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Génération d’immunoprécipitation de la chromatine Native séquençage des bibliothèques pour l’analyse de densité de nucléosomes
JoVE 신문
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Generation of Native Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Libraries for Nucleosome Density Analysis
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Génération d’immunoprécipitation de la chromatine Native séquençage des bibliothèques pour l’analyse de densité de nucléosomes

DOI:
10.3791/56085-v

•

10:05 min

•

December 12, 2017

•

, , , ,
1Department of Microbiology and Immunology, Michael Smith Laboratories Centre for High-Throughput Biology,University of British Columbia, 2Canada’s Michael Smith Genome Science Center,BC Cancer Agency

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:51Cell Lysis and Chromatin Digestion for Nucleosome Density ChIP-se
  • 03:21Immunprecipitation Reaction for Nucleosome Density ChIP-seq
  • 04:33Washes and Elution for Nucleosome Density ChIP-seq
  • 07:31Results: Evaluation of Nucleosome Density ChIP-seq Libraries
  • 08:50Conclusion

Summary

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Nous présentons une immunoprécipitation de la chromatine native mis à jour le séquençage (ChIP-seq) méthodologie pour la production d’ensembles de données de séquence pour un cadre d’analyse des nucléosomes densité ChIP-seq intégrant l’accessibilité nucléase micrococcique (MNase) avec mesures de modification d’histone.

Tags

Native Chromatin ImmunoprecipitationNucleosome Density AnalysisEpigeneticsEpigenomic FeaturesChromatin SignaturesMNaseCell PreparationLysis BufferMNase DigestionEDTA

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