morcombe, C. R., Zilm, K. W. Chemical shift referencing in MAS solid state NMR. J. Magn. Reson. 162, 479-486 (2003).
  9. Fang, S. J., Haplepete, S., Chen, W., Helms, C. R., Edwards, H. Analyzing atomic force microscopy images using spectral methods. J. App. Phys. 82, 5891-5898 (1997).
  10. Pollard, M., Beisson, F., Li, Y., Ohlrogge, J. B. Building lipid barriers: biosynthesis of cutin and suberin. Trends. Plant Sci. 13, 236-246 (2008).
  11. Stark, R. E. NMR studies of structure and dynamics in fruit cuticle polyesters. Solid State Nucl. Mag. 16, 37-45 (2000).
  12. Schaefer, J., Stejskal, E. O. Carbon-13 nuclear magnetic resonance of polymers spinning at the magic angle. J. Amer. Chem. Soc. 98, 1031-1032 (1976).
  13. Sachleben, J. R., Chefetz, B., Deshmukh, A., Hatcher, P. G. Solid-State NMR Characterization of Pyrene-Cuticular Matter Interactions. Envir. Sci. & Tech. 38, 4369-4376 (2004).
  14. Zlotnik-Mazori, T., Stark, R. E. Nuclear magnetic resonance studies of cutin, an insoluble plant polyester. Macromolecules. 21, 2412-2417 (1988).
  15. Stark, R. E., Garbow, J. R. Nuclear magnetic resonance relaxation studies of plant polyester dynamics. 2. Suberized potato cell wall. Macromolecules. 25, 149-154 (1992).
  16. Bennett, A. E., Rienstra, C. M., Auger, M., Lakshmi, K. V., Griffin, R. G. Heteronuclear Decoupling in Rotating Solids. J. Chem. Phys. 103, 6951-6958 (1995).
  17. Metz, G., Wu, X. L., Smith, S. O. Ramped-Amplitude Cross-Polarization in Magic-Angle-Spinning NMR. J. Magn. Reson. Ser. A. 110, 219-227 (1994).
  18. Peersen, O. B., Wu, X. L., Smith, S. O. Enhancement of CP-MAS Signals by Variable-Amplitude Cross-Polarization – Compensation for Inhomogeneous B-1 Fields. J. Magn. Reson. Ser. A. 106, 127-131 (1994).
  19. lessandrini, A., Facci, P. AFM: a versatile tool in biophysics. Measurement Sci. & Tech. 16, 10-1088 (2005).
  20. Benítez, J. J., Matas, A. J., Heredia, A. Molecular characterization of the plant biopolyester cutin by AFM and spectroscopic techniques. J. Struct. Biol. 147, 179-184 (2004).
  21. Koch, K., Neinhuis, C., Ensikat, H. J., Barthlott, W. Self assembly of epicuticular waxes on living plant surfaces imaged by atomic force microscopy (AFM). J. Exper. Bot. 55, 711-718 (2004).
  22. Muller, D. J. AFM: A Nanotool in Membrane Biology. Biochemie. 47, 7986-7998 (2008).
  23. Last, J. A., Russell, P., Nealey, P. F., Murphy, C. J. The Applications of Atomic Force Microscopy to Vision Science. Investigative Ophthalmology & Visual Science. 51, 6083-6094 (2010).

Play Video

Diesen Artikel zitieren
Chatterjee, S., Sarkar, S., Oktawiec, J., Mao, Z., Niitsoo, O., Stark, R. E. Isolation and Biophysical Study of Fruit Cuticles. J. Vis. Exp. (61), e3529, doi:10.3791/3529 (2012).

View Video