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長さスケール全体で染色体コンフォメーションをキャプチャする

JoVE Journal
Genetics

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JoVE Journal Genetics

Capturing Chromosome Conformation Across Length Scales

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長さスケール全体で染色体コンフォメーションをキャプチャする

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10:15 min

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January 20, 2023

DOI:

10.3791/64001-v

DOI:

10.3791/64001-v

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10:15 min

January 20, 2023

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7 Views

Liyan Yang¹, Betul Akgol Oksuz¹, Job Dekker^1,2, Johan Harmen Gibcus¹

¹Department of Systems Biology,University of Massachusetts Medical School, ²Howard Hughes Medical Institute

Summary

Hi-C 3.0は、ホルムアルデヒドおよびジスクシンイミジルグルタル酸架橋剤をDpnIIおよびDdeI制限酵素のカクテルと組み合わせて、クロマチン相互作用検出のS/N比と分解能を高める改良されたHi-Cプロトコルです。

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