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间歇酵母 2-混合筛序列数据的信息化分析
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Informatic Analysis of Sequence Data from Batch Yeast 2-Hybrid Screens
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Click here for the English version.
间歇酵母 2-混合筛序列数据的信息化分析
DOI:
10.3791/57802-v
•
09:14 min
•
June 28, 2018
•
Venkatramanan Krishnamani
,
Tabitha A. Peterson
,
Robert C. Piper
,
Mark A. Stamnes
1
Molecular Physiology and Biophysics
,
University of Iowa
Chapters
00:04
Title
00:50
Mapping Fastq Files
02:14
Bioinformatics Processing Using DEEPN Software
06:08
Verification of Candidates Identified by DEEPN
08:01
Conclusion
Summary
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酵母菌群的深度测序为阳性酵母 2-混合相互作用可能产生大量的信息关于相互作用的伙伴蛋白。在这里, 我们描述了具体的生物信息学工具的操作和定制的更新软件来分析这些屏幕的序列数据。
Tags
Informatic Analysis
Sequence Data
Batch Yeast 2-hybrid Screens
Protein Interactomes
Bioinformatics Processing
User-friendly Graphic User Interface
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