نعرض بروتوكولا خطوة بخطوة للتحقيق في وظيفة الجينات في الضامة المقيمة في الأنسجة البريتونية في الجسم الحي ، باستخدام ناقلات الفيروسات العدسية.
الضامة المقيمة في الأنسجة البريتونية لها وظائف واسعة في الحفاظ على التوازن وتشارك في الأمراض داخل الأنسجة المحلية والمجاورة. وظائفها تمليها الإشارات البيئية الدقيقة. وبالتالي ، من الضروري التحقيق في سلوكهم في مكانة فسيولوجية في الجسم الحي . في الوقت الحالي ، تستخدم منهجيات محددة لاستهداف البلاعم البريتونية نماذج معدلة وراثيا للفأر الكامل. هنا ، يتم وصف بروتوكول للتعديل الفعال في الجسم الحي ل mRNA وأنواع الحمض النووي الريبي الصغيرة (على سبيل المثال ، microRNA) في البلاعم البريتونية باستخدام جزيئات الفيروس العدسي. تم إجراء مستحضرات Lentivirus في خلايا HEK293T وتنقيتها على طبقة سكروز واحدة. كشف التحقق من فعالية الفيروس العدسي في الجسم الحي بعد الحقن داخل الصفاق عن العدوى السائدة للبلاعم المقتصرة على الأنسجة المحلية. كان استهداف البلاعم البريتونية ناجحا أثناء التوازن والتهاب الصفاق الناجم عن الثيوغليكولات. تتم مناقشة قيود البروتوكول ، بما في ذلك الالتهاب منخفض المستوى الناجم عن التوصيل داخل الصفاق لفيروس lentivirus والقيود الزمنية للتجارب المحتملة. بشكل عام ، تقدم هذه الدراسة بروتوكولا سريعا ويمكن الوصول إليه للتقييم السريع لوظيفة الجينات في الضامة البريتونية في الجسم الحي.
البلاعم المقيمة في الأنسجة (Mφ) هي مجموعة غير متجانسة من الخلايا المناعية البلعمية التي تستشعر مسببات الأمراض الغازية وتستجيب لها 1,2. بالإضافة إلى ذلك ، فإنها تلعب دورا أساسيا في تطوير الأنسجة ، وإعادة تشكيلها ، والحفاظ على التوازن 1,3. العديد من الأنسجة Mφ مستمدة من أسلاف كيس الصفار أثناء التطور الجنيني وتستمر في الأنسجة طوال الحياة 4,5. يتم تحديد النمط الظاهري ووظائف هذه الخلايا من خلال التفاعلات التعاونية والهرمية لعوامل النسخ المحددة والبيئة المكرويةالمحلية 6،7،8،9. يزيد الفهم المتزايد لهذه التبعية من الحاجة إلى طرق فعالة في الجسم الحي لمعالجة الجينات ل Mφ ضمن مكانتها ذات الصلة من الناحية الفسيولوجية.
النواقل الفيروسية هي أداة تستخدم بشكل متكرر لمعالجة الأحماض النووية في مجموعات خلايا معينة في الجسم الحي10،11،12 ، لا سيما بسبب قدرتها على إصابة كل من الخلايا المنقسمة وغير المنقسمة والاندماج بثبات في الجينوم المضيف13،14. على مدى العقدين الماضيين ، تم تحسين تقنية توصيل فيروس lentivirus ، وتم التحقيق في المغلفات البديلة والمروجين الاصطناعية لزيادة استهداف النسبالمحدد 8,15. نظرا لانتحاء الخلية الواسع ، أصبح البروتين السكري المغلف بفيروس التهاب الفم الحويصلي (VSV-G)16,17 هو المغلف “القياسي الذهبي” المستخدم في تقنية الفيروسات العدسية.
في هذا البروتوكول18 ، يتم استخدام جزيئات الفيروسات العدسية ذات النمط الكاذب VSV-G لإثبات التوصيل المستهدف والفعال للحمض النووي الريبي قصير الدبوس (shRNA) والحمض النووي الريبي الدقيق (miR) إلى الماوس البريتوني Mφ (pMφ) في الجسم الحي ، في الحالة المستقرة19. كان التعبير الجيني المحوري مدفوعا بمروج فيروس تشكيل تركيز الطحال (SFFV). تم تعريف العدوى المنتجة للخلايا من خلال التعبير عن البروتين الفلوري الأخضر المعزز المشتق من فيروس العدس (GFP). سمح استخدام هذا النهج بقراءات سهلة لتجارب الفيروس العدسي في الجسم الحي لتحديد الجرعة المثلى والإطار الزمني التجريبي. أخيرا ، كشف التحدي الفيروسي العدسي في الجسم الحي للفئران أثناء الالتهاب الناجم عن الثيوغليكولات عن الميل الطبيعي لعدوى pMφ الانتقائية.
تؤدي البلاعم المقيمة في الأنسجة مجموعة من الوظائف الخاصة بالأنسجة الاستتبابيةوالالتهابية 1,2 التي تمليها بيئتهاالفسيولوجية 6،7،8،9. في هذا البروتوكول ، تم تقديم طريقة ?…
The authors have nothing to disclose.
تم تمويل هذا البحث ، كليا أو جزئيا ، من خلال جائزة Wellcome Trust Investigator [107964 / Z / 15 / Z]. يتم دعم P.R.T أيضا من قبل معهد أبحاث الخرف في المملكة المتحدة. يتم دعم MAC من قبل زمالة اكتشاف مجلس أبحاث التكنولوجيا الحيوية والعلوم البيولوجية (BB / T009543 / 1). لغرض الوصول المفتوح ، قام المؤلف بتطبيق ترخيص حقوق الطبع والنشر العام CC BY على أي نسخة مخطوطة مقبولة من المؤلف تنشأ عن هذا التقديم. L.C.D محاضر في جامعة سوانسي وزميل باحث فخري في جامعة كارديف. هذا العمل مدعوم بالعمل الذي قام به Ipseiz et al. 202018.
0.05% Trypsin-EDTA (1x) (Trypsin 500 mg/L or 0.02 mM) | Thermo Fisher Scientific | 25300054 | |
0.22 μm sterile millex GP filter | Merck | SLGS033SS | |
0.45 μm sterile millex GP filter | Merck | SLHP033RS | |
0.5 mL U-100 insulin syringe with needle, 0.33 mm x 12.7 mm (29 G) | BD | 324892 | |
1 Litre Sharps Container | N/A | N/A | |
2.4G2 antibody (TruStain FcX anti-mouse CD16/32) | Biolegend | 101320 | |
40 μm strainer | Thermo Fisher Scientific | 22363547 | |
AimV medium (research grade), AlbuMax Supplement | Thermo Fisher Scientific | 31035025 | |
Blocking buffer | prepared in house | ||
Brewer thioglycolate medium | Sigma-Aldrich | B2551 | 4% stock solution prepared in water, autoclaved and kept frozen. |
CD11b | Biolegend | 101222 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
CD11b | BD | 550993 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
CD11c | Biolegend | 117317 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
CD11c | Biolegend | 117333 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
CD19 | BD | 560375 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
CD19 | Biolegend | 152410 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
CD226 | Biolegend | 128808 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
CD3e | BD | 560527 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
CD3e | Biolegend | 152313 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
CD4 | Biolegend | 100412 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
CD73 | eBioscience | 16-0731-82 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
CD8a | eBioscience | 48-0081-82 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
Cell culture flask (T175 fask, 175 cm2, 550 mL) | Greiner Bio One | 658175 | |
Centrifuge tubes, conical bottom tubes 25 mm x 89 mm | Beckman Coulter | 358126 | |
Centrifuges | Beckman Coulter | Ultracentrifuge and TC centrifuge | |
Collagenase type IV | Sigma-Aldrich | C5138 | |
Conical centrifuge tubes (15 mL and 50 mL) | Greiner Bio One | 11512303 & 11849650 | |
Cryotubes | Greiner Bio One | 123277 | or cryotubes |
DMEM medium (1x) + 4.5g/L D-glucose, 400 µM L-glutamine | Thermo Fisher Scientific | 41965-062 | |
Dnase I | Sigma-Aldrich | 11284932001 | |
Effectene transfection reagent | Qiagen | 301425 | |
F4/80 | Biolegend | 123123 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
F4/80 | Biolegend | 123133 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
F4/80 | Biolegend | 123147 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
FceR1 | eBioscience | 48-5898-80 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
Fetal calf serum (FCS) | Thermo Fisher Scientific | 10270-106 | heat inactivated for 30 min at 56 °C and sterile filtered through 0.22 μm filter |
Flow cytometer | Thermo Fisher Scientific | Attune NxT | |
Flow cytometry (FACS) buffer | prepared in house | ||
Fluorescent tissue culture microscope | Thermo Fisher Scientific | EVOS FL | |
Forceps | N/A | N/A | User preference |
Hank's balanced salt solution (HBSS) | Gibco, Life Technologies | 14175-053 | |
HEK293T cell line | grown for at least a week prior transfection. Mycoplasma free | ||
HIV-1 Core antigen | Beckman Coulter | 6604667 | |
Hyaluronidase | Sigma-Aldrich | H3506 | |
Hydrex surgical scrub, chlorhexiding gluconate 4% w/v skin cleanser | Ecolab | 3037170 | |
I-A/I-E | Biolegend | 107625 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
ICAM1 | Becton Dickinson | 554970 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
Jurkat T cell line | grown for at least a week prior use. Mycoplasma free | ||
LIVE/DEAD fixable near-IR dead cell stain kit | Thermo Fisher Scientific | L34975 | |
Ly6G | Biolegend | 127615 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
Mice | here used C57BL/6 females, aged 8-12 weeks (Charles Rivers), unless specified differently | ||
Microcapillary pipettes (volume range 0.5-1,000 μL) | Fisher Scientific & Starlab | 11963466 & 11943466 & 11973466 & S1111-3700 | |
NK1.1 | Biolegend | 108724 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
Paraformaldehyde | Sigma-Aldrich | P6148-500G | prepared to 2% w/v in PBS |
pCMV-ΔR8.91 packaging plasmid | Zuffrey, R., et al. 1997 | encodes Gag-Pol HIV protein driven by cytomegalovirus promoter. Ampicilin resistance. | |
Penicillin/Streptomycin (100x, 10,000 U/mL) | Thermo Fisher Scientific | 15140122 | |
Petri dish | Greiner Bio One | 664160 | |
pHR'SIN-cPPT-SEW plasmid | Rosas, M. et al. 2014 | modified for shRNA and miR expression studies. Encodes EGFP marker downstream SFFV promoter and upstream of the Woodchuck hepatitiv virus enhancer. Ampicilin resistance. | |
pMD2.G plasmid | Naldini, L. et al. 1996 | encodes vesicular stomatis virus g-glycoprotein (VSV-G) envelope. Ampicilin resistance. | |
Rat IgG1, κ isotype control | Becton Dickinson | 550617 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
Rat serum | Sigma-Aldrich | R9759-10ML | |
Red blood ACK lysis buffer | prepared in house | ||
RPMI 1640 medium (1x) + 400 uM L-glutamine | Thermo Fisher Scientific | 21875-091 | |
Saponin | Sigma-Aldrich | S4521 | |
SiglecF | BD | 562681 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
Sodium hypochlorite Tablets (bleach, 2,000 ppm) | Guest Medical | H8818 | |
Sterile 24-well cell culture plate | Greiner Bio One | 662160 | |
Sterile Dulbecco's PBS (DPBS) (1x) Mg++ and Ca2+ – free | Thermo Fisher Scientific | 14190144 | |
Sterile EDTA | Thermo Fisher Scientific | 15575020 | |
Sterile VWR disposable transfer pipets (23.0 mL, 30 cm) | VWR | 612-4515 | |
Sucrose | Thermo Fisher Scientific | 15503022 | |
surgical scissors | N/A | N/A | User preference |
Syringes (50 mL and 1 0mL) | Fisher Scientific | 10084450 & 768160 | |
Tim4 | Biolegend | 130007 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
U-bottom 96-well cell culture plate | Greiner Bio One | 650180 |