Summary

Aplicação do Sistema Inteligente de Teste de Sensibilidade Antimicrobiana de Alto Rendimento/Phage Screening System e Índice Lar de Resistência Antimicrobiana

Published: July 21, 2023
doi:

Summary

Aqui apresentamos o princípio, a estrutura e a instrução do sistema inteligente de teste de sensibilidade antimicrobiana de alto rendimento/triagem de fagos. Sua aplicação é ilustrada usando Salmonella isolada de aves em Shandong, China, como exemplo. O índice Lar é calculado, e sua importância na avaliação da resistência antimicrobiana é discutida de forma abrangente.

Abstract

Para melhorar a eficiência do teste de sensibilidade antimicrobiana (AST) e da triagem de alto rendimento de fago para bactérias resistentes e reduzir o custo de detecção, um sistema inteligente de triagem de AST/fago de alto rendimento, incluindo um inoculador de matriz de 96 pontos, conversor de aquisição de imagem e software correspondente, foi desenvolvido de acordo com os critérios AST e os pontos de quebra de resistência (R) formulados pelo Clinical & Laboratory Standards Institute (CLSI). AST e estatísticas de distribuição da concentração inibitória mínima (CIM) (de R/8 a 8R) de 1.500 cepas de Salmonella isoladas de aves em Shandong, China, contra 10 agentes antimicrobianos, foram realizadas pelo sistema inteligente de triagem AST/fago de alto rendimento. O índice Lar, que significa “menos antibiose, menor resistência e residual até pouca antibiose”, foi obtido calculando-se a média ponderada de cada CIM e dividindo-se por R. Essa abordagem melhora a acurácia em comparação com o uso da prevalência de resistência para caracterizar o grau de resistência antimicrobiana (RAM) de cepas altamente resistentes. Para as cepas de Salmonella com alto AMR, fagos líticos foram eficientemente selecionados da biblioteca de fagos por este sistema, e o espectro de lise foi computado e analisado. Os resultados mostraram que o sistema inteligente de triagem AST/fago de alto rendimento era operável, preciso, altamente eficiente, barato e de fácil manutenção. Combinado com o sistema de monitoramento da resistência antimicrobiana veterinária Shandong, o sistema foi adequado para pesquisa científica e detecção clínica relacionada à RAM.

Introduction

Como os agentes antimicrobianos têm sido amplamente utilizados na prevenção de doenças infecciosas bacterianas, a resistência antimicrobiana (RAM) tornou-se um problema de saúde pública mundial1. O combate à RAM é a principal missão atual de monitoramento da RAM de patógenos epidemiológicos e terapia sinérgica de agentes antimicrobianos sensíveis e bacteriófagos líticos2.

O teste de sensibilidade antimicrobiana in vitro (AST) é a base para monitorar a terapia e detectar o nível de RAM. É uma parte importante da farmacologia antimicrobiana e a base crítica para a medicação clínica. O Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) dos Estados Unidos e o European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) formularam e revisaram critérios internacionais de AST e continuamente modificaram e complementaram os métodos AST e os pontos de interrupção para determinar a CIM de uma determinada combinação “organismo e agente antimicrobiano” como sensível (S), resistente (R) ou intermediário (I)3, .

Entre as décadas de 1980 e 1990, instrumentos automáticos de microdiluição em caldo foram rapidamente desenvolvidos e aplicados à prática clínica, com exemplos como Alfred 60AST, VITEK System, PHOENIX® e Cobasbact 5,6,7. No entanto, esses instrumentos eram caros, exigiam consumíveis de alto custo e suas faixas de detecção foram projetadas para medicação clínica do paciente 5,6,7. Por essas razões, não são adequados para exame clínico veterinário e detecção de grandes quantidades de cepas altamente resistentes. Neste estudo, um sistema inteligente de triagem AST/fago de alto rendimento, incluindo um inoculador de matriz de 96 pontos (Figura 1), conversor de aquisição de imagens (Figura 2) e software correspondente8, foi desenvolvido para conduzir AST para um lote de cepas de bactérias contra múltiplos agentes antimicrobianos ao mesmo tempo pelo método de diluição em ágar. Além disso, o sistema também foi usado para detectar e analisar os padrões de lise de fagos contra bactérias resistentes a antimicrobianos9, e fagos líticos foram selecionados eficientemente da biblioteca de fagos. Este sistema mostrou-se eficiente, acessível e fácil de operar.

Figure 1
Figura 1: Diagrama estrutural do inoculador matricial de 96 pontos. 1: Placa de pino de inoculação; 2: Operadora de celular; 3: Bloco de sementes; 4: Placa incubada; 5: Base; 6: Alça de operação; 7: Pino de limite. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figure 2
Figura 2: Diagrama estrutural do conversor de aquisição de imagens. 1: Concha; 2: Tela de exibição; 3: Sala de aquisição de imagens; 4: Base da placa de detecção; 5: Placa de detecção dentro e fora do armazém; 6: Placa de controle; 7: Aparelho de conversão para aquisição de imagens; 8: Fonte de luz; 9: Scanner de imagem. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Protocol

As cepas de Salmonella utilizadas neste estudo foram coletadas de aves de capoeira em Shandong, China, após aprovação do Comitê de Biossegurança do Instituto de Ciências Animais e Medicina Veterinária da Academia de Ciências Agrárias de Shandong, China. 1. Aplicação do sistema AST inteligente de alto rendimento8 Preparação do inóculoIncubar o organismo de controle de qualidade Escherichia coli e 93 cepas…

Representative Results

Seguindo o protocolo do sistema AST inteligente de alto rendimento, sua aplicação foi ilustrada por Salmonella de aves de Shandong, China, como exemplo. O crescimento de cepas de Salmonella em placas de ágar com ampicilina (R de 32 μg/mL) nas concentrações de 2 a 256 μg/mL determinadas pelo conversor de aquisição de imagens é mostrado na Figura 3. O1º poço horizontal A1 foi o controle negativo e não apresentou crescimento …

Discussion

O método de diluição em ágar foi bem estabelecido e amplamente utilizado. O princípio do sistema AST de alto rendimento foi o método de diluição em ágar. Uma das etapas críticas dentro do protocolo foi a transferência precisa de alto rendimento de 96 inóculos de uma só vez, que foi realizada várias vezes seguidas. Para completar esta etapa crítica, os pinos do inoculador de matriz de 96 pontos foram uniformes e muito lisos. A deposição natural de cada pino foi um volume de aproximadamente 2 μL, que se a…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Este trabalho foi apoiado pelo National Key Research and Development Project (2019YFA0904003); Sistema Industrial Agrícola Moderno na Província de Shandong (SDAIT-011-09); Projeto de Otimização de Plataforma de Cooperação Internacional (CXGC2023G15); Principais tarefas de inovação do projeto de inovação de ciência e tecnologia agrícola da Academia de Ciências Agrárias de Shandong, China (CXGC2023G03).

Materials

96 well  culture plate Beijing lanjieke Technology Co., Ltd 11510
96-dot matrix AST image acquisition system Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Academy of Agricultural Sciences In-house software copyright
96-dot matrix inoculator  Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Academy of Agricultural Sciences N/A Patented product
Agar Qingdao hi tech Industrial Park Haibo Biotechnology Co., Ltd HB8274-1
Amikacin  Shanghai McLean Biochemical Technology Co., Ltd A857053
Amoxicillin Shanghai McLean Biochemical Technology Co., Ltd A822839
Ampicillin Shanghai McLean Biochemical Technology Co., Ltd A830931
Analytical balance Sartorius BSA224S
Automated calculation software for Lar index of AMR Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Academy of Agricultural Sciences In-house software copyright
Bacteria Salmonella strains Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Academy of Agricultural Sciences N/A Animal origin
Bacterial resistance Lar index certification management system V1.0 Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Academy of Agricultural Sciences In-house software copyright
Ceftiofur Shanghai McLean Biochemical Technology Co., Ltd C873619
Ciprofloxacin Shanghai McLean Biochemical Technology Co., Ltd C824343
Clavulanic acid Shanghai McLean Biochemical Technology Co., Ltd C824181
Clean worktable Suzhou purification equipment Co., Ltd SW-CJ-2D
Colistin sulfate Shanghai McLean Biochemical Technology Co., Ltd C805491
Culture plate Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Academy of Agricultural Sciences N/A Patented product
Doxycycline Shanghai McLean Biochemical Technology Co., Ltd D832390
Enrofloxacin Shanghai McLean Biochemical Technology Co., Ltd E809130
Filter 0.22 μm Millipore SLGP033RB
Florfenicol Shanghai McLean Biochemical Technology Co., Ltd F809685
Gentamicin Shanghai McLean Biochemical Technology Co., Ltd G810322
Glass bottle 50 mL Xuzhou Qianxing Glass Technology Co., Ltd QX-7
High-throughput resistance detection system V1.0 Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Academy of Agricultural Sciences In-house software copyright
Image acquisition converter Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Academy of Agricultural Sciences N/A Patented product
Meropenem Shanghai McLean Biochemical Technology Co., Ltd M861173
Mueller-Hinton agar Qingdao hi tech Industrial Park Haibo Biotechnology Co., Ltd HB6232
Petri dish 60 mm x 15 mm Qingdao Jindian biochemical equipment Co., Ltd 16021-1
Petri dish 90 mm x 15 mm Qingdao Jindian biochemical equipment Co., Ltd 16001-1
Salmonella phages Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Academy of Agricultural Sciences N/A
Shaker incubator Shanghai Minquan Instrument Co., Ltd MQD-S2R
Turbidimeter Shanghai XingBai Biotechnology Co., Ltd F-TC2015
Varms base type library system V1.0 Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Academy of Agricultural Sciences In-house software copyright
Vertical high-pressure steam sterilizer Shanghai Shen'an medical instrument factory LDZX-75L
Veterinary pathogen resistance testing management system Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Academy of Agricultural Sciences In-house software copyright
Veterinary resistance cloud monitoring and phage control platform V1.0 Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Academy of Agricultural Sciences In-house software copyright

References

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Hu, M., Liu, Z., Song, Z., Li, L., Zhao, X., Luo, Y., Zhang, Q., Chen, Y., Xu, X., Dong, Y., Hrabchenko, N., Zhang, W., Liu, Y. Application of the Intelligent High-Throughput Antimicrobial Sensitivity Testing/Phage Screening System and Lar Index of Antimicrobial Resistance. J. Vis. Exp. (197), e64785, doi:10.3791/64785 (2023).

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