Le renflouement des polypes est un processus induit par un stress aigu, dans lequel les polypes coralliens digèrent le tissu les reliant à leur colonie et s’en détachent pour vivre en tant qu’individus. Le présent protocole décrit comment induire la micropropagation des coraux par renflouement à l’aide de traitements à l’eau de mer hypersaline ou sans calcium.
Les coraux sont des animaux coloniaux formés par des unités modulaires appelées polypes. Les polypes coralliens sont physiologiquement liés et reliés par les tissus. Le phénomène de renflouement des polypes est un processus induit par un stress aigu, dans lequel les polypes coralliens digèrent le tissu les reliant au reste de la colonie et se détachent finalement du squelette pour continuer à vivre en tant qu’individus séparés. Les biologistes coralliens reconnaissent le processus de sauvetage des polypes depuis des années, mais ce n’est que récemment que les micropropagates générées par ce processus ont été reconnues comme un système modèle pour les études de biologie corallienne. L’utilisation du renflouement des polypes peut créer un grand nombre d’unités clonales à partir d’un seul fragment de corail. Un autre avantage est que les polypes simples ou les plaques de polypes peuvent être facilement visualisés au microscope et maintenus dans des environnements hautement standardisés à faible coût tels que les boîtes de Pétri, les flacons et les puces microfluidiques. Le présent protocole démontre des méthodes reproductibles capables d’induire la micropropagation des coraux et différentes approches pour maintenir les polypes uniques en vie à long terme. Cette méthodologie a permis de cultiver avec succès des polypes de l’espèce de corail Pocillopora verrucosa jusqu’à 8 semaines après le sauvetage, démontrant l’aspect pratique de l’utilisation de polypes coralliens individuels pour la recherche sur les coraux.
Les coraux scléractiniens ou bâtisseurs de récifs sont des cnidaires capables de former des squelettes carbonatés, de créer des récifs et des écosystèmes structurellement complexes que l’on peut trouver dans des environnements d’eau profonde à peu profonde1. Les récifs coralliens tropicaux abritent une grande biodiversité et fournissent des services écosystémiques essentiels, tels que la protection des côtes et le maintien des pêches2. La plupart des coraux de construction de récifs en eau peu profonde reposent sur une relation mutualiste avec les algues de la famille des Symbiodiniaceae, qui fournissent l’énergie dont les coraux ont besoin pour construire leur squelette. La symbiose entre le corail et les algues peut être brisée par le stress environnemental, provoquant le blanchissement des coraux 3,4,5,6. Les anomalies de température récentes ont provoqué d’importants événements de blanchissement des coraux dans le monde entier, entraînant une mortalité massive des coraux et une dégradation permanente des récifs 7,8,9,10,11. Comme ce phénomène est basé sur l’expulsion des symbiotes par des mécanismes cellulaires post-stress thermique, tels que l’apoptose, l’autophagie et l’exocytose, le blanchiment des coraux peut être décrit comme un processus cellulaire qui a des conséquences à l’échelle de l’écosystème 5,6,12, ce qui signifie qu’avoir des cultures in vitro de cellules ou de tissus coralliens serait applicable pour étudier ce phénomène de près.
En raison de l’importance des récifs coralliens et des principales menaces auxquelles ils ont été confrontés, en particulier au cours des deux dernières décennies2, les coraux sont devenus le centre de la recherche à des fins de protection et de restauration dans le monde entier13. Cependant, le développement d’approches et de systèmes expérimentaux fiables, reproductibles et offrant un impact environnemental minimal pour étudier les coraux est une lutte majeure dans ce domaine.
La micropropagation est définie comme la prolifération in vitro du génotype d’un organisme en cultivant son matériel biologique dans des vaisseaux contrôlés14,15. La culture de cellules, de tissus et d’organes a été cruciale pour la biologie végétale et animale au cours des dernières décennies. Il permet la reproduction de masse des organismes en laboratoire, l’évaluation rapide de différents traitements (tels que les médicaments et les produits pharmaceutiques) et l’étude directe de la fonction cellulaire 14,15,16,17. En général, les modèles in vitro ont été utiles pour compléter et approfondir les études de différents organismes dans des conditions physiques et chimiques mieux contrôlées. En raison des avantages des techniques de culture in vitro, différentes technologies de culture de cellules et de tissus animaux ont été développées, optimisées et utilisées comme outils importants dans de nombreux domaines de recherche, où plusieurs lignées cellulaires ont été étudiées et commercialisées pour de nombreuses applications 16,17,18.
De nombreux progrès dans la connaissance de la culture cellulaire et tissulaire ont été réalisés depuis la première culture de tissus animaux en 188217, tels que l’utilisation de milieux naturels et synthétiques, l’invention de lignées cellulaires établies et le développement de milieux 3D pour cultiver une multitude de types de cellules d’une meilleure manière16,17, 18,19. Cependant, le domaine de la biologie cellulaire s’est principalement concentré sur un groupe restreint d’organismes modèles, alors que de nombreux taxons n’ont toujours pas de cultures in vitro bien établies de cellules, de tissus ou d’organes20. Par exemple, dans la recherche sur les coraux, aucune lignée cellulaire immortalisée n’a été largement utilisée pour la recherche, ce qui limite la recherche sur les cellules coralliennes à l’utilisation de cultures cellulaires primaires. La viabilité de ces cultures est limitée à quelques semaines21, aucune étude n’enregistrant la survie des cellules individuelles de tous les tissus coralliens pendant plus de 13 jours jusqu’au début de 202122. Le premier rapport sur les lignées cellulaires coralliennes durables à être publié concernait des cellules Acropora tenuis qui ont vécu jusqu’à 6 mois, et l’utilité de ces cellules pour les recherches futures reste à explorer23.
Pour surmonter les limites de la culture de cellules coralliennes et maintenir une culture en laboratoire qui préserve l’organisation tissulaire globale des coraux, l’utilisation de polypes isolés a récemment été proposée comme modèle pour la recherche en biologie des coraux24,25. Les polypes sont les unités anatomiques des coraux, et chacun d’eux a une bouche située au centre de leur disque buccal et est relié à d’autres polypes par le coénosarc dans sa région aborale26. La séparation des polypes vivants se produit naturellement par le processus de sauvetage des polypes, dans lequel un stress aigu provoque la digestion du cénosarc entre les polypes, qui peut alors se détacher du squelette de la colonie 25,27,28. Ce phénomène a été signalé dans une variété de taxons, y compris les octocoraux 29,30,31, les coraux noirs32 et les coraux scléractiniens25,27,28,32,33, et a été lié à de multiples facteurs de stress environnementaux, tels que le manque de calcium dans l’eau24,34, l’augmentation de l’acidité 35, conditions hyperosmotiques 25,27,32,36, températures élevées 36,37, famine33, exposition à l’air25,30 et contamination par lesinsecticides 28,38. Le renflouement des polypes a été, par exemple, signalé dans les coraux pocilloporides19, qui sont largement distribués dans le monde entier et sont couramment utilisés comme modèles dans la recherche sur les coraux. Des espèces appartenant à ce groupe, telles que Pocillopora damicornis et Styllophora pistillata, ont généré environ 30 à 40 micropropagués à partir d’un fragment de 5 mm25. Ce nombre souligne l’avantage d’utiliser le renflouement des polypes comme méthode de micropropagation des coraux, car il crée la possibilité de générer de nombreux individus génétiquement identiques à partir d’un petit morceau de corail. L’utilisation de polypes isolés pour la recherche présente également les mêmes avantages que les cultures cellulaires en ce qui concerne la possibilité d’être cultivés dans des environnements de laboratoire contrôlés, tels que des flacons et des boîtes de Pétri. De plus, les plates-formes microfluidiques pour maintenir les polypes vivants ont démontré que ces micropropagués peuvent être conservés dans des environnements relativement bon marché et faciles à reproduire, avec un débit d’eau, une surface et une température contrôlésde 24,25. Ces plates-formes microfluidiques peuvent également être utilisées pour visualiser directement au microscope24,25.
Dans le présent article, nous résumons et démontrons les techniques qui ont été développées pour isoler les polypes coralliens individuels de leurs colonies, montrant comment les maintenir dans des conditions de laboratoire pour une culture à long terme. Les méthodes discutées comprennent le sauvetage des polypes par des conditions hyperosmotiques par évaporation et pompage d’eau de mer à haute salinité et l’incubation dans de l’eau de mer sans calcium.
Le taux de survie des polypes après avoir été soumis à des processus de sauvetage et le temps nécessaire pour que le processus soit terminé varient parmi les recherches précédemment rapportées 25,33,41, ce qui s’explique peut-être par les différentes approches expérimentales appliquées dans chaque étude. Par exemple, différentes espèces de coraux, ou même des coraux de la même espèce mais acclimatés à des conditions environnementales différentes (par exemple, des coraux de la mer Rouge), présentent des seuils différents pour les niveaux de salinité. La méthode de renflouement choisie et les conditions de laboratoire / aquarium jouent également un rôle important dans les résultats. Dans certains cas, le maintien des micropropagates coralliens dans des conditions de laboratoire a dépassé le temps de survie des cultures de cellules coralliennes en atteignant des mois de survie dans les coraux azooxanthellate 3 3,41 et zooxanthellate25. Le temps nécessaire pour que le processus de sauvetage des polypes soit terminé a également varié dans différentes études, allant de quelques heures2 5,2 7,30 à des semaines35 d’incubation exposées au facteur de stress responsable du renflouement. Une autre variable à prendre en compte lors de l’étude du renflouement des polypes est la récupération des polypes après une exposition au stress aigu qui a déclenché leur libération. Il est encore discutable si les polypes après le renflouement sont dans un état suffisant pour être utilisés comme modèles pour étudier la biologie corallienne. La récupération de leurs tissus après la dégradation du coénosarc est un sujet de préoccupation lors de l’utilisation de ces micropropagués. Cependant, les polypes dans de nombreuses études, y compris la présente, ont été en mesure de présenter des cellules zooxanthelles à l’intérieur de leurs tissus et morphologies externes avec une polarisation orale-aborale intacte et des tentacules des semaines après le renflouement 25,27,32,36. Des études antérieures ont également montré que, après avoir été soulagés du stress aigu, les polypes coralliens libérés exposés à de l’eau de mer hautement saline ou chauffée ont été capables de récupérer l’expression de gènes liés à des processus tels que l’apoptose, la protéolyse et la division cellulaire à des niveaux similaires à ceux trouvés avant le renflouement32,36 et même d’augmenter l’expression des gènes liés à la guérison des tissus36.
En ce qui concerne la différence de survie entre les méthodes, il est important de souligner que ce temps peut varier entre différentes expériences même si les mêmes techniques sont utilisées, et il peut être lié à la santé des fragments utilisés et au bon entretien des polypes après le processus de sauvetage. Dans le cas du renflouement par incubation d’eau de mer sans calcium, la survie du polype était limitée à 1 jour. Ainsi, on peut conclure que la méthode n’est pas bien adaptée à la survie à long terme des espèces étudiées, ou qu’une meilleure adaptation de la technique pour les coraux P. verrucosa de la mer Rouge doit être faite. Les résultats rapportés ont montré qu’un temps de survie plus long a été obtenu avec les méthodes basées sur l’augmentation progressive de la salinité, lorsque les polypes ont été soumis à l’écoulement d’eau à haute salinité. Cette méthode peut fournir une augmentation plus contrôlée de la salinité que la méthode d’évaporation, tout en n’étant pas responsable d’une augmentation de la concentration d’autres substances présentes dans l’eau de mer, y compris les déchets métaboliques du corail, qui sont potentiellement toxiques pour l’organisme. Pour toutes ces raisons, cette méthode a été suggérée comme une alternative plus sûre pour maintenir des polypes sains27. Bien que cette méthode ait été supposée être plus sûre pour la santé des polypes et capable de produire des polypes qui vivent plus longtemps, un fait qui a été corroboré dans cette publication, des enquêtes supplémentaires sont nécessaires pour le confirmer. Les deux expériences de renflouement induit par une salinité élevée ont démontré un détachement complet des polypes après que la salinité ait atteint 59 PSU en 24 h. Si la salinité est augmentée au-delà du niveau auquel le renflouement est terminé, un stress supplémentaire sera causé aux polypes, réduisant ainsi leurs chances de survivre et de se remettre du traitement de stress aigu. Par conséquent, il n’est pas recommandé de maintenir les polypes plus longtemps dans de tels niveaux de salinité. Lors de la réalisation de la méthode d’induction de renflouement par exposition à de l’eau de mer sans calcium, un détachement complet a été obtenu à partir d’une incubation de 3 heures dans de l’eau de mer artificielle sans calcium, ce qui signifie qu’une exposition supplémentaire à ce milieu n’est pas non plus recommandée.
Pour aborder les méthodes qui étaient plus adéquates pour l’étude des polypes coralliens dans les enquêtes en laboratoire / in vitro , cette étude s’est concentrée uniquement sur trois procédures qui ont pris près de 24 heures pour que le processus de sauvetage soit terminé et ont été utilisées dans des études impliquant l’entretien à long terme des polypes coralliens des coraux scléractiniens. D’autres méthodes qui ont pris beaucoup plus de temps que ce temps n’ont pas été utilisées. Le tassement des polypes sur un substrat n’a pas été tenté dans cette étude, qui s’est concentrée sur la production de polypes qui pourraient être transférés dans différents environnements ou facilement collectés pour des analyses à l’aide de pipettes jetables. Les résultats démontrent que les polypes de l’espèce de corail P. verrucosa ont été maintenus en vie, avec des cellules zooxanthelles associées, un état visuel sain et une structure anatomique externe brute préservée, jusqu’à 8 semaines, même sans attachement à un substrat. Ces résultats indiquent que davantage de répliques biologiques peuvent être générées à partir de fragments de corail uniques en utilisant certaines des techniques démontrées dans cette étude. Ces répliques biologiques peuvent être conservées dans des environnements contrôlés (comme des boîtes de Pétri et des flacons cellulaires) et maintenues dans des conditions de laboratoire pour des expériences d’un mois et utilisées à plusieurs fins.
Depuis les premières descriptions fortuites du renflouement des polypes42,43, de nouveaux protocoles ont été établis pour trouver des méthodes plus normalisées pour induire la libération de polypes et maintenir ces polypes vivants, qui peuvent être utilisés pour de futures applications de recherche. Il s’agit notamment d’étudier différents aspects associés à la physiologie de l’holobionte corallien44 et aux interactions hôte-microbiome45, aux mécanismes moléculaires impliqués dans le blanchiment des coraux 5,25 et à la santé, à la résilience et à la protection de l’holobiote corallien 12,13,46,47 . De plus, les polypes coralliens relâchés peuvent être utilisés pour des applications en dehors du domaine de la recherche et ont été suggérés comme étant utiles pour créer des propagules qui peuvent se fixer à un substrat et se développer, créant potentiellement plusieurs individus coralliens qui peuvent être utilisés à des fins de restauration une fois que les protocoles normalisés de renflouement se sont répandus28 . Dans l’ensemble, bien que des expériences plus approfondies utilisant des polypes renfloués devraient être effectuées pour normaliser la méthodologie, il a été démontré que le renflouement des polypes est une approche reproductible qui peut être appliquée comme outil dans la recherche sur les coraux à plusieurs fins.
The authors have nothing to disclose.
Nous remercions Adam Barno et Francisca Garcia pour leur soutien dans les expériences et le suivi des polypes coralliens. Nous remercions également le KAUST Coastal & Marine Resources Core Lab pour son aide concernant l’entretien et l’infrastructure de l’aquarium. L’étude a été financée par le numéro de subvention KAUST BAS/1/1095-01-01.
5560 Conductivity/Temperature Probe | YSI | 5560 | Conductivity probe used with the ProQuatro Multiparameter meter |
Ace 5 in. Alloy Steel Diagonal Pliers | Ace Hardware | 2004083 | Used to cut coral fragments |
Ampicillin sodium salt | Sigma-Aldrich | A9518 | Used in DMEM medium. |
DMEM (1x) Dulbecco's Modified Eagle Medium | Gibco | 41965-039 | Used for incubating coral fragments in the calcium-free polyp bail-out method |
Fisherbrand Petri Dish, Stackable Lid 60 mm x 15 mm Sterile, Polystyrene | Thermo Fisher Scientific | FB0875713A | Petri dish used for bail-out by evaporstion and for keeping polyps inside an aquarium. |
Heizer Titanrohr Heizstab SW MW 600 Watt | Schego | 548 | Heaters used in aquarium |
Leica Application Suite Version 4.2 | Leica Microsystems | NA | Software used for image capture in demonstrative results |
Leica IC80 HD | Leica Microsystems | 12730216 | Camera used to take demonstrative results pictures |
Leica MDG33 | Leica Microsystems | 10 450 123 | Stereoscope stand used to take demonstrative results pictures |
Leica Z6 APO | Leica Microsystems | NA | Macroscope used to take demonstrative results pictures |
Magnesium Chloride | Thermo Fisher Scientific | 7487-88-9 | Used for preparing calcium-free artificial seawater. |
Magnesium Sulfate Anhydrous | Sigma-Aldrich | 7791-18-6 | Used for preparing calcium-free artificial seawater. |
Masterflex I/P Easy-Load Pump Head for Precision Tubing, White PPS Housing, SS Rotor | Masterflex | HV-77602-10 | Peristaltic pump head. |
Masterflex L/S Precision Modular Drives with Benchtop Controller | Masterflex | EW-07557-00 | Peristaltic pump drive used for pumping high salinity seawater. Can be substituted for any peristaltic pump capable of mainaining water flow as described in protocol. |
Masterflex L/S Precision Pump Tubing, Platinum-Cured Silicone, L/S 16; 25 ft | Masterflex | HV-96410-16 | Tubing for peristaltic pump. |
Millex 33 mm PVDF 0.22 µm Sterile RUO | Sigma-Aldrich | SLGVR33RS | Used to filter artificial sea water. |
Nunc EasYFlask 75 cm2 Nunclon Delta Surface | Thermo Fisher Scientific | 156499 | Flask usually used for cell culture used for polyp culture. |
Orbital shaker, Advanced 5000, VWR | VWR | 444-2916 | Shaker used inside incubator. |
Percival Incubator – I-22VL | Percival | NA | Incubator used for maintaing corals kept in cell flasks. |
Plankton net 200 µm mesh size | KC Denmark | NA | Used for covering petri dishes containing coral polyps. |
Potassium Chloride | VWR Chemicals | 7447-40-7 | Used for preparing calcium-free artificial seawater. |
ProQuatro Multiparameter Meter | YSI | 606950 | Used for measuring salinity thoughout the protocol |
RADION XR15 G5 PRO | Ecotech | NA | Lights used in aquarium |
Red Sea Salt Premium grade, moderate Alkalinity |
Red Sea | NA | Used to prepare 40 PSU artifical sea water. |
Sodium Bicarbonate | Sigma-Aldrich | 144-55-8 | Used for preparing calcium-free artificial seawater. |
Sodium Chloride | Sigma-Aldrich | S3014 | Used for preparing calcium-free artificial seawater. |
Sodium Sulfate Anhydrous | VWR Chemicals | 7757-82-6 | Used for preparing calcium-free artificial seawater. |
TRD 112 thermostat | Schego | NA | Thermostat used in aquarium |
Turbelle Nanostream 6025 | Tunze | 6025 000 | Pumps used in aquarium |