공중 식물 장기는 표피, supramolecular biopolyester – 왁스 어셈블리의 보호를받습니다. 우리는 고체 NMR 및 원자 힘 현미경에 의한 분자와 마이크로 저울에 토마토 과일 손톱에서의 선택적 제거 에피와 intracuticular 왁스, 각각을 모니터링하고, 공학 cuticular biopolyesters의 가교 능력을 평가하기 위해 프로토콜을 소개합니다.
표피, 지상파 식물의 공중 부분에 소수성 보호 계층, 다양한 biotic 및 비생물적 스트레스에 대한 다양한 방어 장벽으로서 기능과 또한 외부 환경으로부터 물의 흐름을 조절 1. biopolyester (cutin)와 긴 사슬 지방산 ( 왁스)은 표피의 주요 구조적 프레임 워크를 형성;. cuticular 레이어의 기능성 무결성 cutin 생체 고분자와 'intracuticular'왁스 2 언급된 구성된 혼합, 우리는 포괄적인 프로토콜을 설명하는 바깥 'epicuticular'계층뿐만 아니라 의존 상업 토마토 (Solanum lycopersicum) 과일 손톱에서 철저하게 왁스를 추출하거나 표피의 합성부터 순차적으로 선택적으로 epicuticular 및 intracuticular 왁스를 제거합니다. Jetter 및 Schäffer (2001)의 방법은 과일 표피로부터 epicuticular 및 intracuticular 왁스의 stepwise 추출을 위해 적응되었다. 3,4가를 모니터링하려면순차 왁스 제거, 고체 교차 편광 마술 앵글 – 방적 과정 (CPMAS) 13 C NMR 분광법이에 대한 정보에 의해 보완 벌크 재료의 분자 수준의 구조 프로파일을 제공 원자 힘 현미경 (AFM)과 병렬로 사용되었다 microscale 지형과 cuticular 표면의 거칠기. 경지 야생 – 타입과 단일 유전자 돌연변이 토마토 열매로부터 dewaxed 손톱의 상호 연결 기능을 평가하기 위해 MAS 13 C NMR은 산소 지방족 (CHO 및 CH 2 O) 화학 moieties의 상대적 비율을 비교하는 데 사용되었다.
cutin의 biopolyester의 화학 구조를 보존하면서 극성 변화의 용매의 패널과 stepwise Soxhlet 추출에 의한 철저한 dewaxing은 그들의 지방족 및 방향족의 성분 중 소수성 특성에 따라 왁스 moieties를 분리하는 효율적인 수단을 제공합니다. epicuticular 왁스와 sele의 기계적 추출보완 물리적인 방법론에 의해 모니터링 intracuticular 왁스의 ctive 제거, 표피 어셈블리를 조사하기 위해 전례없는 수단을 제공 :이 접근법은 supramolecular 조직과 왁스의 다양한 유형의 구조적 통합, cutin – 왁스 모체의 아키텍처, 그리고 화학 물질을 드러내 각 성분의 조성. 또한, 고체 13 C NMR은 야생 형 및 돌연변이 빨간색으로 익은 토마토 과일에 대한 CHO 및 CH 2 O 화학 moieties의 상대적 숫자의 차이를 보여준다. NMR 기법은 지문, 불용성 비정질 및 화학적으로 이기종 있습니다 cuticular 물질의 분자 구조에 뛰어난 도구를 제공합니다. 비침 투 표면 선택적 이미징 기법으로서, AFM은 NM-μm의 길이 규모 cuticular 어셈블리의 구조 조직을 알아내기 위해 효과적이고 직접적인 수단을 furnishes.
프로토콜은 본 파괴적인 화학 분석없이도 복잡한 가공하기 어려운 식물 소재의 상세한 분자와 microscale 특성화 수 있도록 설명했다. 우리는 이기종 cuticular 조화에서 epicuticular 및 intracuticular 왁스의 선택적 제거 절차를 실시하고 모니터링 cuticular 어셈블리의 구조적 조직, 10을 제어 다양한 lipids (왁스)로 cutin의 biopolyester의 블렌딩을 조사합니다. 고체 13 C NMR은 경지 야생 – 타입과 단일 유전자로부터 cutins의 상호 연결 기능을 비교하려면 왁스 분자 구성 요소의 추출을 측정하는 데 사용하고, 원자 힘 현미경은 표면 거칠기에 수반하는 변화를 검토 하였다. 6,11되었다 돌연변이 토마토 과일은 고체 13 C NMR도 CHO과 CH 2 O 화학 moieties의 상대적 숫자를 추정하는 데 사용되었다.
디자인 기능의 개수이 프로토콜의 S는 주목할 수 있습니다. 왁스 자료가 분기하는 극성을 가진 용매의 일련의 과일 표피를 치료, lipids의 넓은 범위를 망라적으로 완전한 dewaxing를 달성하는 것이 필수적이다. 또한, dewaxing 시간은 8 시간 동안의 표피 샘플의 특성에 따라 24 시간이 다를 수 있습니다. 그대로 과일 표피로부터 지속 epicuticular 왁스를 추출하기 위해서는 표면에 균일하게 접착 코팅을 적용하는 필수적입니다.
고체 CPMAS 13 C NMR 12 그들 나라의 물리적 특성을 유지하면서 고도의 이기종 및 불용성 식물 biopolymers의 다양한 구조적 구성 요소를 식별을위한 신속한 질적 방법으로, 13 전통적인 솔루션 상태 NMR 또한 추출된 왁스 섞어 특성화하는 데 사용할 수 있습니다. 기능성 그룹의 양적 추정은 그대로 식물 폴리머, 5 고충 실도 직접 편광 마술 – 각도 회전 (D 대해 원하는 경우PMAS) 13 C NMR 5,14가 상호 보완적인 방법으로 사용해야합니다. 기능성 그룹의 정확한 quantitation는 재활용 시간, 여기 펄스 길이 및 헤테로핵 감결합의 강도주의 최적화가 필요합니다. 15 헤테로핵 감결합가 TPPM 16 또는를 사용하여 50 kHz에서에서 185 kHz에서까지 1 H 필드 강도 설정을 지정할 수도 있습니다 척수 7 방법론. 이러한 매개 변수 외에도 CPMAS 측정의 감도가 스핀 잠금 시간 및 하트만-돼야 해 한이 매칭 조건에 따라 다릅니다. 전통 CPMAS 대신에 15, ramped-진폭 CP (진입로-CP) 기술은 십자가를 최대화하기 위해 구현할 수 스핀 잠금 기간 (또는 그 반대) 동안 지속 13 C 필드 강도의 진폭을 유지하면서 선형적으로 한 H 진폭을 변화 (~ 20-50%) 또는 tangentially별로 편광 효율.에서 CPMAS 측정을 수행 17,18 두 가지 RO 최소토르 – 스피닝 주파수 메인 스펙트럼 봉우리에서 회전 sidebands을 구분하는 필수적입니다.
접촉 모드에서 실시한 동시 AFM 측정 밀랍 성분의 연속 제거하는 동안 인스턴스에 대한 높은 스캔 속도와 고해상도, 19와 표피 표면 상태를 직접 영상을 가능하게합니다. 각각의 경우에 (비 접촉) 모드가 가로 (전단) 세력에 의한 손상을 피할 수 있고 샘플 표면의 부서, 섬세하고 "소프트"식물 재료의 표면 특성에 대한 대안으로 사용될 수 있습니다. 5,20 도청에서 AFM 운영 , 표면에 같은 위치의 여러 이미지의 연속적인 인수 AFM 측정에서 "탐침 – 표면 상호 작용"으로 인한 표면 손상을 식별하기 위해 제공하고 있습니다. 6,21 최적의 재현성을 보려면 소프트 cuticular 표면에 적합한 스프링 상수와 AFM 프로브가 있어야 온도와 습도의 사용, 그리고 비극적가 유지되어야합니다. 6,15,20 </s최대 고체 NMR 반면>는 앙상블 평균 (벌크) 토마토 과일 손톱에있는 속성의 분자 프로파일을 제공하며, 원자 힘 이미징이 정교하게 복잡한 macromolecular 어셈블리의 표면 지형을 추적하기위한 보완적인 비침 투 프로브 22,23을 제공합니다. 1,2은
The authors have nothing to disclose.
이 작품은 미국 국립 과학 재단 기금 # MCB-0741914 및 MCB-0843627에 의해 지원되었다; 추가 infrastructural 지원은 건강 2의 국립 연구소 연구 자원을위한 국립 센터에서 G12 RR03060-26에 의한 뉴욕시 대학에서 제공했습니다. 우리는 기꺼이 그 JKC는 M82 (야생 유형) 및 CM15 (돌연변이) 토마토 손톱를 제공해 주셔서 코넬 대학 식물 생물학과에서 그룹을 장미 인정합니다. 우리는 AFM 실험과 그의 관대한 도움을위한 교수 알렉산더 Couzis의 CCNY 화학 공학 그룹에서 박사 Spyros Monastiriotis 감사드립니다. 우리는 그래픽 디자인 지원을 위해 양 로렌 Gohara 감사드립니다.
Name of the reagent | Company | Catalog no. | Comments |
Sodium acetate trihydrate | Sigma-Aldrich | S8625-500G | |
Pectinase | TCI America | P0026 | EC 3.2.1.15; 10 U ml-1, store in refrigerator |
Cellulase | Sigma-Aldrich | C1184-100KU | EC232.734.4; 1.3 units/mg, store in refrigerator |
Glacial Acetic acid | Sigma-Aldrich | A9967 | |
Sodium azide | Sigma-Aldrich | S2002-100G | Extremely hazardous |
Incubator/shaker | New Brunswick Scientific Co. | Model No.G24 | MFG No.M1036-000G |
Vacuum Oven | Precision Scientific | 31566 | |
Variac Controller | |||
Sintered glass thimble (85 mm/25mm) | VWR | 89056 | |
Disposable extraction thimble ( 80 mm/ 25 mm) | VWR | 28320 | |
Methanol | VWR | EMD-MX0485-7 | |
Glass wool | VWR | RK20789 | |
Aluminum foil | Fisher | 01-213-100 | |
Tweezers | VWR | 82027-452 | |
Chloroform | VWR | EM-CX1050-1 | |
Hexane | Fisher Scientific | H302-4 | |
Nitrogen gas | |||
Parafilm | VWR | 52858 | |
Paper towels | VWR | 89002-984 | |
Kim wipes | VWR | 21905-026 | |
Gum arabic | Sigma | G9752 | |
1.6 mm fastMAS zirconia rotor | Varian (Agilent) | ||
NMR spectrometer | Varian 600 NMRS | standard bore magnet | |
Glycine | Sigma-Aldrich | 50046 | Model compound for CPMAS |
Glutamine | Sigma-Aldrich | 49419 | Model compound for CPMAS |
Adamantane | Sigma-Aldrich | 100277 | To calibrate 90° pulse in NMR |
Multimode Scanning Probe Microscope (Nanoscope IIIA) | Digital Instruments (Bruker AXS) | ||
Nanoscope software | Digital Instruments (Bruker AXS) | Version 5.30r3sr3 (2005) | |
AFM probe (Nonconductive silicon nitride tip) | Veeco (Bruker AXS) | Model NP-20 | |
Light microscope | Digital Instruments | ||
Magnetic puck | Digital Instruments | ||
Double sided tape | VWR | ||
Fruit Peeler | |||
Büchner funnel | VWR | 89038 |