يمكن التقاط كامل هيكل 3D والمحتوى الخلوي من organoids ، فضلا عن تشابهها الظاهري إلى الأنسجة الأصلية باستخدام تحليل خلية واحدة 3D بروتوكول التصوير الموصوف هنا. يمكن تطبيق هذا البروتوكول على مجموعة واسعة من الأعضاء المختلفة في الأصل والحجم والشكل.