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ATAC-seq analisi con DNA mitocondriale bassa contaminazione da primaria umana CD4 + linfociti T
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ATAC-seq Assay with Low Mitochondrial DNA Contamination from Primary Human CD4+ T Lymphocytes
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ATAC-seq analisi con DNA mitocondriale bassa contaminazione da primaria umana CD4 + linfociti T

italiano

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08:36 min

•

March 22, 2019

DOI:

10.3791/59120-v

DOI:
10.3791/59120-v

•

08:36 min
March 22, 2019

•

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1Department of Biology,Boston University, 2Department of Computer Science and Engineering,University of California San Diego, 3Bioinformatics Program,Boston University

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Qui, presentiamo un protocollo per eseguire un test per transposase-accessibile della cromatina (ATAC-seq) la sequenziazione su linfociti CD4 + umani. Il protocollo è stato modificato per ridurre al minimo la contaminazione letture di DNA mitocondriale dal 50% al 3% attraverso l'introduzione di un nuovo buffer di lisi.

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ATAC-seqMitochondrial DNA ContaminationCD4+ T LymphocytesCell ActivationCell SelectionCell IsolationCell CountingMagnetic BeadsCell CultureCell Stimulation

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Rickner, H. D., Niu, S., Cheng, C. S. ATAC-seq Assay with Low Mitochondrial DNA Contamination from Primary Human CD4+ T Lymphocytes. J. Vis. Exp. (145), e59120, doi:10.3791/59120 (2019).

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