التفريق بين ESC يتزامن مع خلية من نوع تغييرات معينة في بنية وتركيبة لونين. الكشف عن هذه التغييرات يقدم أفكارا قيمة حول الآليات التي تحدد stemcellness وتمايز الخلايا. مناعي لونين (CHIP) يمثل قيمة لأسلوب تشريح الآليات الجزيئية الكامنة وراء تمايز الخلايا الجذعية.
تعقد الوظيفية والهيكلية لعدد لا يحصى من الخلايا في الكائنات metazoan ينشأ من عدد قليل من الخلايا الجذعية. وتتميز الخلايا الجذعية من قبل اثنين من الخصائص الأساسية : تقرير المصير ، وتجديد multipotency تسمح الخلايا الجذعية على التمايز إلى أي نوع تقريبا الخلية 1. وتتميز الخلايا الجذعية إلى خلية تقدم متباينة من فقدان التغيرات multipotency والهيكلية والبنيوية والنشاط هرمية من عوامل النسخ والجزيئات الإشارة ، أنشطتها إنشاء وصيانة الخلية من نوع معين أنماط التعبير الجيني. على المستوى الجزيئي ، وتمايز الخلايا ينطوي على تغييرات ديناميكية من هيكل وتشكيل لونين والكشف عن تلك التغيرات الدينامية يمكن أن توفر معلومات قيمة حول الميزات الفنية للخلايا الجذعية وعملية تمايز الخلايا 2،3. الكروماتين هو ضغط عالية الحمض النووي والبروتينات المعقدة التي تشكل خلايا الحمض النووي عندما حزمة الكروموسومات مع البروتينات ، histones أساسا 4. ارتبط Stemcellness وتمايز الخلايا مع وجود صفائف معينة من البروتينات التنظيمية مثل عوامل جينية ، هيستون متغيرات وعوامل النسخ 2،3،5.
الكروماتين مناعي (رقاقة) يوفر طريقة قيمة لرصد وجود الحمض النووي الريبي ، والبروتينات ، والتعديلات البروتين في لونين 6،7. ويمكن المقارنة بين لونين من أنواع مختلفة من الخلايا توضيح التغيرات الدينامية في البروتين لونين الجمعيات التي تحدث أثناء تمايز الخلايا.
مناعي لونين ينطوي على تنقية في لونين عبر ربط الجسم الحي. يتم تقليل ونين معزولة لشظايا أصغر بواسطة الهضم الأنزيمي أو القوة الميكانيكية. وعجلت به لونين شظايا الأجسام المضادة المحددة لاستهداف البروتينات أو البروتينات والحمض النووي التعديلات. تتم تنقيته من الحمض النووي الريبي أو عجل واستخدامها كنموذج لفحوصات الحمض النووي أو PCR ميكروأري القائمة. الشروط الأساسية لنجاح الشذرة هي اجسام مضادة ذات جودة عالية للمستضد المطلوب وتوافر لونين من خلايا السيطرة التي لا تعبر عن الجزيء المستهدف. ويمكن ربط الشذرة وجود البروتينات ، والبروتينات والحمض النووي الريبي التعديلات ، والحمض النووي الريبي DNA مع هدف محدد ، واعتمادا على اختيار أداة outread ، بالكشف عن ارتباط الجزيئات المستهدفة في الجينات أو هدف محدد في سياق الجينوم بأكمله. ويمكن مقارنة لتوزيع البروتينات في الخلايا لونين التفريق توضيح التغيرات الديناميكية لتكوين لونين التي تتزامن مع تطور الخلايا على طول نسب الخلية.
مناعي لونين (CHIP) تقدم تقنية قيمة للتشريح لونين المستندة إلى العمليات خلال تمايز الخلايا. الشروط الأساسية لنجاح هذه الطريقة هي أضداد جيدة وتوافر لونين من الخلايا أو الأنسجة السيطرة التي تفتقر إلى المستضد من الفائدة. ويمكن من خلال الجمع بين رقاقة مع الحمض النووي استخدموا تكنولوجيا متطورة ، وكميات هائلة من المعلومات يمكن الحصول عليها. والتحقق من النتائج الشذرة يعتمد على توافر نظم الاختبار المناسبة التي يمكن الربط بين الجمعيات الحيوية للبروتينات ، والتعديلات البروتين و / أو RNA مع تنفيذ العمليات البيولوجية أثناء تطوير الخلية.
ويدعم العمل التي قدمتها منحة (RS1 – 00477-1) من معهد كاليفورنيا للطب التجديدي (CIRM) لFS
Material Name | Type | Company | Catalogue Number | Comment |
---|---|---|---|---|
Poteinase-K | Reagent | Roche | #EO0491 | |
RNase-A | Reagent | Fermentas | #EN0531 | |
formaldehyde 37% | Reagent | EMD | FX040-13 | |
Chloroform | Reagent | EMD | 3150 | |
Ethanol | Reagent | Goldshield | ||
phenol:chloroform:isoamyl alcohol | Reagent | Invitrogen | 15593-031 | |
SA, fraction V | Reagent | EMD | 2930 | |
Dubecco’s Phosphate Buffered Saline | Reagent | Gibco | 14190 | |
HEPES | Reagent | EMD | 5330 | |
Sodium Chloride | Reagent | Fisher Scientific | S271-10 | |
EDTA | Reagent | EMD | 4050 | |
Triton X-100 | Reagent | EMD | 9410 | |
Sodium Dodecyl Sulfate | Reagent | J.T Baker | 4095-02 | |
Lithium chloride | Reagent | EMD | 5910 | |
Tris-HCl | Reagent | EMD | 9230 | |
NP-40 | Reagent | Calbiochem | 492015 | |
Deoxycholic acid, sodium salt | Reagent | Fisher Scientific | BP349-100 | |
Ammonium acetate | Reagent | Applichem | 631-61-8 | |
Glycine | Reagent | EMD | 4840 | |
Glycine | Reagent | EMD | 4840 | |
dynalbeads, protein A | Reagent | Invitrogen | 100.02D | |
dynalbeads, protein G | Reagent | Invitrogen | 100.04D | |
1.5ml Low Retention Microtubes, Xtreme | Other | Phenix Research Products | MAX-815S | |
Phase Lock Gel Light, 2.0 ml | Reagent | Eppendorf | 955154037 |