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MS2-Affinity Purification Coupled with RNA Sequencing in Gram-Positive Bacteria
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Purification par affinité MS2 couplée au séquençage de l’ARN dans les bactéries à Gram positif

DOI:
10.3791/61731-v

•

08:34 min

•

February 23, 2021

•

, , , , ,
1Université de Strasbourg, CNRS, 2Department of Biochemistry,Université de Sherbrooke

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 01:05Bacteria Harvesting and Lysis
  • 02:52MS2-affinity Purification
  • 03:55RNA Extraction of Collected Fractions (CE, FT, W and E)
  • 05:24Results: Constructs Validation and MAPS Controls
  • 07:49Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

La technologie MAPS a été développée pour examiner le targetome d’un ARN régulateur spécifique in vivo. L’ARN d’intérêt est marqué à l’aide d’un aptamère MS2 permettant la co-purification de ses partenaires ARN et leur identification par séquençage de l’ARN. Ce protocole modifié est particulièrement adapté aux bactéries à Gram positif.

Tags

MS2-affinity PurificationRNA SequencingMAPSGram-positive BacteriaSRNARegulatory NetworksVirulence FactorsBiofilm FormationStaphylococcal InfectionsCell LysisAmylose ResinMBP-MS2 ProteinFlow-through Fraction

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