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FASP 소화 및 데이터 독립적 분석을 통한 EPS-소변의 프로테오믹 프로파일
JoVE 신문
생화학
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JoVE 신문 생화학
Proteomic Profile of EPS-Urine through FASP Digestion and Data-Independent Analysis
DOI:

14:48 min

May 08, 2021

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Chapters

  • 00:00Introduction
  • 00:55Protocol
  • 01:25Protocol: FASP Digestion
  • 05:29Protocol: SCX Purification
  • 08:08Protocol: Protein Quantifcation by External Standard
  • 09:23Protocol: NanoLC-MS/MS and DIA Analysis
  • 11:31Protocol: High-pH C18 Fractionation for Spectral Library
  • 13:09Protocol: Data Analysis
  • 13:35Expected Results
  • 13:53Conclusion

Summary

자동 번역

여기서, 우리는 단백질 소화, 펩타이드 정제 및 데이터 독립적 인 수집 분석과 같은 상세한 정보와 함께 최적화 된 필터 소화 프로토콜을 제시합니다. 이 전략은 발현 된 전립선 분비 소변 샘플의 분석에 적용되며 높은 프로테아메 커버리지와 오줌 프로테오메의 낮은 누락 된 값 라벨 프리 프로파일링을 허용합니다.

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