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Analyse des facteurs d'expression des gènes tumoraux avec le portail Web CorExplorer
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JoVE Journal Kanser Araştırmaları
Analyzing Tumor Gene Expression Factors with the CorExplorer Web Portal
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Analyse des facteurs d'expression des gènes tumoraux avec le portail Web CorExplorer

DOI:
10.3791/60431-v

•

08:00 min

•

October 11, 2019

•

, ,
1Lyrid LLC, 2Independent consultant, 3Information Sciences Institute,University of Southern California

Bölümler

  • 00:04Başlık
  • 00:41Exploring Factors Containing a Gene of Interest
  • 03:06Filtering and Interpreting CorEx Factors and Finding Commonalities and Differences of Gene Expression Variation Across Tumor Types
  • 05:49Results: Representative Tumor Gene Expression Factor Analysis
  • 07:31Conclusion

Özet

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Nous introduisons le portail Web CorExplorer, une ressource pour l'exploration des facteurs de séquençage de l'ARN tumoral trouvés par l'algorithme d'apprentissage automatique CorEx (Correlation Explication), et montrons comment les facteurs peuvent être analysés par rapport à la survie, les annotations de base de données, interactions protéines-protéines, et les uns les autres pour obtenir un aperçu de la biologie tumorale et des interventions thérapeutiques.

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CorExplorerTumor Gene ExpressionInformation MaximizationLatent FactorsCancer BiologyTCGALung CancerRNA SequencingFactor GraphGene ExpressionBiological DiscoveryGene-factor Associations

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