Journal
/
유전학
/
Informatic analyse av sekvens Data fra satsvis gjær 2-Hybrid-skjermer
JoVE 신문
유전학
JoVE 비디오를 활용하시려면 도서관을 통한 기관 구독이 필요합니다.  전체 비디오를 보시려면 로그인하거나 무료 트라이얼을 시작하세요.
JoVE 신문 유전학
Informatic Analysis of Sequence Data from Batch Yeast 2-Hybrid Screens

Informatic analyse av sekvens Data fra satsvis gjær 2-Hybrid-skjermer

DOI:
10.3791/57802-v

•

09:14 min

•

June 28, 2018

•

, , ,
1Molecular Physiology and Biophysics,University of Iowa

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:50Mapping Fastq Files
  • 02:14Bioinformatics Processing Using DEEPN Software
  • 06:08Verification of Candidates Identified by DEEPN
  • 08:01Conclusion

Summary

자동 번역

자동 번역

Dyp sekvensering av gjær bestander valgt for positiv gjær 2-hybrid interaksjoner potensielt gir et vell av informasjon om samspill partner proteiner. Her beskriver vi spesifikt Bioinformatikk verktøy og tilpassede oppdatert programvare å analysere sekvens data fra slike skjermer.

Tags

Informatic AnalysisSequence DataBatch Yeast 2-hybrid ScreensProtein InteractomesBioinformatics ProcessingUser-friendly Graphic User InterfaceMolecular BiologistsCell BiologistsBiochemistsMAPster SoftwareDEEPN AnalysisHISAT2Multi-threadingReference DNA GenomeY2H Prey Library InsertsMapped FilesUnmapped Reads

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

Konjugerbare Mating Analyser for sekvens-spesifikk analyse av Transfer proteiner involvert i Konjugasjon

Analyse av Transcriptomic<em> C</em>.<em> elegans</em> RNA sekvenseringsdata Gjennom Tuxedo Suite på Galaxy-prosjektet

Toveis retroviral integrasjonssted PCR-metodikk og kvantitativ dataanalyse arbeidsflyt

Eksempel forberedelse og analyse av RNASeq-baserte genuttrykk Data fra sebrafisk

Utforske rot Microbiome: utpakking bakterielle samfunnet Data fra jord, Rhizosphere og rot Endosphere

Ett molekyl fluorescens In Situ hybridisering (smFISH) analyse i spirende gjær vegetativ vekst og meiose

Parring-baserte overuttrykte biblioteket Screening i gjær

Romanen sekvens oppdagelsen av subtraktiv Genomics

Forbedret gjær ett-hybrid-skjermer å identifisere transkripsjon faktor Binding til menneskelig DNA-sekvenser

Samlede CRISPR-baserte genetiske skjermer i pattedyrceller

Read Article