Summary

Isolement de vésicules extracellulaires à faible teneur en endotoxines dérivées de lignées cellulaires cancéreuses

Published: February 17, 2023
doi:

Summary

Le protocole proposé comprend des lignes directrices sur la façon d’éviter la contamination par l’endotoxine lors de l’isolement des vésicules extracellulaires à partir de surnageants de culture cellulaire, et sur la façon de les évaluer correctement.

Abstract

Les vésicules extracellulaires (VE) sont une population hétérogène de vésicules membranaires libérées par les cellules in vitro et in vivo. Leur omniprésence et leur rôle important en tant que porteurs d’informations biologiques en font des objets d’étude intrigants, nécessitant des protocoles fiables et répétitifs pour leur isolement. Cependant, il est difficile de réaliser leur plein potentiel car il existe encore de nombreux obstacles techniques liés à leur recherche (comme une acquisition appropriée). Cette étude présente un protocole pour l’isolement de petits VE (selon la nomenclature MISEV 2018) à partir du surnageant de culture de lignées cellulaires tumorales basé sur la centrifugation différentielle. Le protocole comprend des lignes directrices sur la façon d’éviter la contamination par des endotoxines pendant l’isolement des VE et sur la façon de les évaluer correctement. La contamination par les endotoxines des véhicules électriques peut entraver considérablement les expériences ultérieures ou même masquer leurs véritables effets biologiques. D’autre part, la présence négligée d’endotoxines peut conduire à des conclusions incorrectes. Ceci est particulièrement important lorsqu’il s’agit de cellules du système immunitaire, y compris les monocytes, car les monocytes constituent une population particulièrement sensible aux résidus d’endotoxines. Par conséquent, il est fortement recommandé de dépister la contamination par les endotoxines des VE, en particulier lorsque vous travaillez avec des cellules sensibles aux endotoxines telles que les monocytes, les macrophages, les cellules suppressives dérivées de myéloïdes ou les cellules dendritiques.

Introduction

Les vésicules extracellulaires (VE), selon la nomenclature MISEV 2018, sont un terme collectif décrivant divers sous-types de vésicules membraneuses sécrétées par des cellules qui jouent un rôle crucial dans de nombreux processus physiologiques et pathologiques 1,2. De plus, les véhicules électriques sont prometteurs en tant que nouveaux biomarqueurs pour diverses maladies, ainsi qu’en tant qu’agents thérapeutiques et véhicules d’administration de médicaments. Cependant, la réalisation de leur plein potentiel est difficile car il existe encore de nombreux obstacles techniques liés à leur acquisition3. L’un de ces défis est l’isolement des véhicules électriques exempts d’endotoxines, qui a été négligé dans de nombreux cas. L’une des endotoxines les plus courantes est le lipopolysaccharide (LPS), qui est un composant majeur des parois cellulaires bactériennes à Gram négatif et peut provoquer une réponse inflammatoire aiguë, en raison de la libération d’un grand nombre de cytokines inflammatoires par diverses cellules 4,5. Le LPS induit une réponse en se liant à la protéine de liaison LPS, suivie d’une interaction avec le complexe CD14/TLR4/MD2 sur les cellules myéloïdes. Cette interaction conduit à l’activation des voies de signalisation dépendantes de MyD88 et TRIF, qui à son tour déclenche le facteur nucléaire kappa B (NFkB). La translocation de NFkB vers le noyau initie la production de cytokines6. Les monocytes et les macrophages sont très sensibles au LPS, et leur exposition au LPS entraîne la libération de cytokines et de chimiokines inflammatoires (p. ex. IL-6, IL-12, CXCL8 et TNF-α)7,8. La structure CD14 permet la liaison de différentes espèces de LPS ayant une affinité similaire et sert de corécepteur pour d’autres récepteurs de type Toll (TLR) (TLR1, 2, 3, 4, 6, 7 et 9)6. Le nombre d’études menées sur les effets des VE sur les monocytes/macrophages continue d’augmenter 9,10,11. Surtout du point de vue de l’étude des fonctions des monocytes, de leurs sous-populations et d’autres cellules immunitaires, la présence d’endotoxines et même leur présence masquée dans les VE est d’une grande importance12. La contamination négligée des VE par des endotoxines peut conduire à des conclusions trompeuses et cacher leur véritable activité biologique. En d’autres termes, travailler avec des cellules monocytaires nécessite de faire confiance à l’absence de contamination par les endotoxines13. Les sources potentielles d’endotoxines peuvent être l’eau, les milieux et sérums obtenus commercialement, les composants et additifs de médias, la verrerie de laboratoire et la vaisselle en plastique 5,14,15.

Par conséquent, cette étude visait à développer un protocole pour l’isolement des VE à faible teneur en endotoxines. Le protocole fournit des conseils simples sur la façon d’éviter la contamination par les endotoxines pendant l’isolement des VE au lieu d’éliminer les endotoxines des VE. Auparavant, de nombreux protocoles ont été présentés sur la façon d’éliminer les endotoxines, par exemple des nanoparticules modifiées utilisées en nanomédecine; cependant, aucun d’entre eux n’est utile pour les structures biologiques telles que les véhicules électriques. La dépyrogénation efficace des nanoparticules peut être réalisée par rinçage à l’éthanol ou à l’acide acétique, chauffage à 175 °C pendant 3 h, irradiation γ ou traitement au triton X-100; cependant, ces procédures conduisent à la destruction des VE16,17.

Le protocole présenté est une étude pionnière axée sur l’évitement des impuretés endotoxines dans les VE, contrairement aux études précédentes sur l’effet des VE sur les monocytes9. L’application des principes proposés à la pratique de laboratoire peut aider à obtenir des résultats de recherche fiables, ce qui peut être crucial lors de l’examen de l’utilisation potentielle des VE comme agents thérapeutiques en clinique12.

Protocol

1. Préparation des tubes à ultracentrifugation Utilisez des tubes stériles à usage unique. Si cela n’est pas possible, réutilisez les tubes à ultracentrifugation après les avoir lavés avec un détergent à l’aide d’une pipette Pasteur stérile ou d’autres applicateurs à usage unique. Rappelez-vous que les tubes à ultracentrifugation doivent être dédiés à un type de matériau centrifugé (surnageant de culture cellulaire / sérum / plasma) et à une espèce (homme / souris …

Representative Results

Une étape préalable ou obligatoire pour ce protocole est l’exclusion d’une éventuelle contamination par les endotoxines par les réactifs. Tous les réactifs utilisés, tels que les tubes FBS, DMEM, RPMI, PBS et même les tubes à ultracentrifugeuses, doivent être exempts d’endotoxines (<0,005 EU/mL). Il n’est pas facile de maintenir le régime d’absence de contamination par les endotoxines car, par exemple, le sérum régulier/standard pour la culture cellulaire peut être sa riche source (0,364 EU/ml ; vo…

Discussion

Au cours des dernières années, les méthodes d’isolation correcte des véhicules électriques sont devenues de plus en plus importantes, permettant leurs analyses plus fiables, par exemple dans le contexte de l’obtention de données omiques et fonctionnelles fiables24. Sur la base de l’expérience de recherche antérieure, il semble que non seulement le type de méthode d’isolement, mais aussi d’autres conditions au cours de cette procédure peuvent être importants. L’utilisation de…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Ce travail a été soutenu par le Centre national des sciences, Pologne, numéro de subvention 2019/33/B/NZ5/00647. Nous tenons à remercier le professeur Tomasz Gosiewski et Agnieszka Krawczyk du département de microbiologie médicale moléculaire du Collège médical de l’Université Jagellonne pour leur aide inestimable dans la détection de l’ADN bactérien dans les véhicules électriques.

Materials

 Alix (3A9) Mouse mAb  Cell Signaling Technology 2171
1250ul Filter Universal Pipette Tips, Clear, Polypropylene, Non-Pyrogenic GoogLab Scientific GBFT1250-R-NS
BD FACSCanto II Flow Cytometr BD Biosciences
CBA Human Th1/Th2 Cytokine Kit II BD Biosciences 551809
CD9 (D8O1A) Rabbit mAb Cell Signaling Technology 13174
ChemiDoc Imaging System Bio-Rad Laboratories, Inc.  17001401
DMEM (Dulbecco’s Modified Eagle’s Medium)  Corning 10-013-CV
ELX800NB, Universal Microplate Reader BIO-TEK INSTRUMENTS, INC
Fetal Bovine Serum Gibco 16000044
Fetal Bovine Serum South America Ultra Low Endotoxin  Biowest  S1860-500
Gentamicin, 50 mg/mL  PAN – Biotech P06-13100
Goat anti-Mouse IgG- HRP Santa Cruz Biotechnology sc-2004
Goat anti-Rabbit IgG- HRP Santa Cruz Biotechnology sc-2005
Immun-Blot PVDF Membrane Bio-Rad Laboratories, Inc.  1620177
LPS from Salmonella abortus equi S-form (TLRGRADE)  Enzo Life Sciences, Inc. ALX-581-009-L002
Mini Trans-Blot Electrophoretic Transfer Cell Bio-Rad Laboratories, Inc.  1703930
Nanoparticle Tracking Analysis  Malvern Instruments Ltd
NuPAGE LDS Sample Buffer (4X)  Invitrogen  NP0007
NuPAGE Sample Reducing Agent (10x)  Invitrogen NP0004
Parafilm Sigma Aldrich P7793 transparent film
Perfect 100-1000 bp DNA Ladder EURx E3141-01 
PierceTM Chromogenic Endotoxin Quant Kit Thermo Scientific A39552
PP Oak Ridge Tube with sealing caps Thermo Scientific 3929, 03613
RPMI 1640 RPMI-1640 (Gibco) 11875093
SimpliAmp Thermal Cycler Applied Biosystem A24811
Sorvall wX+ ULTRA SERIES Centrifuge with T-1270 rotor Thermo Scientific 75000100
Sub-Cell GT Horizontal Electrophoresis System Bio-Rad Laboratories, Inc.  1704401
SuperSignal West Pico PLUS Chemiluminescent Substrate Thermo Scientific 34577
SW480 cell line American Type Culture Collection(ATCC)
SW480 cell line American Type Culture Collection (ATCC)
Syringe filter 0.22 um TPP 99722
Trans-Blot SD Semi-Dry Transfer Cell Bio-Rad Laboratories, Inc.  1703940 Transfer machine
Transfer pipette, 3.5 mL SARSTEDT 86.1171.001

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Cite This Article
Babula, A., Siemińska, I., Baj-Krzyworzeka, M. Isolation of Low Endotoxin Content Extracellular Vesicles Derived from Cancer Cell Lines. J. Vis. Exp. (192), e65062, doi:10.3791/65062 (2023).

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