Summary

Análise de β-amiloide-induzida de anormalidades na estrutura do coágulo de fibrina por espectroscopia e microscopia eletrônica

Published: November 30, 2018
doi:

Summary

Aqui apresentados são dois métodos que podem ser usados individualmente ou em combinação para analisar o efeito da beta-amiloide na estrutura do coágulo de fibrina. Incluído é um protocolo para criar um em vitro coágulo de fibrina, seguido pelo coágulo turbidez e microscopia eletrônica métodos.

Abstract

Este artigo apresenta métodos para gerar coágulos de fibrina em vitro e analisando o efeito da proteína de beta-amiloide (Aβ) na formação de coágulos e estrutura por espectrometria e microscopia eletrônica (SEM). Aβ, que forma neurotóxicos agregados amiloides na doença de Alzheimer (AD), foi mostrado para interagir com o fibrinogênio. Essa interação de Aβ-fibrinogênio faz o coágulo de fibrina estruturalmente anormal e resistente a fibrinólise. Induzida por aβ anormalidades na coagulação fibrina também podem contribuir para aspectos cerebrovasculares da patologia AD tais como microinfarcts, inflamação, bem como, Angiopatia amiloide cerebral (CAA). Dado o papel potencialmente crítico dos défices neurovasculares na patologia AD, desenvolvimento de compostos que podem inibir ou diminuir a interação de Aβ-fibrinogênio tem valor terapêutico promissor. Métodos in vitro pelo qual fibrina formação do coágulo pode ser facilmente e sistematicamente avaliada são potencialmente úteis ferramentas para o desenvolvimento de compostos terapêuticos. Apresentado aqui é um protocolo otimizado para in vitro geração do coágulo de fibrina, bem como a análise do efeito dos inibidores de interação Aβ e Aβ-fibrinogênio. O ensaio de turbidez do coágulo é rápida, altamente reprodutível e pode ser usado para testar várias condições simultaneamente, permitindo a seleção de um grande número de inibidores de Aβ-fibrinogênio. Sucesso compostos desta seleção podem ser mais avaliados por sua capacidade de amenizar induzida por Aβ anormalidades estruturais da arquitetura do coágulo de fibrina usando SEM. A eficácia destes protocolos otimizado é demonstrada aqui usando TDI-2760, um inibidor de interação de Aβ-fibrinogênio recentemente identificado.

Introduction

A doença de Alzheimer (AD), uma doença neurodegenerativa, levando ao declínio cognitivo em pacientes idosos, predominantemente decorre anormal expressão de beta-amiloide (Aβ), agregação e liberação prejudicada, resultando em neurotoxicidade1, 2. apesar da associação bem caracterizada entre agregados Aβ e AD3, os mecanismos precisos subjacentes a patologia da doença não são bem compreendidas4. Aumentando a evidência sugere que os défices neurovascular desempenham um papel na progressão e gravidade da AD5, como Aβ interage diretamente com os componentes do sistema circulatório6. Aβ tem uma interação de alta afinidade com fibrinogênio7,8, que localiza também aos depósitos Aβ em pacientes AD e rato modelos9,10,11. Além disso, a interação de Aβ-fibrinogênio induz a formação do coágulo de fibrina anormal e estrutura, bem como resistência a fibrinólise9,12. Uma possibilidade terapêutica no tratamento de AD, está aliviando o déficit circulatório, inibindo a interação entre Aβ e fibrinogênio13,14. Nós, portanto, identificamos vários pequenos compostos, inibindo a interação de Aβ-fibrinogênio usando alto throughput triagem e química medicinal abordagens13,14. Para testar a eficácia de inibidores de interação Aβ-fibrinogênio, nós aperfeiçoamos a dois métodos de análise de em vitro formação de coágulos de fibrina: coagular ensaio de turbidez e digitalização de microscopia eletrônica de varredura (MEV)14.

Ensaio de turbidez de coágulo é um método direto e rápido para monitorar a formação de coágulos de fibrina usando espectroscopia UV-visível. Como o coágulo de fibrina, formas, luz é cada vez mais dispersos e a turbidez da solução aumenta. Inversamente, quando Aβ está presente, a estrutura do coágulo de fibrina é alterada, e a turvação da mistura é reduzida (Figura 1). O efeito inibitório compostos pode ser avaliado para o potencial de restaurar o coágulo turbidez de anormalidades Aβ-induzida. Enquanto o ensaio de turbidez permite análise rápida de várias condições, fornece informações limitadas sobre a forma de coágulo e estrutura. SEM, em que a topografia de objetos sólidos é revelada pela sonda de elétron, permite a análise da arquitetura 3D do coágulo16,15,17,18 e a avaliação de como a presença de Aβ e / ou compostos inibitórios altera essa estrutura9,14. Tanto espectrometria e SEM são técnicas clássicas de laboratório que foram usadas para diversos fins, por exemplo, espectrofotometria usada para monitorar a agregação amiloide19,20. Da mesma forma, SEM também é usado para analisar o coágulo de fibrina formado a partir do plasma do Alzheimer, Parkinson e AVC tromboembólico pacientes21,22,23. Os protocolos aqui apresentados são otimizados para avaliar a formação do coágulo de fibrina de forma rápida e reprodutível.

O protocolo seguinte fornece as instruções para a preparação de um em vitro -coágulo de fibrina com e sem Aβ. Ele também detalha os métodos para analisar o efeito de Aβ na formação do coágulo de fibrina e estrutura. A eficácia destes dois métodos para medir a inibição da interação Aβ-fibrinogênio é demonstrada usando TDI-2760, um pequeno compostos inibitórios14. Esses métodos, tanto individualmente e em conjunto, permitem uma análise rápida e simples de em vitro formação de coágulos de fibrina.

Protocol

1. preparação de Aβ42 e fibrinogênio para análise Preparar Aβ42 monomérica de pó liofilizado Aquecer Aβ42 pó a temperatura ambiente e rotação para baixo a 1.500 x g, durante 30 s. Adicionar 100 µ l de gelado hexafluoroisopropanol (HFIP) por 0,5 mg de pó de Aβ42 e incube por 30 min no gelo.Cuidado: Tenha cuidado ao manusear HFIP e executar todas as etapas em uma capa de química. Preparar 20 alíquotas µ l e deixe o que ar seco em uma capa química para 2-3 h. fi…

Representative Results

No em vitro ensaio (turbidez) de coagulação, a trombina enzima cliva fibrinogênio, resultando na formação do fibrina rede24. Esta formação do coágulo de fibrina provoca a dispersão da luz que passa através da solução, resultando em maior turbidez (Figura 1), platô antes do final do período de leitura (Figura 2, verde). Quando o fibrinogênio foi incubado na presença de Aβ42, diminu…

Discussion

Os métodos descritos aqui fornecem um meio rápido e reprodutível de avaliação fibrina coágulo formação em vitro. Além disso, a simplicidade do sistema torna a interpretação de como Aβ afeta a formação do coágulo de fibrina e estrutura relativamente simples e direta. Na publicação anterior deste laboratório, foi mostrado que estes ensaios podem ser usados para testar compostos por sua capacidade de inibir a interação de Aβ-fibrinogênio13,1…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Autores agradecer Masanori Kawasaki, Kazuyoshi Aso e Michael Foley de Tri-institucional Therapeutics Discovery Institute (TDI), Nova York para a síntese dos inibidores de interação Aβ-fibrinogênio e suas valiosas sugestões. Os autores também agradecer membros do laboratório Strickland para discussão útil. Este trabalho foi financiado pelo NIH grant NS104386, Drug Discovery Foundation do Alzheimer e fundo de desenvolvimento terapêutico Robertson para H.A., NIH conceder NS50537, Tri-institucional Therapeutics Discovery Institute, Alzheimer Drug Discovery Foundation, Fundação da família de Rudin e John A. Herrmann para S.S.

Materials

Fibriogen, Plasminogen-Depleted, Plasma EMD Millipore 341578 keep lid parafilm wrapped to avoid exposure to moisture
Beta-Amyloid (1-42), Human Anaspec AS-20276
Thrombin from human plasma Sigma-Aldrich T7009
1,1,1,3,3,3-Hexafluoro-2-propanol, Greater Than or Equal to 99% Sigma-Aldrich 105228
DIMETHYL SULFOXIDE (DMSO), STERILE-FILTERED Sigma-Aldrich D2438
Pierce BCA Protein Assay Kit Thermo Scientific 23225
Tris Base Fischer Scientific BP152
HEPES Fischer Scientific BP310
NaCl Fischer Scientific S271
CaCl2 Fischer Scientific C70
Filter Syringe, 0.2µM, 25mm Pall 4612
Millex Sterile Syringe Filters, 0.1 um, PVDF, 33 mm dia. Millipore SLVV033RS
Solid 96 Well Plates High Binding Certified Flat Bottom Fischer Scientific 21377203
Spectramax Plus384 Molecular Devices 89212-396
Centrifuge, 5417R Eppendorf 5417R
Branson 200 Ultrasonic Cleaner Fischer Scientific 15-337-22
Lab Rotator Thermo Scientific 2314-1CEQ
Spare washers for cover slip holder Tousimis 8766-01
Narrow Stem Pipets – Sedi-Pet Electron Microscopy Sciences (EMS) 70967-13
Sample holder for CPD (Cover slip holder) Tousimis 8766
Mount Holder Box, Pin Type Electron Microscopy Sciences (EMS) 76610
Round glass cover slides (12 mm) Hampton Research HR3-277
10% Glutaraldehyde Electron Microscopy Sciences (EMS) 16120
Ethanol Decon Labs 11652
24 well plate Falcon 3047
Na Cacodylate Electron Microscopy Sciences (EMS) 11652
SEM Stubs, Tapered end pin. Electron Microscopy Sciences (EMS) 75192
PELCO Tabs, Carbon Conductive Tabs, 12mm OD Ted Pella 16084-1
Autosamdri-815 Critical Point Dryer with Gold/Palladium target Tousimis
Denton Desk IV Coater Denton Vacuum
Leo 1550 FE-SEM Carl Zeiss
Smart SEM Software Carl Zeiss

References

  1. Selkoe, D. J., Schenk, D. Alzheimer’s disease: molecular understanding predicts amyloid-based therapeutics. Annual Review of Pharmacology and Toxicology. 43, 545-584 (2003).
  2. Kurz, A., Perneczky, R. Amyloid clearance as a treatment target against Alzheimer’s disease. Journal of Alzheimer’s Disease. 24, 61-73 (2011).
  3. Benilova, I., Karran, E., De Strooper, B. The toxic Abeta oligomer and Alzheimer’s disease: an emperor in need of clothes. Nature Neuroscience. 15 (3), 349-357 (2012).
  4. Karran, E., Hardy, J. A critique of the drug discovery and phase 3 clinical programs targeting the amyloid hypothesis for Alzheimer disease. Annals of Neurology. 76 (2), 185-205 (2014).
  5. Yoshikawa, T., et al. Heterogeneity of cerebral blood flow in Alzheimer disease and vascular dementia. AJNR, American Journal of Neuroradiology. 24 (7), 1341-1347 (2003).
  6. Strickland, S. Blood will out: vascular contributions to Alzheimer’s disease. The Journal of Clinical Investigation. 128 (2), 556-563 (2018).
  7. Ahn, H. J., et al. Alzheimer’s disease peptide beta-amyloid interacts with fibrinogen and induces its oligomerization. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 107 (50), 21812-21817 (2010).
  8. Zamolodchikov, D., et al. Biochemical and structural analysis of the interaction between beta-amyloid and fibrinogen. Blood. 128 (8), 1144-1151 (2016).
  9. Cortes-Canteli, M., et al. Fibrinogen and beta-amyloid association alters thrombosis and fibrinolysis: a possible contributing factor to Alzheimer’s disease. Neuron. 66 (5), 695-709 (2010).
  10. Cortes-Canteli, M., Mattei, L., Richards, A. T., Norris, E. H., Strickland, S. Fibrin deposited in the Alzheimer’s disease brain promotes neuronal degeneration. Neurobiology of Aging. 36 (2), 608-617 (2015).
  11. Liao, L., et al. Proteomic characterization of postmortem amyloid plaques isolated by laser capture microdissection. The Journal of Biological Chemistry. 279 (35), 37061-37068 (2004).
  12. Zamolodchikov, D., Strickland, S. Abeta delays fibrin clot lysis by altering fibrin structure and attenuating plasminogen binding to fibrin. Blood. 119 (14), 3342-3351 (2012).
  13. Ahn, H. J., et al. A novel Abeta-fibrinogen interaction inhibitor rescues altered thrombosis and cognitive decline in Alzheimer’s disease mice. The Journal of Experimental Medicine. 211 (6), 1049-1062 (2014).
  14. Singh, P. K., et al. Aminopyrimidine Class Aggregation Inhibitor Effectively Blocks Abeta-Fibrinogen Interaction and Abeta-Induced Contact System Activation. Biochemistry. 57 (8), 1399-1409 (2018).
  15. Pretorius, E., Mbotwe, S., Bester, J., Robinson, C. J., Kell, D. B. Acute induction of anomalous and amyloidogenic blood clotting by molecular amplification of highly substoichiometric levels of bacterial lipopolysaccharide. Journal of the Royal Society Interface. 13 (122), (2016).
  16. Veklich, Y., Francis, C. W., White, J., Weisel, J. W. Structural studies of fibrinolysis by electron microscopy. Blood. 92 (12), 4721-4729 (1998).
  17. Weisel, J. W., Nagaswami, C. Computer modeling of fibrin polymerization kinetics correlated with electron microscope and turbidity observations: clot structure and assembly are kinetically controlled. Biophysical Journal. 63 (1), 111-128 (1992).
  18. Chernysh, I. N., Nagaswami, C., Purohit, P. K., Weisel, J. W. Fibrin clots are equilibrium polymers that can be remodeled without proteolytic digestion. Scientific Reports. 2, 879 (2012).
  19. Klunk, W. E., Jacob, R. F., Mason, R. P. Quantifying amyloid beta-peptide (Abeta) aggregation using the Congo red-Abeta (CR-abeta) spectrophotometric assay. Analytical Biochemistry. 266 (1), 66-76 (1999).
  20. Zhao, R., et al. Measurement of amyloid formation by turbidity assay-seeing through the cloud. Biophysical Reviews. 8 (4), 445-471 (2016).
  21. Bester, J., Soma, P., Kell, D. B., Pretorius, E. Viscoelastic and ultrastructural characteristics of whole blood and plasma in Alzheimer-type dementia, and the possible role of bacterial lipopolysaccharides (LPS). Oncotarget. 6 (34), 35284-35303 (2015).
  22. Pretorius, E., Page, M. J., Mbotwe, S., Kell, D. B. Lipopolysaccharide-binding protein (LBP) can reverse the amyloid state of fibrin seen or induced in Parkinson’s disease. PLoS One. 13 (3), e0192121 (2018).
  23. Kell, D. B., Pretorius, E. Proteins behaving badly. Substoichiometric molecular control and amplification of the initiation and nature of amyloid fibril formation: lessons from and for blood clotting. Progress in Biophysics and Molecular Biology. 123, 16-41 (2017).
  24. Wolberg, A. S., Campbell, R. A. Thrombin generation, fibrin clot formation and hemostasis. Transfusion and Apheresis Science. 38 (1), 15-23 (2008).
  25. Soon, A. S., Lee, C. S., Barker, T. H. Modulation of fibrin matrix properties via knob:hole affinity interactions using peptide-PEG conjugates. Biomaterials. 32 (19), 4406-4414 (2011).

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Singh, P. K., Berk-Rauch, H. E., Soplop, N., Uryu, K., Strickland, S., Ahn, H. J. Analysis of β-Amyloid-induced Abnormalities on Fibrin Clot Structure by Spectroscopy and Scanning Electron Microscopy. J. Vis. Exp. (141), e58475, doi:10.3791/58475 (2018).

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