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Ein standardisiertes Verfahren zur Überwachung schädlicher Algenblüten in Chile durch Metabarcoding-Analyse
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1Office of Research and Academia-Government-Community Collaboration,Hiroshima University, 2Graduate School of Human and Environmental Studies,Kyoto University, 3Scientific and Biotechnological Bioresource Nucleus,Universidad de La Frontera, 4Centro de Estudios de Algas Nocivas,Instituto de Fomento Pesquero, 5Ciencias del Mar y Recursos Biologicos,Universidad de Antofagasta, 6Departamento de Ciencias Biológicas y Biodiversidad,Universidad de Los Lagos, 7Japan Fisheries Research and Education Agency,Fisheries Resources Institute
Chapters
- 00:04Introduction
- 00:59Sample Collection, Pretreatment, and Microscope Analysis
- 01:5516S rRNA and 18S rRNA Metabarcoding Analysis
- 07:00Results: Metabarcoding Analysis for Monitoring Harmful Algal Blooms and Their Associated Microbiome in Seawater
- 08:50Conclusion
Dieses Protokoll führt Schritte der Metabarcoding-Analyse ein, die auf 16S rRNA- und 18S rRNA-Gene abzielen, um schädliche Algenblüten und ihr assoziiertes Mikrobiom in Meerwasserproben zu überwachen. Es ist ein leistungsfähiges molekulares Werkzeug, erfordert aber mehrere Verfahren, die hier Schritt für Schritt visuell erklärt werden.
