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Um procedimento padronizado para monitorar flores algas nocivas no Chile por análise de metabarco
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A Standardized Procedure for Monitoring Harmful Algal Blooms in Chile by Metabarcoding Analysis

Um procedimento padronizado para monitorar flores algas nocivas no Chile por análise de metabarco

português

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09:47 min

•

August 26, 2021

DOI:

10.3791/62967-v

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10.3791/62967-v

•

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August 26, 2021

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1Office of Research and Academia-Government-Community Collaboration,Hiroshima University, 2Graduate School of Human and Environmental Studies,Kyoto University, 3Scientific and Biotechnological Bioresource Nucleus,Universidad de La Frontera, 4Centro de Estudios de Algas Nocivas,Instituto de Fomento Pesquero, 5Ciencias del Mar y Recursos Biologicos,Universidad de Antofagasta, 6Departamento de Ciencias Biológicas y Biodiversidad,Universidad de Los Lagos, 7Japan Fisheries Research and Education Agency,Fisheries Resources Institute

Summary

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Este protocolo introduz etapas da análise de metabarcoco, visando genes de rRNA 16S e 18S rRNA, para monitoramento de flores algas nocivas e seu microbioma associado em amostras de água do mar. É uma poderosa ferramenta molecular, mas requer vários procedimentos, que são explicados visualmente passo a passo.

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Harmful Algal BloomsMetabarcoding Analysis16S RRNA18S RRNAPhytoplanktonMicroscopyPCRAgarose Gel ElectrophoresisDNA ExtractionWater SamplingMonitoring Protocol

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Yarimizu, K., Fujiyoshi, S., Kawai, M., Acuña, J. J., Rilling, J., Campos, M., Vilugrón, J., Cameron, H., Vergara, K., Gajardo, G., Espinoza-González, O., Guzmán, L., Nagai, S., Riquelme, C., Jorquera, M. A., Maruyama, F. A Standardized Procedure for Monitoring Harmful Algal Blooms in Chile by Metabarcoding Analysis. J. Vis. Exp. (174), e62967, doi:10.3791/62967 (2021).

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