Vi beskriver metoder for manipulering av gener i den evolusjonære modellsystem Astyanax mexicanus. Tre ulike teknikker er beskrevet: Tol2-mediert transgenesis, målrettet manipulering av genomet bruker CRISPR/Cas9 og knockdown uttrykk ved hjelp av morpholinos. Disse verktøyene skal lette direkte etterforskning av gener underliggende variasjon mellom overflaten og hulen boligen skjemaer.