Спасение полипа — это процесс, вызванный острым стрессом, при котором коралловые полипы переваривают ткань, соединяющую их с их колонией, и отделяются от нее, чтобы жить как индивидуумы. В настоящем протоколе описывается, как вызвать микроразмножение кораллов путем спасения с использованием гиперсолевых или безкальцевых обработок морской воды.
Кораллы — это колониальные животные, образованные модульными единицами, называемыми полипами. Коралловые полипы физиологически связаны и соединены тканью. Феномен спасения полипа — это процесс, вызванный острым стрессом, при котором коралловые полипы переваривают ткань, соединяющую их с остальной частью колонии, и в конечном итоге отделяются от скелета, чтобы продолжать жить как отдельные особи. Коралловые биологи признавали процесс спасения полипа в течение многих лет, но только недавно микрораспространения, генерируемые этим процессом, были признаны модельной системой для исследований биологии кораллов. Использование спасения полипа может создать большое количество клональных единиц из одного фрагмента коралла. Еще одно преимущество заключается в том, что отдельные полипы или участки полипов могут быть легко визуализированы под микроскопом и поддерживаться в высоко стандартизированных недорогих средах, таких как чашки Петри, колбы и микрофлюидные чипы. Настоящий протокол демонстрирует воспроизводимые методы, способные индуцировать микроразмножение кораллов, и различные подходы к поддержанию жизни одиночных полипов в долгосрочной перспективе. Эта методология была способна успешно культивировать полипы коралловых видов Pocillopora verrucosa в течение 8 недель после спасения, демонстрируя практичность использования отдельных коралловых полипов для исследования кораллов.
Склерактинские или рифообразующие кораллы являются книдариями, способными образовывать карбонатные скелеты, создавая рифы и структурно сложные экосистемы, которые можно найти от глубокой до мелководной среды1. Тропические коралловые рифы обладают высоким биоразнообразием и обеспечивают основные экосистемные услуги, такие как защита прибрежных районов и поддержание рыболовства2. Большинство мелководных рифообразующих кораллов полагаются на взаимные отношения с водорослями семейства Symbiodiniaceae, которые обеспечивают энергию, необходимую кораллам для построения своих скелетов. Симбиоз между кораллами и водорослями может быть нарушен экологическим стрессом, вызывая обесцвечивание кораллов 3,4,5,6. Недавние температурные аномалии вызвали крупные события обесцвечивания кораллов во всем мире, что привело к массовой гибели кораллов и постоянной деградации рифов 7,8,9,10,11. Поскольку это явление основано на изгнании симбионтов клеточными механизмами, связанными с посттемпературным стрессом, такими как апоптоз, аутофагия и экзоцитоз, обесцвечивание кораллов можно описать как клеточный процесс, который имеет последствия экосистемного масштаба 5,6,12, что означает, что наличие культур коралловых клеток или тканей in vitro было бы применимо для тщательного изучения этого явления.
Из-за важности коралловых рифов и основных угроз, с которыми они сталкиваются, особенно в последние два десятилетия2, кораллы стали центром исследований в целях защиты и восстановления во всем мире13. Тем не менее, разработка подходов и экспериментальных систем, которые являются надежными, воспроизводимыми и предлагают минимальное воздействие на окружающую среду для изучения кораллов, является серьезной борьбой в этой области.
Микроразмножение определяется как пролиферация генотипа организма in vitro путем культивирования его биологического материала в контролируемых сосудах14,15. Культивирование клеток, тканей и органов имеет решающее значение для биологии растений и животных в последние десятилетия. Это позволяет массово воспроизводить организмы в лабораториях, быстро оценивать различные методы лечения (такие как лекарства и фармацевтические препараты) и непосредственно изучать функцию клеток 14,15,16,17. В целом, модели in vitro были полезны для дополнения и углубления исследований различных организмов в лучше контролируемых физических и химических условиях. Благодаря преимуществам методов культивирования in vitro, различные технологии культивирования клеток и тканей животных были разработаны, оптимизированы и использованы в качестве важных инструментов во многих областях исследований, где несколько клеточных линий были изучены и коммерциализированы для многочисленных применений 16,17,18.
Многие достижения в знаниях о клеточной и тканевой культуре были сделаны с момента первой культуры тканей животных в 1882году 17, такие как использование природных и синтетических сред, изобретение установленных клеточных линий и разработка 3D-сред для лучшего культивирования множества типов клеток16,17, 18,19. Тем не менее, область клеточной биологии в основном сосредоточена на избранной группе модельных организмов, в то время как многие таксоны все еще не имеют хорошо зарекомендовавших себя культур in vitro клеток, тканей или органов20. Например, в исследованиях кораллов ни одна увековеченная клеточная линия не была широко использована для исследований, ограничивая исследования коралловых клеток использованием первичных клеточных культур. Эти культуры имеют жизнеспособность, ограниченную несколькими неделями21, без исследований, регистрирующих выживаемость отдельных клеток из всех коралловых тканей в течение более 13 дней до начала 2021года 22. Первый отчет об устойчивых коралловых клеточных линиях, который будет опубликован, был с клетками Acropora tenuis, которые жили до 6 месяцев, и полезность этих клеток для будущих исследований еще предстоит изучить23.
Чтобы преодолеть ограничения в культивировании культур коралловых клеток и поддерживать лабораторную культуру, которая сохраняет общую организацию тканей кораллов, использование изолированных полипов недавно было предложено в качестве модели для исследований в области биологии кораллов24,25. Полипы являются анатомическими единицами кораллов, и каждый из них имеет рот, расположенный в центре их ротового диска и соединенный с другими полипами ценозарком в его аборальной области26. Разделение живых полипов происходит естественным образом путем процесса спасения полипа, при котором острый стресс вызывает переваривание ценозарка между полипами, который затем может отделиться от скелета колонии 25,27,28. Сообщалось, что это явление встречается у различных таксонов, включая октокоралов 29,30,31, черных кораллов 32 и склерактиновых кораллов 25,27,28,32,33, и было связано с многочисленными экологическими стрессорами, такими как недостаток кальция в воде 24,34, повышенная кислотность35, гиперосмотические состояния 25,27,32,36, высокие температуры 36,37, голодание33, воздействие воздуха25,30 и инсектицидное загрязнение28,38. Спасение полипа было, например, зарегистрировано в поциллопоридных кораллах19, которые широко распространены по всему миру и обычно используются в качестве моделей в исследованиях кораллов. Виды, принадлежащие к этой группе, такие как Pocillopora damicornis и Styllophora pistillata, произвели примерно 30-40 микропропагатов из 5-миллиметрового фрагмента25. Это число подчеркивает преимущество использования выручивания полипа в качестве метода микроразмножения кораллов, поскольку оно создает возможность генерации многих генетически идентичных особей из небольшого кусочка коралла. Использование изолированных полипов для исследований также имеет те же преимущества, что и клеточные культуры в отношении возможности культивирования в контролируемых лабораторных средах, таких как колбы и чашки Петри. Кроме того, микрофлюидные платформы для поддержания живых полипов продемонстрировали, что эти микрораспропагаты могут храниться в относительно дешевых и легко воспроизводимых средах с контролируемым потоком воды, поверхностью и температурой 24,25. Эти микрофлюидные платформы также могут быть использованы для визуализации живых коралловых структур под микроскопом непосредственно24,25.
В настоящей статье мы обобщаем и демонстрируем методы, которые были разработаны для выделения отдельных коралловых полипов из их колоний, показывая, как поддерживать их в лабораторных условиях для долгосрочной культуры. Обсуждаемые методы включают спасение полипа в гиперосмотических условиях путем испарения и перекачки морской воды с высокой соленостью и инкубации в морской воде без кальция.
Выживаемость полипов после того, как они были подвергнуты процессам спасения, и время, необходимое для завершения процесса, варьируются среди ранее сообщенных исследований 25,33,41, что, возможно, объясняется различными экспериментальными подходами, применяемыми в каждом исследовании. Например, различные виды кораллов или даже кораллы одного и того же вида, но акклиматизированные к различным условиям окружающей среды (например, кораллы из Красного моря), имеют разные пороговые значения для уровней солености. Выбранный метод спасения и лабораторные / аквариумные условия также играют важную роль в результатах. В некоторых случаях поддержание микрораспространения кораллов в лабораторных условиях превзошло время выживания культур коралловых клеток, достигнув месяцев выживания у азооксантеллата3 3,41 и зооксантеллата25 кораллов. Время завершения процесса спасения полипа также варьировалось в различных исследованиях, варьируясь от нескольких часов2 5,2 7,30 донедель 35 инкубации, подвергшейся воздействию стрессора, ответственного за спасение. Другой переменной, которую следует учитывать при изучении спасения полипа, является восстановление полипов после воздействия острого стресса, который вызвал их высвобождение. До сих пор спорно, находятся ли полипы после спасения в достаточно хорошем состоянии, чтобы их можно было использовать в качестве моделей для изучения биологии кораллов. Восстановление их тканей после деградации ценозарка вызывает беспокойство при использовании этих микропропагатов. Тем не менее, полипы во многих исследованиях, включая настоящие, смогли представить клетки зооксантелл внутри своих тканей и внешних морфологий с интактной орально-аборальной поляризацией и щупальцами через несколько недель после спасения 25,27,32,36. Предыдущие исследования также показали, что после освобождения от острого стресса высвобождаемые коралловые полипы, подвергшиеся воздействию сильно соленой или нагретой морской воды, смогли восстановить экспрессию генов, связанных с такими процессами, как апоптоз, протеолиз и деление клеток до уровней, аналогичных тем, которые были обнаружены до спасения32,36, и даже увеличить экспрессию генов, связанных с заживлениемтканей 36.
Что касается разницы в выживаемости между методами, важно подчеркнуть, что это время может варьироваться между различными экспериментами, даже если используются одни и те же методы, и это может быть связано со здоровьем используемых фрагментов и правильным поддержанием полипов после процесса спасения. В случае спасения через инкубацию морской воды без кальция выживаемость полипа была ограничена 1 днем. Таким образом, можно сделать вывод, что метод не очень хорошо подходит для длительного выживания исследуемого вида, либо должна быть произведена лучшая адаптация методики для кораллов P. verrucosa из Красного моря. Представленные результаты показали, что более длительное время выживания было получено с помощью методов, основанных на постепенном увеличении солености, когда полипы подвергались капанию воды с высокой соленостью. Этот метод может обеспечить более контролируемое увеличение солености, чем метод испарения, в то же время не отвечая за увеличение концентрации других веществ, обнаруженных в морской воде, включая метаболические отходы кораллов, которые потенциально токсичны для организма. По всем этим причинам этот метод был предложен в качестве более безопасной альтернативы для поддержания здоровых полипов27. Хотя предполагается, что этот метод более безопасен для здоровья полипов и способен производить полипы, которые живут дольше, факт, который был подтвержден в этой текущей публикации, для его подтверждения необходимы дополнительные обследования. Оба эксперимента с высокой соленостью, вызванные спасением, продемонстрировали полное отделение полипов после того, как соленость достигла 59 ПГУ за 24 часа. Если соленость увеличивается выше уровня, на котором спасение завершено, дальнейший стресс будет вызван полипами, уменьшая их шансы на выживание и восстановление после лечения острого стресса. Поэтому не рекомендуется дольше поддерживать полипы при таких уровнях солености. При выполнении метода индукции спасения путем воздействия морской воды без кальция была получена полная отслойка от 3-часовой инкубации в искусственной морской воде без кальция, что означает, что дальнейшее воздействие этой среды также не рекомендуется.
Чтобы рассмотреть методы, которые были более адекватными для изучения коралловых полипов в лабораторных / экстракорпоральных исследованиях, это исследование было сосредоточено только на трех процедурах, которые заняли около 24 часов для завершения процесса спасения и использовались в исследованиях, которые включали долгосрочное поддержание коралловых полипов из склерактиновых кораллов. Другие методы, которые, как сообщается, занимают значительно больше времени, чем в это время, не были задействованы. Поселение полипов в подложку не было предпринято в этом исследовании, которое было сосредоточено на производстве полипов, которые могут быть перенесены в различные среды или легко собраны для анализа с использованием одноразовых пипеток. Результаты показывают, что полипы кораллового вида P. verrucosa поддерживались живыми с ассоциированными клетками зооксантелл, здоровым визуальным статусом и сохраненной грубой внешней анатомической структурой в течение 8 недель, даже без прикрепления к субстрату. Эти результаты показывают, что больше биологических реплик может быть получено из отдельных фрагментов кораллов с использованием некоторых методов, продемонстрированных в этом исследовании. Такие биологические реплики могут храниться в контролируемых средах (таких как чашки Петри и клеточные колбы) и поддерживаться в лабораторных условиях для месячных экспериментов и использоваться для нескольких целей.
Со времени первых случайных описаний спасения полипа 42,43 были созданы новые протоколы для поиска более стандартизированных методов индуцирования высвобождения полипа и поддержания таких полипов живыми, которые могут быть использованы для будущих исследовательских приложений. К ним относятся исследование различных аспектов, связанных с физиологией кораллового холобиона44 и взаимодействиями хозяина и микробиома45, молекулярных механизмов, участвующих в обесцвечивании кораллов 5,25, и здоровья, устойчивости и защиты кораллового холобиона 12,13,46,47 . Кроме того, выпущенные коралловые полипы могут быть использованы для приложений за пределами сферы исследований и были предложены для создания пропагул, которые могут прикрепляться к субстрату и расти, потенциально создавая несколько коралловых особей, которые могут быть использованы в целях восстановления, как только стандартизированные протоколы для спасения станут широко распространенными28 . В целом, хотя для стандартизации методологии следует проводить более углубленные эксперименты с использованием спасенных полипов, было показано, что спасение полипа является воспроизводимым подходом, который может быть применен в качестве инструмента в исследованиях кораллов для нескольких целей.
The authors have nothing to disclose.
Мы благодарим Адама Барно и Франциску Гарсию за их поддержку в экспериментах и мониторинге коралловых полипов. Мы также благодарим KAUST Coastal & Marine Resources Core Lab за помощь в обслуживании аквариумов и инфраструктуре. Исследование финансировалось за счет гранта KAUST No BAS/1/1095-01-01.
5560 Conductivity/Temperature Probe | YSI | 5560 | Conductivity probe used with the ProQuatro Multiparameter meter |
Ace 5 in. Alloy Steel Diagonal Pliers | Ace Hardware | 2004083 | Used to cut coral fragments |
Ampicillin sodium salt | Sigma-Aldrich | A9518 | Used in DMEM medium. |
DMEM (1x) Dulbecco's Modified Eagle Medium | Gibco | 41965-039 | Used for incubating coral fragments in the calcium-free polyp bail-out method |
Fisherbrand Petri Dish, Stackable Lid 60 mm x 15 mm Sterile, Polystyrene | Thermo Fisher Scientific | FB0875713A | Petri dish used for bail-out by evaporstion and for keeping polyps inside an aquarium. |
Heizer Titanrohr Heizstab SW MW 600 Watt | Schego | 548 | Heaters used in aquarium |
Leica Application Suite Version 4.2 | Leica Microsystems | NA | Software used for image capture in demonstrative results |
Leica IC80 HD | Leica Microsystems | 12730216 | Camera used to take demonstrative results pictures |
Leica MDG33 | Leica Microsystems | 10 450 123 | Stereoscope stand used to take demonstrative results pictures |
Leica Z6 APO | Leica Microsystems | NA | Macroscope used to take demonstrative results pictures |
Magnesium Chloride | Thermo Fisher Scientific | 7487-88-9 | Used for preparing calcium-free artificial seawater. |
Magnesium Sulfate Anhydrous | Sigma-Aldrich | 7791-18-6 | Used for preparing calcium-free artificial seawater. |
Masterflex I/P Easy-Load Pump Head for Precision Tubing, White PPS Housing, SS Rotor | Masterflex | HV-77602-10 | Peristaltic pump head. |
Masterflex L/S Precision Modular Drives with Benchtop Controller | Masterflex | EW-07557-00 | Peristaltic pump drive used for pumping high salinity seawater. Can be substituted for any peristaltic pump capable of mainaining water flow as described in protocol. |
Masterflex L/S Precision Pump Tubing, Platinum-Cured Silicone, L/S 16; 25 ft | Masterflex | HV-96410-16 | Tubing for peristaltic pump. |
Millex 33 mm PVDF 0.22 µm Sterile RUO | Sigma-Aldrich | SLGVR33RS | Used to filter artificial sea water. |
Nunc EasYFlask 75 cm2 Nunclon Delta Surface | Thermo Fisher Scientific | 156499 | Flask usually used for cell culture used for polyp culture. |
Orbital shaker, Advanced 5000, VWR | VWR | 444-2916 | Shaker used inside incubator. |
Percival Incubator – I-22VL | Percival | NA | Incubator used for maintaing corals kept in cell flasks. |
Plankton net 200 µm mesh size | KC Denmark | NA | Used for covering petri dishes containing coral polyps. |
Potassium Chloride | VWR Chemicals | 7447-40-7 | Used for preparing calcium-free artificial seawater. |
ProQuatro Multiparameter Meter | YSI | 606950 | Used for measuring salinity thoughout the protocol |
RADION XR15 G5 PRO | Ecotech | NA | Lights used in aquarium |
Red Sea Salt Premium grade, moderate Alkalinity |
Red Sea | NA | Used to prepare 40 PSU artifical sea water. |
Sodium Bicarbonate | Sigma-Aldrich | 144-55-8 | Used for preparing calcium-free artificial seawater. |
Sodium Chloride | Sigma-Aldrich | S3014 | Used for preparing calcium-free artificial seawater. |
Sodium Sulfate Anhydrous | VWR Chemicals | 7757-82-6 | Used for preparing calcium-free artificial seawater. |
TRD 112 thermostat | Schego | NA | Thermostat used in aquarium |
Turbelle Nanostream 6025 | Tunze | 6025 000 | Pumps used in aquarium |