This protocol describes a system architecture for performing automated small volume (0.15–1.5 ml) particle separations using a microfluidic device, and discusses methods to optimize acoustofluidic device performance and operation.
微流体装置的一个主要优点是操纵小样品体积,从而减少了浪费试剂和保护珍贵样品的能力。然而,为了实现鲁棒的样品操作,有必要解决设备集成与宏观环境。为了实现可重复的,敏感的颗粒分离与微流体装置,该协议提供了一个完整的自动化和集成的微流控平台,使采用微流体装置0.15-1.5毫升样品精密加工。该系统的重要方面包括模块化设备的布局,并导致可靠和灵活的全球芯片连接强大的固定装置,并完成闭环样品采集,系统清理和涂刷步骤,以确保可重复的操作完全自动化液体处理。不同的微流体装置可以互换使用这种架构。在这里,我们将一个acoustofluidic设备,详细阐述其characteriz通货膨胀,性能优化,并证明其用于大小分离的生物样品。通过在分离实验使用的实时反馈,样品采集进行了优化,节约和浓缩样品。尽管要求的多台设备的集成,这种结构的优点包括处理未知样品,没有额外的系统优化,便于装置的更换,和精确,鲁棒样加工的能力。
样品分离和分级分离是应用微流体技术的最有前途的领域之一。这样的样品处理步骤是不可分割的有效的临床诊断,治疗的发展,生物监测工作,并在生命科学研究和技术进步。一个无数的微流体分离策略已经被证明为流体悬浮颗粒和胶体,以及化学和生物物种;一些评论提供的最新研究进展和发展概述在这些领域1 – 9。虽然许多这些微流体分离技术(以下简称为“芯设备”)已经被广泛表征,少数报告已经考虑在系统级样品分离问题。核心设备是典型的个人厘米尺度芯片,接口到含氟聚合物管,流体通过一位移或压力泵递送。然而,如果微流体的承诺 – 包括增加自动化,可靠性和减少样品体积 – 是成为现实,至少相当于必须努力致力于一个完全分离的系统到其中的核心设备是集成设计。
此外,对于微流体方法生物检测的一个主要挑战是在宏观到微观界面。这不仅是指一个微流体装置,宏观组件的物理“世界到芯片”连接,并以典型的临床或分析样品体积(〜0.1-10毫升)和微流控芯片的内部容积之间的失配(〜 0.01-10微升),而且还从桥接这些大小尺度所产生的统计抽样限制。这些问题有助于人们认为样品前处理和制剂是生物检测中的“薄弱环节”。10在这项工作た描述的平台对解决这些挑战KES主要步骤。
服用一个系统级视图,该协议细节精确计量的分析规模的体积(范围从0.15至1.5毫升)于〜10分钟的时间尺度的可靠的处理。这是一个“一键”操作:一旦包含样本和目的地小瓶馏分收集源小瓶放置到系统中,“运行”命令启动的程序,并且所有步骤都是计算机控制的。在一个运行结束时,收集瓶可以从系统的分离级分的下游分析去除。
在这个系统中的核心设备是一个acoustophoresis芯片,其提取哺乳动物细胞大小(5-20微米)的粒子从样品。 Acoustophoretic分离这里选择主要是因为它是高通量(高达μl/ min的100秒),无标记,和非接触,从而提供在分离存活维鲁优点SES从细胞中,很少有其他微流控技术无法比拟的。声粒子的物理学聚焦已被广泛描述,11 – 13,不是本协议的重点,但基本概念的简要概述如下理解应用到微流体分离,以帮助。
超声波的驻波谐振在流体填充微通道产生压力场,这引起力量驱动颗粒朝向低压的节点。的力的大小取决于粒子的体积上,并从相对密度和颗粒的压缩性衍生的声学造影因子和悬浮流体。14同样地,声学聚焦非常适合的细胞大小(〜7-15分离微米)的病毒大小(〜50〜200纳米)的粒子。较大的颗粒迁移向压力节点;然而,由于力量级是非常小的颗粒小于2-3微米,这些小颗粒或溶解的物质几乎不移动。我们的特异性声学分离实施,如前所述,15包括一个薄壁细分流体通道,并允许可调谐,聚焦位置的非对称安置。这增加了灵活性在设备的设计,和性能优势,包括增加的分离质量和速度,都充分别处描述。16,17
然而,在这项工作中所描述的系统级设计方法的一大优点是,它是适用于种类繁多的微流体核心设备。例如,大多数其它连续流分离模式,包括惯性,流场分馏,确定性横向位移(DLD),和各种类型的电动装置的可容易地并入,以适当调整的要算为改变入口/出口结构,流速和样本量。与各种类型的片场(电场,磁场)或梯度(热,化学)设备可能需要到芯片,或额外的硬件集成,该平台可容纳该附加的连接。
这个协议提供了设计的微流体分离装置,并通过深反应离子蚀刻来制造含硅玻璃芯片(DRIE,等离子蚀刻工艺,可以在许多微制造设施,它使用交流蚀刻和钝化的循环以获得深所需的步骤功能与垂直侧壁18)。接着,我们描述了acoustofluidic设备的表征,以确定分离的最佳运行参数,最后细节的完全集成的分离系统和用于处理生物样品的过程。典型的器件特性分析结果和样本处理数据,然后介绍和讨论,这Appro公司的主要优势ACH被突出显示,包括模块化,鲁棒性,精度和自动化。
该协议提出了微流控设备的系统级集成,以宏观的设备进行自动化生物样品处理。这个平台的模块化允许它为适用于任何连续流动装置中,和,作为一个例子,所提出的协议的重点是表征和优化acoustofluidic粒子分离装置的性能。这个协议的三个主要优点突出:(ⅰ)模块化和芯片到世界的接口,(ⅱ)鲁棒表征设备的性能,以及精确计量样品体积为粒子分离(ⅲ)自动处理。
一世。模块化和芯片到世界的接口
如图2所示,微流体芯片被安装在一个自定义的实验板以很容易地装配到一台显微镜直接观察。线路板含有#6-40 UNF螺纹在一个5毫米间距网格,ENA孔金光闪闪芯片被固定,并且被制成流体连接。流体连接PEEK管与机械加工的端面,该密封件对流体芯片用橡胶面密封垫圈和一个不锈钢的衣领。这个接口方案,可以方便片替换和快速装置的重新设计,需要很少或没有改变其他系统组件,提供芯片脚印符合网格格式。例如,我们已经使用该平台的微流控芯片为连续流动电泳,热裂解细胞,29快速试剂化学合成的混合,和单细胞捕获和询问。
二。设备性能强大的表征
为了优化任何微流体分离装置的性能,它的操作,必须首先充分表征。此处所描述的系统支持的快速和自动化协议来做到这一点的发展。对于具体examp声学聚焦设备中,聚焦质量,工作频率,并在微流体通道集中颗粒的位置的文件,必须进行测量为每个单独的设备。这些测量需要通过一系列的压电陶瓷驱动器的频率,电压和流速扫,以确定最佳参数的组合为高质量的分离。所提出的协议自动改变这些可调参数和捕捉相关数据- 即 ,颗粒中流动的信道进行后处理,以产生颗粒的聚焦质量,频率和位置 (图3)所需的测量的荧光图像。
的声学装置的性能全面表征要求重复步骤4.4和4.5在需要不同的实验条件下。例如,一个芯片的绝对聚焦位置被以相对低的流率和高的电压运行频率扫描发现s至确保完全迁移到节点位置。另外,这样的频率扫描可以评估装置组件(具有已知尺寸的聚苯乙烯珠上运行时)的质量,或者,以确定如何先前未知粒子类型将表现在系统(后一个芯片的特点与珠)。与来自压电陶瓷至微流体通道良好能量转移的芯片将导致紧聚焦在高流速(> 1毫升/分钟)和低电压(12〜15 V pp的),而那些与能量转移差不会集中连在低流速下(<100微升/分钟)和高电压(> 20 V峰)。我们已经发现,微流体芯片和压电陶瓷之间的紧密接触为有效的能量转移到流体临界。粘结微流体芯片和压电陶瓷将使可靠的生产的高性能设备的最佳方法的进一步调查。
最后,一个完整可以通过结合步骤4( 和图3)与来自SPO和LPO作为相关操作参数的功能收集的颗粒数的基于图像的频率扫描测量来获得的acoustophoretic装置的操作的画面,从进行了微球分离实验如在步骤5中描述的。如图6所示,这样一系列自动化实验可以迅速表征单个设备的性能和可调谐性,通知最优参数空间的用户来操作设备,用于颗粒分离。
三。对于粒子分离自动化小样本处理
对于成功的和精确的微流控芯片基于样本的处理,这是至关重要的,以可靠地和精确地计,负载,提供和收集的流体的体积,因为他们通过。这个精度是特别重要的,当样本量小(〜0.1-1毫升),这是在临床或研究实验室环境常见。30精确样品处理是在采用样品手工撤回到注射器和输注到装置与样品时的无反馈的传统微流体实验有挑战性已被分离和当它应该被收集。所提出的协议采用自动化样品线圈装载和配药加上从流量传感器的实时反馈,以使小体积的样品重复分离。
图5示出了在SPO和LPO从一个典型的分离试验测得的气流文件。首先,为至少35微升导致缓冲器被加载,以确保稳定的流量之前样品达到声学芯片。样品体积小于100微升不推荐用于此系统的配置,因为样品稀释由于领先缓冲器变得过量。空气的插头使用在日的开始Ë注射龙头缓冲区之前向样品塞从以下,防止混合和稀释试样和作为一个指标的流量传感器的流体中分离出来。后的初始瞬变流体开始通过系统移动,在两个出口尖峰信号指示第一气泡的通过。这些瞬态之后是稳定的流动的一个长周期作为样品流过系统,那么当第二气泡穿过另一个尖峰,最后最终降低流速为零注射器泵停止之后。
通过流量传感器的空气塞的通道被用作触发点切换阀来启动和停止样品采集,从而由非样本流体体积最小丢失的样品和稀释。处理的样品体积的闭环计量无需重新编程这些值输入样值被改变每次实验开始之前。此功能尤其重要的,当样品量是有限的,例如在许多临床样品的情况下。实时流量监测还有助于排除故障;差的运行(例如,在出口中的一个的堵塞形成)是从所得到的气流文件立即明显的, 如在图5b中。
为了演示的灵活性和acoustofluidic分离的使用提出了系统架构的有效性,纯化登革病毒及纪源病毒的股票是通过微流控芯片掺入细胞储存和处理分开。 图7a显示,Raji细胞以及分离病毒,为97 %Raji细胞离开所述芯片被发现是在过氧化脂质,从而留下DENV在SPO高度富集的样品。相比较而言,DENV分离的效率较低,与DENV的70%退出在SPO找到的芯片。这可以归因于轻微对流混合引起的separati的匝上信道,但更可能在一定DENV颗粒连同Raji细胞进入LPO迁移。细胞在整个流线横向迁移拖动一些流体与它们,即使在低雷诺数。通过这个机制,以及非特异性表面吸附,病毒颗粒转移到LPO。尽管如此,DENV在SPO的高度富集的样品是显著益处,例如当从头测序被用于检测和鉴定病毒。
图7b显示,在一次试验运行中,只有约70%的Boa细胞退出芯片中发现了过氧化脂质,有近100%的分离效率Raji细胞进行比较。相比,Raji细胞,因此导致更小的声学力,在两种细胞类型之间的分离性能上的差异可以归因于一个更小的平均尺寸或博阿细胞的密度较低。为了证实或驳斥这些推测,宝儿的大小,密度和形态细胞悬浮宝儿细胞(其正常生长贴壁)必须被准确测量,努力作进一步调查。在相同的实验中,类似于与DENV实验中,大部分的回收GGV从SPO退出,指示病毒级分的富集。
所提出的数据突出的工程技术广泛适用的平台所固有的挑战,处理各种生物样品。重要的是,生物相互作用可以开始玩同样大的作用,在物理和机械效应。然而,这些初步的实验也证明了权力和使用该系统的架构来样加工的临床和研究应用的承诺。作为一个强大的,良好的特点设计的系统,这个平台提供了寻求答案,新的科学问题的能力。
The authors have nothing to disclose.
This work was performed under the auspices of the U.S. Department of Energy by Lawrence Livermore National Laboratory under Contract DE-AC52-07NA27344, and partially supported by LLNL’s Laboratory Directed Research and Development (LDRD) program, 14-LW-077. The authors thank Michael Wilson, Mark Stenglein and Joe DeRisi at the Univeristy of California, San Francisco for generously providing GGV and Boa cell samples. EJF acknowledges support from the LLNL Lawrence Scholar Graduate Program. MS acknowledges support from the UC Office of the President Lab Fees Research Program. LLNL-JRNL-665235
Materials required for Steps 1-3: Device Design, Fabrication and Assembly | |||
Double Sided Polished Silicon Wafer | Silicon Quest International, Inc. San Jose, CA, USA | 100 mm <100> prime wafer | 1-20 ohm-cm, 495 +/- 25µm Double-side polished |
Glass Wafer | Bullen Ultrasonics, Eaton, OH, USA | 100mmx0.5mm Boro | |
Photoresist, AZ 1518 | MicroChemicals GmbH, Ulm, Germany | AZ 1518 | Photoresist used to adhere wafer to blank wafer for DRIE etching |
Photoresist, AZ 4620 | MicroChemicals GmbH, Ulm, Germany | AZ 4620 | Photoresist to define fluidic and via mask patterns |
DRIE plasma etcher | STPS, Newport, NP, United Kingdom | Multiplex Advance Oxide Etch (AOE) ICP system | |
Wafer Bonder | Electronic Visions Group, St.Florian am Inn, Austria | EVG 501 | |
Dicing saw | Kulicke & Soffa Industries, Singapore | K&S 982 | |
Epoxy kit | Epoxy Technology, Billerica, MA, USA | EPO-TEK 301 | Epoxy used to couple piezo and microfluidic chip |
PZT piezoceramic | Piezo Systems, Woburn, MA, USA | PSI-5A4E | 37.5 × 10 × 0.5 mm |
28 AWG Kynar-insulated solid wire | Squires Electronics, Cornelius, OR, USA | UL1422 | |
2-part silver epoxy | MG Chemicals, Surrey, BC, Canada | 8331 | Conductive adhesive for attaching wire leads to PZT |
L-edit | Tanner EDA, Monrovia, CA, USA | Ledit v15.1 64-bit | CAD software for mask layout |
Materials required for Step 4: Characterizaiton of Acoustic Focusing Performance | |||
Dual Pump | Harvard Apparatus, Holliston, MA, USA | PHD ULTRA Series, 703007 | |
5ml syringes | Becton-Dickinson, Franklin Lakes, NJ, USA | 309646 | |
Luer to Threaded port adapter | IDEX, Oak Harbor, WA, USA | P-659 | Connects syringe to tubing |
Union | IDEX, Oak Harbor, WA, USA | P-623 | Connects world to chip connections to fluoropolymer tubing. Can also use webbed |
Ferrule 1/4-28 flat bottom | IDEX, Oak Harbor, WA, USA | P-200 | Used with nut to make connections between tubing and syringe, flow sensors and world to chip hardware |
Nut 1/4-28 flat bottom | IDEX, Oak Harbor, WA, USA | P-202 | Used with ferrule to make connections between tubing and syringe, flow sesnsors and world to chip hardware |
1/16" OD Fluoropolymer tubing | IDEX, Oak Harbor, WA, USA | 1912L | Tubing to connect syringe pumps to world to chip connections. Tubing size is not critical during claibration steps (.01-.03" ID typically used, other suitable part numbers: 1907L, 1902L). |
Small ID fluoropolymer tubing | IDEX, Oak Harbor, WA, USA | 1476-20 | Used for Flow restrictors: 0.006" ID, 1/16" OD FEP |
PEEK tubing | Connects from chip to fluoropolymer tubing. | ||
Cooling fan | Multicomp, Leeds, England | MC19663 | |
Function Generator | Agilent, Santa Clara, CA, USA | 33220A | |
RF amplifier | ENI, Rochester, NY | 325 LA | Must be able to amplify signals from <1V in the range of 1-2MHz to 25 Vpp to the piezo. |
CCD Camera | Photometrics, Tucscon, AZ, USA | CoolSnap HQ | |
Inverted Microscope | Zeiss, Oberkochen, Germany | Axiovert S100 | |
FITC filter set | Chroma Tech, VT, USA | SP101 | |
Objective, 10x | Zeiss, Oberkochen, Germany | ACHROPLAN | |
Oscilloscope | Tektronix, Beaverton, OR, USA | TDS3014B | To monitor voltage output by RF amplifier |
MatLab | Mathworks, Natick, MA, USA | R2014a | |
Driver interface software to integrate Photometrics camera with LabVIEW | R Cubed Software, Lawrenceville, NJ, USA | SITK | |
Tween 20 | Sigma Aldrich, St. Lousi, MO, USA | P9416 | |
Dragon Green Fluorescent 5.76 or 7.32 µm Beads | Bangs Laboratory, IN, USA | FS06F | |
Additional materials required for Step 5: Automated Separation | |||
Multiport valves | VICI, Houston, TX, USA | C25Z-3180EUHA | In the current configuration 4 valves are needed |
Flow Sensors | Sensirion, Westlake Village, CA, USA | SLI-1000 | |
Fluoropolymer tubing, .01 and .03" ID | IDEX, Oak Harbor, WA, USA | 1902L and 1912L | High purity PFA preferred |
Nut | VICI, Houston, TX, USA | ZN1PK-10 | Used with ferrule to make connections between tubing and valves. Alternative part numbers: MZN1PK-10, LZN1PK-10 |
Ferrule | VICI, Houston, TX, USA | ZGF1PK-10 | Used with nut to make connections between tubing and valves. |
LabVIEW | National Instruments, Austin, TX, USA | LabVIEW Professional Development system | Laboratory Automation Software |
PBS | Teknova, Hollister, CA, USA | P0200 | |
Raji Cells | ATTC, Manassas, VA, USA | CCL86 | |
Boa Cells | Kindly provided by the DeRisi Laboratory at UCSF | ||
GGV | Kindly provided by the DeRisi Laboratory at UCSF | ||
DENV | Kindly provided by Jose Pena at LLNL | ||
Coulter Counter Z2 | Beckman Coulter, Brea, CA, USA | Z2 | |
Hemacytometer | Fisher Scientific, Waltman, MA, USA | 0267151B |