Ici, nous présentons un protocole de fractionnement de la membrane du cerveau qui représente une procédure robuste pour isoler les protéines appartenant à différents compartiments synaptiques.
L'évaluation de la composition et de la fonction de la protéine synaptique constitue un défi important en neuroscience. Cependant, il n'est pas facile d'évaluer la neurotransmission qui se produit dans les synapses car elle est fortement réglementée par des interactions protéines-protéines dynamiques et des événements de phosphorylation. Par conséquent, lorsqu'une méthode est utilisée pour étudier la transmission synaptique, un objectif majeur est de préserver ces modifications physiologiques transitoires. Ici, nous présentons un protocole de fractionnement de la membrane du cerveau qui représente une procédure robuste pour isoler les protéines appartenant à différents compartiments synaptiques. En d'autres termes, le protocole décrit une méthodologie biochimique pour effectuer l'enrichissement en protéines à partir de compartiments présynaptiques, postsynaptiques et extrasynaptiques. Tout d'abord, les synaptosomes, ou les terminaux synaptiques, sont obtenus à partir de neurones qui contiennent tous les compartiments synaptiques au moyen d'un gradient discontinu de saccharose. Il est à noter que la qualité de cette préparation initiale de la membrane synaptique est cRitical. Par la suite, l'isolement des différents compartiments sous-synaptiques est obtenu avec une solubilisation légère à l'aide de détergents doux à des conditions de pH différentiel. Cela permet une séparation par gradient et centrifuges isopyciques. Enfin, l'enrichissement en protéines dans les différents compartiments sous – synaptiques ( c'est-à-dire les fractions membranaires pré, post et extrasynaptiques) est validé au moyen d'une analyse par immunoblot en utilisant des marqueurs de protéines synaptiques bien caractérisés (SNAP-25, PSD-95 et synaptophysine, Respectivement), ce qui permet une évaluation directe de la distribution synaptique de toute protéine neuronale particulière.
La transmission synaptique repose sur l'intégrité physique de la synapse, concept qui a été envisagé dès 1897 par Foster et Sherrington 1 . Ainsi, la compréhension de la distribution de composants clés de neurotransmission ( p. Ex., Canaux ioniques, récepteurs, etc. ) est essentielle pour élucider la fonction synaptique, tant dans des conditions normales que pathologiques. La microscopie électronique (EM) a énormément contribué à la notion ultrastructurale actuelle des synapses prototypiques du système nerveux central (SNC). De telle manière, EM a établi avec précision les différences entre les densités pré et postsynaptiques, qui sont séparées par une fente d'une distance assez uniforme (~ 25 nm) 2 . Il est intéressant de noter que l'appareil postsynaptique présente un épaississement relativement continu et densifié par des électrons en dessous de sa membrane plasmatique, la densité dite post-synaptique ou PSD 2 . À l'inverse, à l'appareil présynaptique,Le réseau de cytomatricies discontinues est disposé juste sous la membrane plasmique, ce qui est essentiel à l'alignement et à l'amarrage des vésicules synaptiques à la zone active de la membrane plasmatique 3 . Par conséquent, EM constitue l'approche expérimentale dorée pour enquêter sur la répartition des protéines dans les synapses du SNC structurellement préservées. Cependant, les informations fournies par les micrographies électroniques sont statiques. En effet, les preuves accumulées montrent que les synapses in vivo sont extrêmement dynamiques, connaissant ainsi des changements structurels spectaculaires lors de la transmission synaptique soutenue. En outre, la morphologie et la composition des synapses peuvent varier dans différentes régions du SNC et sur le développement, la maturation, le vieillissement et le développement de conditions neuropathologiques. Dans l'ensemble, un protocole axé sur l'isolement des protéines appartenant à différents compartiments synaptiques dans des conditions physiologiques représente un outil précieux pour une étude plus complète du fonctionnement synaptique.
<p cLass = "jove_content"> Ici, nous décrivons ce type d'approche expérimentale complémentaire, qui permet l'enrichissement biochimique préparatif des différents compartiments de membrane synaptique, à savoir les domaines de membrane extra, post-post-synaptique. Cette méthode de fractionnement de la membrane, décrite d'abord par Philips et al . (2001) 4 , est basé sur un changement de pH qui affaiblit les interactions adhésives se produisant dans l'appareil pré et post-synaptique. Tout d'abord, en utilisant des détergents doux à pH 6,0, il est possible de discerner la jonction adhérente qui détient l'appareil pré et post-synaptique et qui est maintenue à partir du domaine de la membrane extrasynaptique, qui est solubilisé et peut ainsi être extrait des contacts synaptiques. Par la suite, l'élévation du pH de 6,0 à 8,0 en présence de détergents doux affaiblit la résistance de la jonction adhérente qui maintient la zone active présynaptique étroitement liée à la densité postsynaptique. Par conséquent, le compartiment présynaptique est tellementLubilisé et peut être séparé de la densité postsynaptique, qui est principalement conservée car la concentration de détergent utilisée ne favorise pas sa solubilisation 4 . Fait intéressant, l'efficacité de fractionnement, éventuellement supérieure à 90%, peut être confirmée par différents marqueurs subsynaptiques: i ) protéine 25 synaptosomale associée (SNAP-25), de la zone active présynaptique; Ii ) la synaptophysine, à partir de la fraction extrasynaptique ( c'est-à-dire à l'extérieur de la zone active et incluant les microsomes); Et iii ) la protéine de densité postsynaptique 95 (PSD-95), à partir de la densité postsynaptique. Notamment, cette méthode de fractionnement de la membrane du cerveau a été utilisée avec succès. En conséquence, il a été possible de déterminer précisément la localisation sous-synaptique de différents récepteurs, tels que les récepteurs de l'alpha-amino-3-hydroxy-5-méthyl-4-isoxazolepropionique (AMPA) 5 , le récepteur de l'adénosine A 1 (A 1 R) 6 ,Les récepteurs de l'adénosine A 2A (A 2A R) 7 , les récepteurs P2 de l'adénosine triphosphate (ATP) 8 , les sous-unités du récepteur nicotinique de l'acétylcholine 9 et le récepteur GPR37 10 associé à la maladie de Parkinson. Cependant, un certain nombre de limitations peuvent entraver l'évaluation correcte de la distribution synaptique d'une protéine neuronale particulière. Ainsi, dans cette procédure, nous décrivons non seulement entièrement l'intégralité du protocole, mais nous mettons également en évidence certains points critiques à considérer, tels que la quantité de tissu assez importante nécessaire, le faible rendement en protéines et l'obligation obligatoire de valider l'efficacité de Chaque séparation avant d'effectuer l'expérience définie.The protocol presented here constitutes a powerful biochemical tool for the study of the subsynaptic distribution of specific proteins within any brain region. However, there are some drawbacks inherent to the technique that deserve to be highlighted here. For instance, one of the main limitations is the relatively large amount of tissue needed to purify a reasonable amount of protein in order to perform the immunoblot analysis of all subsynaptic fractions. This issue might be related to the fact that synapses (i.e.,…
The authors have nothing to disclose.
Ce travail a été soutenu par le Ministère de l'économie et de la compétitivité / Instituto de Salud Carlos III (SAF2014-55700-P, PCIN-2013-019-C03-03 et PIE14 / 00034), Instituciò Catalana de Recerca i Estudis Avançats (ICREA Academia-2010 ), Et Agentchap voor Innovatie porte Wetenschap en Technologie (SBO-140028) à FC En outre, X. M, VF-D. Et FC appartiennent au groupe de recherche accrédité "Neuropharmacologie et Douleur" (Generalitat de Catalunya, 2014 SGR 1251) . Le travail a également été soutenu par le "Investigateur Visitante Especial-Ciência Sem Fronteiras" de CAPES (Brésil) à FC
Sucrose | Pancreac Química SL, Barcelona, Spain | 1,316,211,211 | |
CaCl2 | Pancreac Química SL, Barcelona, Spain | 2,112,211,210 | |
MgCl2·6H2O | Pancreac Química SL, Barcelona, Spain | 1,313,961,210 | |
Protease inhibitor cocktail Set III | Millipore, Darmstadt, Germany | 535140 | |
Trizma Base | Sigma, St. Louis, MO, USA | T1503 | |
Tris-HCl | Pancreac Química SL, Barcelona, Spain | 1,236,541,209 | |
Triton X-100 | Sigma, St. Louis, MO, USA | X100 | |
SDS | Sigma, St. Louis, MO, USA | L3771 | |
Glycerol | Sigma, St. Louis, MO, USA | G5516 | |
Bromophenol Blue | Pancreac Química SL, Barcelona, Spain | 1,311,651,604 | |
Dithiothreitol | Sigma, St. Louis, MO, USA | D0632 | |
Tween 20 | Sigma, St. Louis, MO, USA | P2287 | |
Non fat dry milk | |||
NaCl | Pancreac Química SL, Barcelona, Spain | 1,216,591,211 | |
KCl | Pancreac Química SL, Barcelona, Spain | 1,314,941,210 | |
KH2PO4 | Merck | 4873 | |
Na2HPO4 | Pancreac Química SL, Barcelona, Spain | 1,316,781,211 | |
Basic 20 pH | Crison, Alella, Spain | ||
Polytron VDI 12 Adaptable Homogenizer | VWR, Radnor, PA, USA. | ||
Ultra-Clear Tubes (14x89mm) | Beckman Coulter, Hospitalet de Llobregat, Barcelona | 344059 | Tubes should be filled almost completely when used to prevent collapsing due to ultracentrifugation. |
Amicon Ultra-15 Centrifugal filters Ultracel -10K | Merck Millipore, Darmstadt, Germany | UFC901008 | |
Centrifuge 5430R | Eppendorf, Hamburgo, Germany | ||
Optima L-90K Ultracentrifuge | Beckman Coulter, Hospitalet de Llobregat, Barcelona | ||
Sonifier 250 | Branson, Danbury, Connecticut | ||
Amersham Imager 600 | GE Healthcare Europe GmbH, Barcelona, Spain | ||
Disposable Glass Pasteur Pippetes 230 mm | VWR, Radnor, PA, USA | 612-1702 | |
Compact Balance EK-610 | A&D, Tokyo, Japan | ||
Pierce™ BCA Protein Assay Kit | Pierce Biotechnology, Rockford, IL, USA | ||
SuperSignal west pico chemiluminescent substrate | Thermo Fisher Scientific Inc., Waltham, MA, USA | ||
GR 200 Precision Balance | A&D, Tokyo, Japan | ||
Anti-GPR37 | Homemade antibody anti-GPR37 produced and validated in Francisco Ciruela Laboratory. | Primary antibodies used at a final concentration of 0.250ug/ml | |
Anti-SNAP-25, anti-PSD-95, anti-synaptophysin | Abcam, Cambridge, United Kingdom | Primary antibodies diluted 1:10000 | |
HRP-conjugated goat anti-mouse IgG | Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, USA. | Secondary antibody diluted 1:10000 | |
HRP-conjugated goat anti-rabbit IgG | Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, USA. | Secondary antibody diluted 1:30000 |