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Analisi dei fattori di espressione del gene del tumore con il portale Web CorExplorer
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JoVE Journal Kanser Araştırmaları
Analyzing Tumor Gene Expression Factors with the CorExplorer Web Portal
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Analisi dei fattori di espressione del gene del tumore con il portale Web CorExplorer

DOI:
10.3791/60431-v

•

08:00 min

•

October 11, 2019

•

, ,
1Lyrid LLC, 2Independent consultant, 3Information Sciences Institute,University of Southern California

Bölümler

  • 00:04Başlık
  • 00:41Exploring Factors Containing a Gene of Interest
  • 03:06Filtering and Interpreting CorEx Factors and Finding Commonalities and Differences of Gene Expression Variation Across Tumor Types
  • 05:49Results: Representative Tumor Gene Expression Factor Analysis
  • 07:31Conclusion

Özet

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Introduciamo il portale web CorExplorer, una risorsa per l'esplorazione dei fattori di sequenziamento dell'RNA tumore trovati dall'algoritmo di apprendimento automatico CorEx (Spiegazione di correlazione), e mostriamo come i fattori possono essere analizzati rispetto alla sopravvivenza, alle annotazioni del database, proteine-proteine, e l'un l'altro per ottenere informazioni sulla biologia del tumore e gli interventi terapeutici.

Etiketler

CorExplorerTumor Gene ExpressionInformation MaximizationLatent FactorsCancer BiologyTCGALung CancerRNA SequencingFactor GraphGene ExpressionBiological DiscoveryGene-factor Associations

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