Journal
/
Genetics
/
אופטימיזציה לרצף וניתוח של הירידה FFPE-בדיקות RNA
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Optimization for Sequencing and Analysis of Degraded FFPE-RNA Samples
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

אופטימיזציה לרצף וניתוח של הירידה FFPE-בדיקות RNA

עברית

Automatically Generated

11,610 Views

•

07:30 min

•

June 08, 2020

DOI:

10.3791/61060-v

DOI:
10.3791/61060-v

•

07:30 min
June 08, 2020

•

3 Views
, , , , ,
1NCI CCR Sequencing Facility,Frederick National Laboratory for Cancer Research, 2Advanced Biomedical and Computational Sciences,Frederick National Laboratory for Cancer Research

Summary

Automatically generated

שיטה זו מתארת את השלבים כדי לשפר את האיכות והכמות של נתוני הרצף שניתן להשיג באמצעות דגימות RNA מוטבעות (FFPE) קבועות של שעווה מוטבעת של formalin. אנו מתארים את המתודולוגיה להעריך יותר במדויק את האיכות של הדגימות FFPE-RNA, להכין ספריות ברצף, ולנתח את הנתונים מ FFPE-RNA דגימות.

Explore More Videos

FFPE-RNARNA QualityRNA DegradationSample QCLibrary PreparationSequencing ProcessRNA FragmentsSequencing ReagentsFlow CellSample LibraryPhiX Control

Read Article

Cite this Article

Levin, Y., Talsania, K., Tran, B., Shetty, J., Zhao, Y., Mehta, M. Optimization for Sequencing and Analysis of Degraded FFPE-RNA Samples. J. Vis. Exp. (160), e61060, doi:10.3791/61060 (2020).

Download .ris file

Copy

Share Video

.

Copy