Burada, MCPyV ile birincil insan dermal fibroblast bulaştırmak için bir protokol mevcut. Protokol dermal fibroblastlar izolasyonu, MCPyV virions, virüs enfeksiyonu, ayirt boyama ve floresan hazırlanması in situ hibridizasyon içerir. Bu iletişim kuralı tarafından MCPyV MCPyV ana bilgisayar etkileşimleri karakterize ve diğer hücre tipleri infectable keşfetmek için genişletilebilir.
Merkel hücre polyomavirus (MCPyV) enfeksiyon Merkel Hücresi Karsinomu (MCC), cilt kanseri son derece saldırgan bir tür için yol açabilir. MCPyV moleküler biyoloji ve oncogenic mekanizmaları tam olarak araştırmak için mekanik çalışmaları yeterli hücre kültür modellerin eksikliği tarafından engel olmuştur. Burada, biz gerçekleştirmek ve birincil insan deri hücrelerinin MCPyV enfeksiyon tespit iletişim kuralları kümesi tanımlamak. İletişim kuralları insan dermal fibroblastlar, izolasyonu rekombinant MCPyV virions hazırlanması ve virüs enfeksiyonu tespiti immünfloresan (Eğer) boyama ve in situ olarak DNA hibridizasyon son derece hassas olan zincirleme (HCR), tarafından tarif floresans in situ hibridizasyon (balık) yaklaşım. İletişim kuralları burada baktılar araştırmacılar tarafından diğer hücre tipleri veya MCPyV enfeksiyon destek hücre satırları tanımlamak için adapte edilebilir. Tarif Balık yaklaşım da viral DNA’lar enfekte insan deride mevcut seviyesinin düşük algılamak için adapte.
Merkel hücre polyomavirus (MCPyV) küçük, Çift iplikçikli DNA virüsü bir nadir ama sert cilt kanseri, Merkel Hücresi Karsinomu (mm)1,2ilişkilendirilmiş olduğunu. MM, yaklaşık % 33, ölüm oranı Melanom3,4süresini aşıyor. MCPyV ~ 5 kb1,5 erken ve geç bölgeler1kodlama içine bir kodlama-düzenleyici bölgeye göre (NCRR) böldüğü dairesel genom vardır. NCRR çoğaltma (Ori) ve çift yönlü Rehberleri viral transkripsiyon6,7için viral kökenli içerir. Erken bölge büyük T (LT), küçük T (sT), 57kT, alternatif LT ORF (ALTO) yanı sıra autoregulatory miRNA1,8,9,10denilen tümör antijen protein kodlayan. Geç bölge kapsid protein VP1 ve VP211,12,13kodlar. LT ve sT en çok çalışılan MCPyV proteinler ve viral DNA ikileşmesi ve MCPyV kaynaklı tumorigenesis5desteklemek için göstermiştir. Klonal entegrasyon MCCs ilâ % 80 gözlenmiştir, ana bilgisayar genom MCPyV DNA’ın olası virüs-pozitif tümör geliştirme14,15nedensel bir faktördür.
MM insidansı üzerinde son yirmi yıl16kat arttı. Asemptomatik MCPyV enfeksiyon genel nüfus17,18,19‘ da yaygındır. MM tanılar sayısının artması ve MCPyV enfeksiyon yüksek yaygınlığı ile virüs ve oncogenic bir potansiyel anlayışımızı geliştirmek için gerek yoktur. Ancak, MCPyV biyoloji ve oncogenic mekanizmaları birçok açıdan kötü anlaşılan20kalır. Büyük ölçüde MCPyV kötü içinde kurulan hücre satırlar11,12,21,22,23 çoğaltır ve yakın zamana kadar MCPyV destekleme kapasitesine sahip hücreleri cilt, bunun nedeni enfeksiyon keşfedilen22olmasaydı. Tam olarak MCPyV ve konak hücreleri ile etkileşimi araştırmak için mekanik çalışmaları5virüs yayma için hücre kültür sistemi eksikliği ile engel olmuştur.
Biz birincil insan dermal fibroblastlar (HDFs) her iki vitro yenidoğan insan sünnet destek sağlam MCPyV enfeksiyondan izole keşfetti ve ex vivo24. Bu çalışmada, ilk hücre kültür enfeksiyon modeli MCPyV24için kurduk. Bu modeli sistemde bina, matriks metalloproteinaz (MMP) genler tarafından WNT/β-catenin yolu ve diğer büyüme faktörleri sinyal indüksiyon MCPyV enfeksiyon uyarır gösterdi. Ayrıca, FDA onaylı MEK antagonisti trametinib etkili MCPyV enfeksiyon5,25engeller bulduk. Bu çalışmalardan da insan dermal fibroblastlar24,25, izole için iletişim kuralları kümesi MCPyV virions11,12, MCPyV enfeksiyon üzerinde insan dermal fibroblastlar performans hazırlama kurduk 24 , 25 ve algılama MCPyV proteinler tarafından Eğer boyama26. Buna ek olarak, enfekte insan deri hücrelerinde MCPyV DNA’sı tespit için son derece hassas bir balık tekniği (HCR-DNA balık) geliştirmek için yerinde DNA hibridizasyon zincirleme reaksiyon (HCR) teknoloji27 uyarlanmış. Yeni yöntemlerin MCPyV hem de hücresel yanıt MCPyV enfeksiyon bulaşıcı döngüsü eğitimi için faydalı olacaktır. MCPyV enfeksiyon korumak doğal ana depo hücreleri ve mm tümörü ortaya çıkmasına hücreleri bilinmeyen kalır. Biz bu el yazması tarif teknikleri hem rezervuar hücreleri tanımlamak için insan hücreleri türleri ve MCC tümörler kökeni incelemek için uygulanabilir. HCR-DNA balık gibi bizim kurulan yöntemleri de diğer DNA tümör virüs tespiti ve konak hücre etkileşimleri karakterizasyonu istihdam olabilir.
İnsan cilt dokusundan dermal fibroblastlar yalıtım, rekombinant MCPyV virions hazırlanması, enfeksiyon kültürlü hücreleri, immünfloresan boyama ve HCR teknolojisinden adapte hassas bir balık yöntemi de dahil olmak üzere yukarıda açıklanan yöntemleri hangi Araştırmacılar MCPyV enfeksiyon27analiz etmek etkinleştirmeniz gerekir. MCPyV enfeksiyon tüp bebek ulaşmada en önemli adımlardan biri yüksek titresi virion hazırlıklar yapımıdır. İstimal belgili tanımlık protokol…
The authors have nothing to disclose.
Yazarlar Dr. Meenhard Herlyn (Wistar Enstitüsü) ve Dr. M. Celeste Simon (Pennsylvania Üniversitesi) reaktifler ve teknik destek sağlamak için teşekkür etmek istiyorum. Laboratuarlarımızda yararlı tartışma için üyeleri ayrıca teşekkür ederiz. Bu eser ulusal kurumları sağlık (NIH) hibe (R01CA187718, R01CA148768 ve R01CA142723), ncı Kanser Merkezi Destek Grant (ncı P30 CA016520) ve Penn CFAR Ödülü (P30 AI 045008) tarafından desteklenmiştir.
Fetal calf serum | HyClone | SH30071.03 | |
MEM Non-Essential Amino Acids Solution, 100X | Thermo Fisher Scientific | 11140050 | |
GLUTAMAX I, 100X | Thermo Fisher Scientific | 35050061 | L-Glutamine |
DPBS, no calcium, no magnesium | Thermo Fisher Scientific | 14190136 | |
0.05% Trypsin-EDTA | Thermo Fisher Scientific | 25300-054 | |
DMEM/F12 medium | Thermo Fisher Scientific | 11330-032 | |
Recombinant Human EGF Protein, CF | R&D systems | 236-EG-200 | Store at -80 degree celsius |
CHIR99021 | Cayman Chemical | 13122 | Store at -80 degree celsius |
CHIR99021 | Sigma | SML1046 | Store at -80 degree celsius |
Collagenase type IV | Thermo Fisher Scientific | 17104019 | |
Dispase II | Roche | 4942078001 | |
Antibiotic-Antimycotic | Thermo Fisher Scientific | 15240-062 | Protect from light |
DMEM medium | Thermo Fisher Scientific | 11965084 | |
Alexa Fluor 594 goat anti-mouse IgG | Thermo Fisher Scientific | A11032 | Protect from light |
Alexa Fluor 488 goat anti-rabbit IgG | Thermo Fisher Scientific | A11034 | Protect from light |
OptiPrep Density Gradient Medium | Sigma | D1556 | Protect from light |
Paraformaldehyde | Sigma | P6148 | |
anti-MCPyV LT (CM2B4) | Santa Cruz | sc-136172 | Lot # B2717 |
MCV VP1 rabbit | Rabbit polyclonal serum #10965 | https://home.ccr.cancer.gov/lco/BuckLabAntibodies.htm | |
Hygromycin | Roche | 10843555001 | |
Basic Fibroblast Growth Factors (bFGF), Human Recombinant | Corning | 354060 | Store at -80 degree celsius |
Benzonase Nuclease | Sigma | E8263 | |
Plasmid-Safe ATP-Dependent DNase | EPICENTRE | E3101K | |
Probe hybridization buffer | Molecular technologies | ||
Probe wash buffer | Molecular technologies | ||
Amplification buffer | Molecular technologies | ||
Alexa 594-labeled hairpins | Molecular technologies | B4 | Protect from light |
Triton X-100 | Sigma | X100 | |
Quant-iT PicoGreen dsDNA Reagent | Thermo Fisher Scientific | P7581 | |
BamHI-HF | NEB | R3136 | |
Buffer PB | Qiagen | 19066 | |
blue miniprep spin column | Qiagen | 27104 | |
50mL Conical Centrifuge Tubes | Corning | 352070 | |
T4 ligase | NEB | M0202T | |
MagicMark XP | Thermo Fisher Scientific | LC5602 |