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ATAC-Seq-Assay mit niedrigen mitochondriale DNA Kontamination von primären menschlichen CD4 + T-Lymphozyten
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ATAC-seq Assay with Low Mitochondrial DNA Contamination from Primary Human CD4+ T Lymphocytes
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ATAC-Seq-Assay mit niedrigen mitochondriale DNA Kontamination von primären menschlichen CD4 + T-Lymphozyten

Deutsch

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08:36 min

•

March 22, 2019

DOI:

10.3791/59120-v

DOI:
10.3791/59120-v

•

08:36 min
March 22, 2019

•

9 Views
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1Department of Biology,Boston University, 2Department of Computer Science and Engineering,University of California San Diego, 3Bioinformatics Program,Boston University

Summary

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Hier präsentieren wir ein Protokoll, um eine Probe für Transposase zugänglichen Chromatin Sequenzierung (ATAC-Seq) auf aktivierten CD4 + menschlichen Lymphozyten durchführen. Das Protokoll wurde modifiziert, um Kontamination mitochondriale DNA liest von 50 % auf 3 % durch die Einführung eines neuen Lyse-Puffers zu minimieren.

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ATAC-seqMitochondrial DNA ContaminationCD4+ T LymphocytesCell ActivationCell SelectionCell IsolationCell CountingMagnetic BeadsCell CultureCell Stimulation

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Rickner, H. D., Niu, S., Cheng, C. S. ATAC-seq Assay with Low Mitochondrial DNA Contamination from Primary Human CD4+ T Lymphocytes. J. Vis. Exp. (145), e59120, doi:10.3791/59120 (2019).

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