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August 26, 2021
DOI:
1Office of Research and Academia-Government-Community Collaboration,Hiroshima University, 2Graduate School of Human and Environmental Studies,Kyoto University, 3Scientific and Biotechnological Bioresource Nucleus,Universidad de La Frontera, 4Centro de Estudios de Algas Nocivas,Instituto de Fomento Pesquero, 5Ciencias del Mar y Recursos Biologicos,Universidad de Antofagasta, 6Departamento de Ciencias Biológicas y Biodiversidad,Universidad de Los Lagos, 7Japan Fisheries Research and Education Agency,Fisheries Resources Institute
Summary
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このプロトコルは、16S rRNAおよび18S rRNA遺伝子を標的とするメタバーコーディング分析のステップを導入し、海水サンプル中の有害な藻類の花および関連するマイクロバイオームをモニタリングする。これは強力な分子ベースのツールですが、ここで説明する手順をいくつか必要とします。
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Yarimizu, K., Fujiyoshi, S., Kawai, M., Acuña, J. J., Rilling, J., Campos, M., Vilugrón, J., Cameron, H., Vergara, K., Gajardo, G., Espinoza-González, O., Guzmán, L., Nagai, S., Riquelme, C., Jorquera, M. A., Maruyama, F. A Standardized Procedure for Monitoring Harmful Algal Blooms in Chile by Metabarcoding Analysis. J. Vis. Exp. (174), e62967, doi:10.3791/62967 (2021).
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