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患者の組織のためのメチル結合DNA捕捉シーケンシング
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Methyl-binding DNA capture Sequencing for Patient Tissues
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患者の組織のためのメチル結合DNA捕捉シーケンシング

日本語

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08:40 min

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October 31, 2016

DOI:

10.3791/54131-v

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10.3791/54131-v

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08:40 min
October 31, 2016

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1Department of Molecular Medicine,University of Texas Health Science Center at San Antonio, 2Greehey Children’s Cancer Research Institute,University of Texas Health Science Center at San Antonio

Summary

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ここでは、メチルDNA結合キャプチャシーケンシング（MBDCap-seqのかMBD-seqの）技術とその後のバイオインフォマティクス解析パイプラインを使用して大規模な臨床患者スクリーニング研究におけるゲノムワイドDNAメチル化を調査するためのプロトコルを提示します。

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DNA MethylationEpigeneticsPatient CohortsBiomarkersMethyl-binding DNA CaptureSequencingGenome-wide AnalysisCost-effectiveSonicationFragment SizeElutionMagnetic Beads

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Jadhav, R. R., Wang, Y. V., Hsu, Y., Liu, J., Garcia, D., Lai, Z., Huang, T. H. M., Jin, V. X. Methyl-binding DNA capture Sequencing for Patient Tissues. J. Vis. Exp. (116), e54131, doi:10.3791/54131 (2016).

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