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ATAC-seq ensaio com DNA mitocondrial baixa contaminação de primária humana CD4 linfócitos T
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ATAC-seq Assay with Low Mitochondrial DNA Contamination from Primary Human CD4+ T Lymphocytes

ATAC-seq ensaio com DNA mitocondrial baixa contaminação de primária humana CD4 linfócitos T

português

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08:36 min

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March 22, 2019

DOI:

10.3791/59120-v

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10.3791/59120-v

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08:36 min
March 22, 2019

•

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, ,
1Department of Biology,Boston University, 2Department of Computer Science and Engineering,University of California San Diego, 3Bioinformatics Program,Boston University

Summary

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Aqui, apresentamos um protocolo para realizar um ensaio de cromatina transposase-acessível sequenciando (ATAC-seq) em linfócitos humanos registrados CD4 +. O protocolo foi modificado para minimizar contaminando leituras de DNA mitocondriais de 50% para 3%, através da introdução de um novo buffer de Lise.

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ATAC-seqMitochondrial DNA ContaminationCD4+ T LymphocytesCell ActivationCell SelectionCell IsolationCell CountingMagnetic BeadsCell CultureCell Stimulation

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Rickner, H. D., Niu, S., Cheng, C. S. ATAC-seq Assay with Low Mitochondrial DNA Contamination from Primary Human CD4+ T Lymphocytes. J. Vis. Exp. (145), e59120, doi:10.3791/59120 (2019).

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