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Purificação de Afinidade MS2 juntamente com sequenciamento de RNA em bactérias gram-positivas
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MS2-Affinity Purification Coupled with RNA Sequencing in Gram-Positive Bacteria

Purificação de Afinidade MS2 juntamente com sequenciamento de RNA em bactérias gram-positivas

DOI:
10.3791/61731-v

•

08:34 min

•

February 23, 2021

•

, , , , ,
1Université de Strasbourg, CNRS, 2Department of Biochemistry,Université de Sherbrooke

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 01:05Bacteria Harvesting and Lysis
  • 02:52MS2-affinity Purification
  • 03:55RNA Extraction of Collected Fractions (CE, FT, W and E)
  • 05:24Results: Constructs Validation and MAPS Controls
  • 07:49Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

A tecnologia MAPS foi desenvolvida para examinar o targetome de um RNA regulatório específico in vivo. O sRNA de interesse é marcado com um aptamer MS2 permitindo a co-purificação de seus parceiros RNA e sua identificação por sequenciamento de RNA. Este protocolo modificado é particularmente adequado para bactérias Gram-positivas.

Tags

MS2-affinity PurificationRNA SequencingMAPSGram-positive BacteriaSRNARegulatory NetworksVirulence FactorsBiofilm FormationStaphylococcal InfectionsCell LysisAmylose ResinMBP-MS2 ProteinFlow-through Fraction

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