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Isolamento dell'istono dal tessuto fogliare di sorgo per la profilazione della spettrometria di massa dall'alto verso il basso dei potenziali marcatori epigenetici
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Isolation of Histone from Sorghum Leaf Tissue for Top Down Mass Spectrometry Profiling of Potential Epigenetic Markers
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Isolamento dell'istono dal tessuto fogliare di sorgo per la profilazione della spettrometria di massa dall'alto verso il basso dei potenziali marcatori epigenetici

italiano

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07:10 min

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March 04, 2021

DOI:

10.3791/61707-v

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10.3791/61707-v

•

07:10 min
March 04, 2021

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1Environmental Molecular Sciences Laboratory,Pacific Northwest National Laboratory, 2DOE-Joint Genome Institute,Lawrence Berkeley Laboratory, 3Kearney Agricultural Research and Extension Center,University of California Agriculture and Natural Resources, 4West Side Research and Extension Center,University of California, 5Department of Plant Sciences,University of California, Davis, 6Department of Plant and Microbial Biology,University of California, Berkeley

Summary

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Il protocollo è stato sviluppato per estrarre efficacemente istoni intatti dai materiali fogliari di sorgo per la profilazione di modifiche post-tras trasunzionali istone che possono servire come potenziali marcatori epigenetici per aiutare le colture resistenti alla siccità ingegneristica.

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Histone ExtractionSorghumMass SpectrometryEpigenetic MarkersPost-translational ModificationsProtease InhibitorsNuclei Lysis BufferCentrifugation

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Zhou, M., Abdali, S. H., Dilworth, D., Liu, L., Cole, B., Malhan, N., Ahkami, A. H., Winkler, T. E., Hollingsworth, J., Sievert, J., Dahlberg, J., Hutmacher, R., Madera, M., Owiti, J. A., Hixson, K. K., Lemaux, P. G., Jansson, C., Paša-Tolić, L. Isolation of Histone from Sorghum Leaf Tissue for Top Down Mass Spectrometry Profiling of Potential Epigenetic Markers. J. Vis. Exp. (169), e61707, doi:10.3791/61707 (2021).

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