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Generación de inmunoprecipitación de la cromatina nativa secuenciación bibliotecas para el análisis de densidad de nucleosoma
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Generation of Native Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Libraries for Nucleosome Density Analysis
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Generación de inmunoprecipitación de la cromatina nativa secuenciación bibliotecas para el análisis de densidad de nucleosoma

DOI:
10.3791/56085-v

•

10:05 min

•

December 12, 2017

•

, , , ,
1Department of Microbiology and Immunology, Michael Smith Laboratories Centre for High-Throughput Biology,University of British Columbia, 2Canada’s Michael Smith Genome Science Center,BC Cancer Agency

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:51Cell Lysis and Chromatin Digestion for Nucleosome Density ChIP-se
  • 03:21Immunprecipitation Reaction for Nucleosome Density ChIP-seq
  • 04:33Washes and Elution for Nucleosome Density ChIP-seq
  • 07:31Results: Evaluation of Nucleosome Density ChIP-seq Libraries
  • 08:50Conclusion

Summary

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Presentamos una inmunoprecipitación de cromatina nativa modificada secuencia (ChIP-seq) metodología para la generación de la secuencia de bases de datos adecuadas para un marco analítico de nucleosoma densidad ChIP-seq, integración de la accesibilidad de la nucleasa micrococcal (MNase) con medidas de modificación de las histonas.

Tags

Native Chromatin ImmunoprecipitationNucleosome Density AnalysisEpigeneticsEpigenomic FeaturesChromatin SignaturesMNaseCell PreparationLysis BufferMNase DigestionEDTA

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