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Une méthode CLHP lectine pour enrichir sélectivement peptides glycosylés d'échantillons biologiques complexes
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A Lectin HPLC Method to Enrich Selectively-glycosylated Peptides from Complex Biological Samples
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Une méthode CLHP lectine pour enrichir sélectivement peptides glycosylés d'échantillons biologiques complexes

français

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20:23 min

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October 01, 2009

DOI:

10.3791/1398-v

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10.3791/1398-v

•

20:23 min
October 01, 2009

•

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1Obstetrics, Gynecology and Reproductive Sciences,University of California, San Francisco – UCSF, 2Buck Institute for Age Research, 3Department of Chemistry,Purdue University

Summary

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Lectine conjuguée perles POROS étaient employés pour la HPLC. Normes glycopeptides ont servi de contrôles positifs et négatifs. MARS-14 appauvri, digérés par la trypsine plasma humain a été chromatographié et accréditives (FT) et les fractions collectées liés à des analyses ESI-LC-MS/MS. Glycopeptides ont été enrichis dans la fraction liée par rapport à FT.

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Lectin HPLC MethodSelectively-glycosylated PeptidesComplex Biological SamplesGlycansPost-translational ModificationsTumor CellsCancer-associated Glycan VariantsBiomarker DevelopmentLectinsSambucus Nigra (SNA)Aleuria Aurantia (AAL)Affinity MatricesPOROS BeadsPEEK ColumnsHigh Pressure Liquid Chromatography (HPLC)Plasma DepletionMultiple Affinity Removal System (MARS-14)Trypsin-digestionFlow-through FractionBound FractionPNGaseFN-linked GlycansLC-MS/MS AnalysisQStar EliteMascot SoftwarePositive ControlsNegative Controls

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Johansen, E., Schilling, B., Lerch, M., Niles, R. K., Liu, H., Li, B., Allen, S., Hall, S. C., Witkowska, H. E., Regnier, F. E., Gibson, B. W., Fisher, S. J., Drake, P. M. A Lectin HPLC Method to Enrich Selectively-glycosylated Peptides from Complex Biological Samples. J. Vis. Exp. (32), e1398, doi:10.3791/1398 (2009).

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