Nous démontrons un protocole étape par étape pour l’étude de la fonction des gènes dans les macrophages résidents du tissu péritonéal in vivo, en utilisant des vecteurs lentiviraux.
Les macrophages résidents du tissu péritonéal ont de larges fonctions dans le maintien de l’homéostasie et sont impliqués dans des pathologies au sein des tissus locaux et voisins. Leurs fonctions sont dictées par des signaux microenvironnementaux ; Ainsi, il est essentiel d’étudier leur comportement dans une niche physiologique in vivo . À l’heure actuelle, des méthodologies spécifiques de ciblage des macrophages péritonéaux utilisent des modèles transgéniques de souris entières. Ici, un protocole pour une modulation in vivo efficace de l’expression de l’ARNm et des petites espèces d’ARN (par exemple, les microARN) dans les macrophages péritonéaux à l’aide de particules de lentivirus est décrit. Des préparations de lentivirus ont été fabriquées dans des cellules HEK293T et purifiées sur une seule couche de saccharose. La validation in vivo de l’efficacité du lentivirus après injection intrapéritonéale a révélé une infection prédominante des macrophages limitée aux tissus locaux. Le ciblage des macrophages péritonéaux a été couronné de succès pendant l’homéostasie et la péritonite induite par les thioglycolates. Les limites du protocole, y compris l’inflammation de faible niveau induite par l’administration intrapéritonéale de lentivirus et les restrictions de temps pour les expériences potentielles, sont discutées. Dans l’ensemble, cette étude présente un protocole rapide et accessible pour l’évaluation rapide de la fonction des gènes dans les macrophages péritonéaux in vivo.
Les macrophages tissulaires (Mφ) sont une population hétérogène de cellules immunitaires phagocytaires qui détectent et répondent aux agents pathogènes envahissants 1,2. De plus, ils jouent un rôle essentiel dans le développement des tissus, le remodelage et le maintien de l’homéostasie 1,3. De nombreux tissus Mφ dérivent des progéniteurs du sac vitellin au cours de l’embryogenèse et persistent dans le tissu tout au long de la vie 4,5. Le phénotype et les fonctions de ces cellules sont dictés par les interactions collaboratives et hiérarchiques de facteurs de transcription spécifiques et du microenvironnement local 6,7,8,9. Une compréhension croissante de cette dépendance augmente le besoin de méthodes in vivo efficaces pour la manipulation génétique de Mφ dans leur niche physiologiquement pertinente.
Les vecteurs lentiviraux sont un outil fréquemment utilisé pour la manipulation des acides nucléiques dans des populations cellulaires spécifiques in vivo 10,11,12, en particulier en raison de leur capacité à infecter à la fois les cellules en division et les cellules non divisées et à s’intégrer de manière stable dans le génome de l’hôte 13,14. Au cours des deux dernières décennies, la technologie d’administration des lentivirus a été optimisée, et des enveloppes alternatives et des promoteurs synthétiques ont été étudiés pour augmenter le ciblage spécifique à la lignée 8,15. En raison de son large tropisme cellulaire, la glycoprotéine d’enveloppe du virus de la stomatite vésiculeuse (VSV-G)16,17 est devenue l’enveloppe de référence utilisée dans la technologie des lentivirus.
Dans ce protocole18, des particules lentivirales pseudotypées VSV-G sont utilisées pour démontrer l’administration ciblée et efficace de l’ARN en épingle à cheveux court (shRNA) et du microARN (miR) à Mφ (pMφ) péritonéal de souris in vivo, à l’état d’équilibre19. L’expression du transgène a été déterminée par le promoteur du virus formant un foyer de la rate (SFFV). L’infection productive des cellules a été définie par l’expression de la protéine fluorescente verte (GFP) améliorée dérivée du lentivirus. L’utilisation de cette approche a permis une lecture facile pour les expériences de lentivirus in vivo afin de définir la dose optimale et la période expérimentale. Enfin, la provocation lentivirale in vivo de souris au cours de l’inflammation induite par le thioglycolate a révélé la propension naturelle à l’infection sélective par pMφ.
Les macrophages résidents dans les tissus remplissent une gamme de fonctions homéostatiques et inflammatoires spécifiques aux tissus 1,2 dictées par leur environnement physiologique 6,7,8,9. Dans ce protocole, une méthode efficace18 de manipulation des macrophages résidents…
The authors have nothing to disclose.
Cette recherche a été financée, en tout ou en partie, par le Wellcome Trust Investigator Award [107964/Z/15/Z]. P.R.T est également soutenu par le UK Dementia Research Institute. M.A.C est soutenu par la bourse de découverte du Conseil de recherches en biotechnologie et en sciences biologiques (BB/T009543/1). Aux fins de l’Open Access, l’auteur a appliqué une licence de droit d’auteur publique CC BY à toute version du manuscrit accepté par l’auteur découlant de cette soumission. L.C.D est maître de conférences à l’Université de Swansea et chercheur honoraire à l’Université de Cardiff. Ces travaux sont étayés par les travaux menés par Ipseiz et al. 202018.
0.05% Trypsin-EDTA (1x) (Trypsin 500 mg/L or 0.02 mM) | Thermo Fisher Scientific | 25300054 | |
0.22 μm sterile millex GP filter | Merck | SLGS033SS | |
0.45 μm sterile millex GP filter | Merck | SLHP033RS | |
0.5 mL U-100 insulin syringe with needle, 0.33 mm x 12.7 mm (29 G) | BD | 324892 | |
1 Litre Sharps Container | N/A | N/A | |
2.4G2 antibody (TruStain FcX anti-mouse CD16/32) | Biolegend | 101320 | |
40 μm strainer | Thermo Fisher Scientific | 22363547 | |
AimV medium (research grade), AlbuMax Supplement | Thermo Fisher Scientific | 31035025 | |
Blocking buffer | prepared in house | ||
Brewer thioglycolate medium | Sigma-Aldrich | B2551 | 4% stock solution prepared in water, autoclaved and kept frozen. |
CD11b | Biolegend | 101222 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
CD11b | BD | 550993 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
CD11c | Biolegend | 117317 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
CD11c | Biolegend | 117333 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
CD19 | BD | 560375 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
CD19 | Biolegend | 152410 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
CD226 | Biolegend | 128808 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
CD3e | BD | 560527 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
CD3e | Biolegend | 152313 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
CD4 | Biolegend | 100412 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
CD73 | eBioscience | 16-0731-82 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
CD8a | eBioscience | 48-0081-82 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
Cell culture flask (T175 fask, 175 cm2, 550 mL) | Greiner Bio One | 658175 | |
Centrifuge tubes, conical bottom tubes 25 mm x 89 mm | Beckman Coulter | 358126 | |
Centrifuges | Beckman Coulter | Ultracentrifuge and TC centrifuge | |
Collagenase type IV | Sigma-Aldrich | C5138 | |
Conical centrifuge tubes (15 mL and 50 mL) | Greiner Bio One | 11512303 & 11849650 | |
Cryotubes | Greiner Bio One | 123277 | or cryotubes |
DMEM medium (1x) + 4.5g/L D-glucose, 400 µM L-glutamine | Thermo Fisher Scientific | 41965-062 | |
Dnase I | Sigma-Aldrich | 11284932001 | |
Effectene transfection reagent | Qiagen | 301425 | |
F4/80 | Biolegend | 123123 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
F4/80 | Biolegend | 123133 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
F4/80 | Biolegend | 123147 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
FceR1 | eBioscience | 48-5898-80 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
Fetal calf serum (FCS) | Thermo Fisher Scientific | 10270-106 | heat inactivated for 30 min at 56 °C and sterile filtered through 0.22 μm filter |
Flow cytometer | Thermo Fisher Scientific | Attune NxT | |
Flow cytometry (FACS) buffer | prepared in house | ||
Fluorescent tissue culture microscope | Thermo Fisher Scientific | EVOS FL | |
Forceps | N/A | N/A | User preference |
Hank's balanced salt solution (HBSS) | Gibco, Life Technologies | 14175-053 | |
HEK293T cell line | grown for at least a week prior transfection. Mycoplasma free | ||
HIV-1 Core antigen | Beckman Coulter | 6604667 | |
Hyaluronidase | Sigma-Aldrich | H3506 | |
Hydrex surgical scrub, chlorhexiding gluconate 4% w/v skin cleanser | Ecolab | 3037170 | |
I-A/I-E | Biolegend | 107625 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
ICAM1 | Becton Dickinson | 554970 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
Jurkat T cell line | grown for at least a week prior use. Mycoplasma free | ||
LIVE/DEAD fixable near-IR dead cell stain kit | Thermo Fisher Scientific | L34975 | |
Ly6G | Biolegend | 127615 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
Mice | here used C57BL/6 females, aged 8-12 weeks (Charles Rivers), unless specified differently | ||
Microcapillary pipettes (volume range 0.5-1,000 μL) | Fisher Scientific & Starlab | 11963466 & 11943466 & 11973466 & S1111-3700 | |
NK1.1 | Biolegend | 108724 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
Paraformaldehyde | Sigma-Aldrich | P6148-500G | prepared to 2% w/v in PBS |
pCMV-ΔR8.91 packaging plasmid | Zuffrey, R., et al. 1997 | encodes Gag-Pol HIV protein driven by cytomegalovirus promoter. Ampicilin resistance. | |
Penicillin/Streptomycin (100x, 10,000 U/mL) | Thermo Fisher Scientific | 15140122 | |
Petri dish | Greiner Bio One | 664160 | |
pHR'SIN-cPPT-SEW plasmid | Rosas, M. et al. 2014 | modified for shRNA and miR expression studies. Encodes EGFP marker downstream SFFV promoter and upstream of the Woodchuck hepatitiv virus enhancer. Ampicilin resistance. | |
pMD2.G plasmid | Naldini, L. et al. 1996 | encodes vesicular stomatis virus g-glycoprotein (VSV-G) envelope. Ampicilin resistance. | |
Rat IgG1, κ isotype control | Becton Dickinson | 550617 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
Rat serum | Sigma-Aldrich | R9759-10ML | |
Red blood ACK lysis buffer | prepared in house | ||
RPMI 1640 medium (1x) + 400 uM L-glutamine | Thermo Fisher Scientific | 21875-091 | |
Saponin | Sigma-Aldrich | S4521 | |
SiglecF | BD | 562681 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
Sodium hypochlorite Tablets (bleach, 2,000 ppm) | Guest Medical | H8818 | |
Sterile 24-well cell culture plate | Greiner Bio One | 662160 | |
Sterile Dulbecco's PBS (DPBS) (1x) Mg++ and Ca2+ – free | Thermo Fisher Scientific | 14190144 | |
Sterile EDTA | Thermo Fisher Scientific | 15575020 | |
Sterile VWR disposable transfer pipets (23.0 mL, 30 cm) | VWR | 612-4515 | |
Sucrose | Thermo Fisher Scientific | 15503022 | |
surgical scissors | N/A | N/A | User preference |
Syringes (50 mL and 1 0mL) | Fisher Scientific | 10084450 & 768160 | |
Tim4 | Biolegend | 130007 | Refer to Table 1 for the dilution and concentration |
U-bottom 96-well cell culture plate | Greiner Bio One | 650180 |