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August 26, 2021
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Ce protocole introduit des étapes d’analyse de métabarcodage, ciblant les gènes de l’ARNr 16S et de l’ARNr 18S, pour surveiller les proliférations d’algues nocives et leur microbiome associé dans les échantillons d’eau de mer. C’est un outil moléculaire puissant mais qui nécessite plusieurs procédures, qui sont expliquées visuellement ici étape par étape.
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Yarimizu, K., Fujiyoshi, S., Kawai, M., Acuña, J. J., Rilling, J., Campos, M., Vilugrón, J., Cameron, H., Vergara, K., Gajardo, G., Espinoza-González, O., Guzmán, L., Nagai, S., Riquelme, C., Jorquera, M. A., Maruyama, F. A Standardized Procedure for Monitoring Harmful Algal Blooms in Chile by Metabarcoding Analysis. J. Vis. Exp. (174), e62967, doi:10.3791/62967 (2021).
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