Journal
/
Genetics
/
Optimalisatie voor sequencing en analyse van gedegradeerde FFPE-RNA Samples
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Optimization for Sequencing and Analysis of Degraded FFPE-RNA Samples
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Optimalisatie voor sequencing en analyse van gedegradeerde FFPE-RNA Samples

Nederlands

Automatically Generated

11,611 Views

•

07:30 min

•

June 08, 2020

DOI:

10.3791/61060-v

DOI:
10.3791/61060-v

•

07:30 min
June 08, 2020

•

3 Views
, , , , ,
1NCI CCR Sequencing Facility,Frederick National Laboratory for Cancer Research, 2Advanced Biomedical and Computational Sciences,Frederick National Laboratory for Cancer Research

Summary

Automatically generated

Deze methode beschrijft de stappen om de kwaliteit en kwantiteit van sequentiegegevens te verbeteren die kunnen worden verkregen uit formeel vaste paraffine-embedded (FFPE) RNA-monsters. We beschrijven de methodologie om de kwaliteit van FFPE-RNA-monsters nauwkeuriger te beoordelen, sequencingbibliotheken voor te bereiden en de gegevens van FFPE-RNA-monsters te analyseren.

Explore More Videos

FFPE-RNARNA QualityRNA DegradationSample QCLibrary PreparationSequencing ProcessRNA FragmentsSequencing ReagentsFlow CellSample LibraryPhiX Control

Read Article

Cite this Article

Levin, Y., Talsania, K., Tran, B., Shetty, J., Zhao, Y., Mehta, M. Optimization for Sequencing and Analysis of Degraded FFPE-RNA Samples. J. Vis. Exp. (160), e61060, doi:10.3791/61060 (2020).

Download .ris file

Copy

Share Video

.

Copy