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Erfassung der Chromosomenkonformation über Längenskalen hinweg
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Capturing Chromosome Conformation Across Length Scales
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Erfassung der Chromosomenkonformation über Längenskalen hinweg

Deutsch

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10:15 min

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January 20, 2023

DOI:

10.3791/64001-v

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10.3791/64001-v

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January 20, 2023

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1Department of Systems Biology,University of Massachusetts Medical School, 2Howard Hughes Medical Institute

Summary

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Hi-C 3.0 ist ein verbessertes Hi-C-Protokoll, das Formaldehyd- und Disuccinimidylglutarat-Vernetzer mit einem Cocktail aus DpnII- und DdeI-Restriktionsenzymen kombiniert, um das Signal-Rausch-Verhältnis und die Auflösung der Chromatin-Interaktionsdetektion zu erhöhen.

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Chromosome ConformationDNAChromatinCross-linkingRestriction EndonucleasesLigationLibrary PreparationHi-C3C4C5CSequencingGenomeProtocolDSGFormaldehydeGlycineCell CultureCentrifugationFixation

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Yang, L., Akgol Oksuz, B., Dekker, J., Gibcus, J. H. Capturing Chromosome Conformation Across Length Scales. J. Vis. Exp. (191), e64001, doi:10.3791/64001 (2023).

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