نقدم هنا، بروتوكولا لتصيب الابتدائي تنتجها من الخلايا الجلدية البشرية الليفية مع MCPyV. يشمل البروتوكول عزل الخلايا الليفية الجلدية، وإعداد فيريونس MCPyV والإصابة بعدوى الفيروس، وتلطيخ الفلورة والأسفار في التهجين الموقعي. ويمكن تمديد هذا البروتوكول وصف التفاعلات MCPyV-المضيف واكتشاف أنواع الخلايا الأخرى إينفيكتابل ب MCPyV.
يمكن أن تؤدي الإصابة polyomavirus (MCPyV) خلية ميركل إلى ميركل سرطان الخلية (MCC)، أحد أشكال سرطان الجلد شديدة عدوانية. الدراسات الميكانيكية إجراء تحقيقات كاملة في البيولوجيا الجزيئية MCPyV وآليات النمطان أعيقت بعدم وجود نماذج ثقافة الخلية الملائمة. وهنا يصف لنا مجموعة من البروتوكولات لأداء، واكتشاف الإصابة MCPyV خلايا الجلد البشرية الأساسية. وصف البروتوكولات عزلة الليفية الجلدية البشرية، إعداد فيريونس MCPyV المؤتلف، والكشف عن الإصابة بالفيروس تلطيخ (إذا كان) إيممونوفلوريسسينت وفي الموقع التهجين الحمض النووي سلسلة من ردود الفعل (HCR)، التي هي درجة عالية من الحساسية الأسفار في نهج الموقع التهجين (الأسماك). يمكن تكييفها مع البروتوكولات الملحقة هذه الوثيقة من الباحثين المهتمين التعرف على أنواع الخلايا أو خطوط الخلايا التي تدعم MCPyV العدوى الأخرى. وصف نهج الأسماك يمكن تكييفها أيضا للكشف عن مستويات منخفضة من السلطات الوطنية المعينة موجودة في جلد الإنسان المصابة الفيروسية.
ميركل خلية polyomavirus (MCPyV) هو فيروس الحمض النووي الصغيرة، مزدوج-الذين تقطعت بهم السبل التي تم إقرانها مع سرطان جلد نادرة ولكن العدوانية، ميركل الخلية الكبدية (MCC)1،2. يتجاوز معدل الوفيات من لجنة التنسيق الإداري، حوالي 33%، سرطان الجلد3،4. وقد MCPyV جينوم دائرية ~ 5 كيلو بايت1،5 جزئين حسب منطقة تنظيمية غير الترميز (نكر) في أوائل وأواخر ترميز المناطق1. نكر يحتوي على أصل الفيروسية النسخ المتماثل (أوري) والمروجين ثنائي الاتجاه للنسخ الفيروسي6،7. المنطقة أوائل يشفر البروتينات مستضد ورم دعا كبير تي (LT)، تي الصغيرة (ش)، 57kT، ORF الملازم البديلة (ألتو)، فضلا عن أوتوريجولاتوري ميرنا1،،من89،10. ترميز المنطقة أواخر بروتينات قفيصه VP1 و VP211،،من1213. الملازم وشارع البروتينات MCPyV أفضل درس وأظهرت دعما لتكرار الحمض النووي الفيروسي والمستحثه MCPyV tumorigenesis5. ومن المرجح الاستنساخ إدماج MCPyV الدنا في الجينوم المضيفة، وقد لوحظ في تصل إلى 80 في المائة من مراكز مراقبة الرحلات، عاملاً سببياً للمصابات بفيروس الورم التنمية14،15.
حالات الإصابة بلجنة التنسيق الإداري ثلاثة إضعاف على مدى السنوات العشرين الماضية16. أعراض الإصابة MCPyV أيضا على نطاق واسع في عموم السكان17،،من1819. مع تزايد عدد التشخيصات لجنة التنسيق الإداري وتفشي العدوى MCPyV، هناك حاجة إلى تحسين فهمنا للفيروس وإمكاناتها النمطان. ومع ذلك، يظل العديد من جوانب البيولوجيا MCPyV وآليات النمطان غير مفهومة20. هذا إلى حد كبير لأن MCPyV يتطابق سيئة في الخلية أنشئت خطوط11،12،21،،من2223 ، وحتى وقت قريب، خلايا قادرة على دعم MCPyV الجلد ولم تكن الإصابة اكتشفت22. قد عرقلت الدراسات الميكانيكية للتحقيق الكامل MCPyV وتفاعلها مع الخلايا المضيفة بالافتقار إلى نظام الثقافة خلية لنشر الفيروسات5.
فقد اكتشفنا أن الليفية الجلدية البشرية الأولية (هي) المعزولة من القلفة البشرية الولدان دعم قوي MCPyV العدوى على حد سواء في المختبر و السابقين فيفو24. من هذه الدراسة، قمنا بإنشاء أول خلية ثقافة العدوى نموذج MCPyV24. وبناء على هذا النظام النموذجي، واظهرنا أن استحثاث جينات أية (MMP) مصفوفة من WNT/بيتا-كاتينين إشارات الطريق وغيرها من عوامل النمو يحفز الإصابة MCPyV. وعلاوة على ذلك، وجدنا أن تراميتينيب خصم مجاهدي خلق التي وافقت عليها إدارة الأغذية والعقاقير يعوق فعالية MCPyV العدوى5،25. من هذه الدراسات، كما أنشأنا مجموعة من البروتوكولات لعزل الخلايا الليفية الجلدية البشرية24،25، إعداد MCPyV فيريونس11،12، أداء MCPyV العدوى في الخلايا الليفية الجلد البشري 24 , 25 وكشف MCPyV البروتينات التي إذا المصبوغة26. وبالإضافة إلى ذلك، نحن تكييفها في الموقع الحمض النووي التهجين سلسلة من ردود الفعل (HCR) التكنولوجيا27 لتطوير تقنية أسماك حساسة للغاية (HCR-الحمض النووي الأسماك) للكشف عن MCPyV الحمض النووي في خلايا الجلد البشرية المصابة. هذه الأساليب الجديدة سوف تكون مفيدة لدراسة دورة المعدية MCPyV، فضلا عن الاستجابة الخلوية للإصابة MCPyV. الخلايا الخزان المضيفة الطبيعية التي تحافظ على العدوى MCPyV والخلايا التي تؤدي إلى أورام لجنة التنسيق الإداري ما زال مجهولاً. يمكن تطبيق التقنيات يصف لنا في هذه المخطوطة دراسة أنواع مختلفة من الخلايا البشرية لتحديد الخلايا الخزان ومنشأ الأورام لجنة التنسيق الإداري. يمكن أيضا استخدام اساليبنا المتبعة، مثل “الأسماك” HCR-الحمض النووي، وفي الكشف عن فيروسات الورم الحمض النووي الأخرى ووصف التفاعلات الخلية المضيفة.
الأساليب المذكورة أعلاه، بما في ذلك عزل الخلايا الليفية الجلد من أنسجة جلد الإنسان، إعداد المؤتلف MCPyV فيريونس، وعدوى الخلايا المستزرعة وتلطيخ إيمونوفلوريسسينت، وأسلوب أسماك حساسة مقتبس من HCR التكنولوجيا، التي وينبغي أن تمكن الباحثين من تحليل MCPyV العدوى27. إحدى الخطوات الأكث?…
The authors have nothing to disclose.
المؤلف يود أن يشكر الدكتور مينارد هيرلين (معهد ويستار) والدكتور م. سيليست سيمون (جامعة بنسلفانيا) لتوفير الكواشف والدعم التقني. كما نشكر أعضاء مختبراتنا لمناقشة مفيدة. وكان يدعمها هذا العمل منح المعاهد الوطنية للصحة (NIH) (R01CA187718 و R01CA148768 و R01CA142723)، ومنح دعم مركز السرطان NCI (NCI P30 CA016520)، وجائزة “كفار بنسلفانيا” (P30 منظمة العفو الدولية 045008).
Fetal calf serum | HyClone | SH30071.03 | |
MEM Non-Essential Amino Acids Solution, 100X | Thermo Fisher Scientific | 11140050 | |
GLUTAMAX I, 100X | Thermo Fisher Scientific | 35050061 | L-Glutamine |
DPBS, no calcium, no magnesium | Thermo Fisher Scientific | 14190136 | |
0.05% Trypsin-EDTA | Thermo Fisher Scientific | 25300-054 | |
DMEM/F12 medium | Thermo Fisher Scientific | 11330-032 | |
Recombinant Human EGF Protein, CF | R&D systems | 236-EG-200 | Store at -80 degree celsius |
CHIR99021 | Cayman Chemical | 13122 | Store at -80 degree celsius |
CHIR99021 | Sigma | SML1046 | Store at -80 degree celsius |
Collagenase type IV | Thermo Fisher Scientific | 17104019 | |
Dispase II | Roche | 4942078001 | |
Antibiotic-Antimycotic | Thermo Fisher Scientific | 15240-062 | Protect from light |
DMEM medium | Thermo Fisher Scientific | 11965084 | |
Alexa Fluor 594 goat anti-mouse IgG | Thermo Fisher Scientific | A11032 | Protect from light |
Alexa Fluor 488 goat anti-rabbit IgG | Thermo Fisher Scientific | A11034 | Protect from light |
OptiPrep Density Gradient Medium | Sigma | D1556 | Protect from light |
Paraformaldehyde | Sigma | P6148 | |
anti-MCPyV LT (CM2B4) | Santa Cruz | sc-136172 | Lot # B2717 |
MCV VP1 rabbit | Rabbit polyclonal serum #10965 | https://home.ccr.cancer.gov/lco/BuckLabAntibodies.htm | |
Hygromycin | Roche | 10843555001 | |
Basic Fibroblast Growth Factors (bFGF), Human Recombinant | Corning | 354060 | Store at -80 degree celsius |
Benzonase Nuclease | Sigma | E8263 | |
Plasmid-Safe ATP-Dependent DNase | EPICENTRE | E3101K | |
Probe hybridization buffer | Molecular technologies | ||
Probe wash buffer | Molecular technologies | ||
Amplification buffer | Molecular technologies | ||
Alexa 594-labeled hairpins | Molecular technologies | B4 | Protect from light |
Triton X-100 | Sigma | X100 | |
Quant-iT PicoGreen dsDNA Reagent | Thermo Fisher Scientific | P7581 | |
BamHI-HF | NEB | R3136 | |
Buffer PB | Qiagen | 19066 | |
blue miniprep spin column | Qiagen | 27104 | |
50mL Conical Centrifuge Tubes | Corning | 352070 | |
T4 ligase | NEB | M0202T | |
MagicMark XP | Thermo Fisher Scientific | LC5602 |