Hier presenteren we een geoptimaliseerd op-filter spijsverteringsprotocol met gedetailleerde informatie over het volgende: eiwitvertering, peptidezuivering en gegevensonafhankelijke acquisitieanalyse. Deze strategie wordt toegepast op de analyse van uitgedrukte prostaatsecreties-urinemonsters en maakt een hoge proteoomdekking en labelvrije profilering van het urine-proteoom met lage ontbrekende waarde mogelijk.
Prestagiacomo, L. E., Gabriele, C., Morelli, P., Rota, M. A., Alba, S., Cuda, G., Damiano, R., Gaspari, M. Proteomic Profile of EPS-Urine through FASP Digestion and Data-Independent Analysis. J. Vis. Exp. (171), e62512, doi:10.3791/62512 (2021).