Dieses Protokoll beschreibt die Verwendung kommerzieller, zellfreier Proteinexpressionskits zur Herstellung von Membranproteinen, die in Nanodisc unterstützt werden und als Antigene in Subunit-Impfstoffen verwendet werden können.
Subunit-Impfstoffe bieten Vorteile gegenüber herkömmlichen inaktivierten oder abgeschwächten Ganzzell-Impfstoffen in Bezug auf Sicherheit, Stabilität und Standardherstellung. Um einen wirksamen proteinbasierten Subunit-Impfstoff zu erhalten, muss das Proteinantigen oft eine native Konformation annehmen. Dies ist besonders wichtig für Pathogen-Oberflächenantigene, bei denen es sich um membrangebundene Proteine handelt. Zellfreie Methoden wurden erfolgreich eingesetzt, um korrekt gefaltetes funktionelles Membranprotein durch die Co-Translation von Nanolipoproteinpartikeln (NLPs), allgemein bekannt als Nanodiscs, herzustellen.
Mit dieser Strategie können Untereinheiten-Impfstoffe hergestellt werden, die aus Membranproteinen in einer lipidgebundenen Umgebung bestehen. Die zellfreie Proteinproduktion ist jedoch oft auf den kleinen Maßstab (<1 ml) beschränkt. Die Menge an Protein, die in kleinen Produktionsläufen produziert wird, reicht in der Regel für biochemische und biophysikalische Studien aus. Der zellfreie Prozess muss jedoch skaliert, optimiert und sorgfältig getestet werden, um genügend Protein für Impfstoffstudien in Tiermodellen zu erhalten. Andere Prozesse, die an der Impfstoffherstellung beteiligt sind, wie z. B. die Reinigung, die Adjuvans-Zugabe und die Gefriertrocknung, müssen parallel optimiert werden. In diesem Artikel wird über die Entwicklung eines skalierten Protokolls zur Expression, Reinigung und Formulierung eines membrangebundenen Proteinuntereinheitsimpfstoffs berichtet.
Skalierte zellfreie Reaktionen erfordern eine Optimierung der Plasmidkonzentrationen und -verhältnisse bei der Verwendung mehrerer Plasmidexpressionsvektoren, der Lipidauswahl und der Adjuvansaddition für die Herstellung von formulierten Nanolipoproteinpartikeln auf hohem Niveau. Die Methode wird hier mit der Expression eines Chlamydien-Hauptmembranproteins (MOMP) demonstriert, kann aber auch auf andere Membranproteinantigene angewendet werden. Die Wirksamkeit von Antigenen kann in vivo durch Immunisierungsstudien zur Messung der Antikörperproduktion bewertet werden, wie hier gezeigt.
Prokaryotische oder eukaryotische Lysate für die zellfreie Expression von Proteinen sind als kommerzielle Produkte für die Synthese von Proteinen von Interesse leicht erhältlich (für eine vollständige Übersicht siehe 1). Diese Expressionssysteme sind in verschiedenen Größenordnungen verfügbar und verwenden Lysate aus verschiedenen Organismen, darunter E. coli, Tabakpflanzen und Säugetierkulturen. Zellfreie Lysate bieten mehrere Vorteile gegenüber herkömmlichen rekombinanten Proteinproduktionsansätzen, darunter Benutzerfreundlichkeit und robuste, schnelle Proteinproduktion. Während diese Ansätze in erster Linie zur Herstellung löslicher Proteine verwendet werden, hat diese Gruppe einen Ansatz für ihre Verwendung zur Expression von Membranproteinen entwickelt.
Dieser neuartige Ansatz nimmt geringfügige Modifikationen an bestehenden zellfreien Expressionssystemen vor, indem er DNA einbezieht, die für zwei Proteinprodukte für die Expression kodiert, ein Apolipoprotein und das Membranprotein von Interesse. Das exprimierte Apolipoprotein (Derivate von ApoA1 oder ApoE4) interagiert mit Lipiden, die dem zellfreien Lysat zugesetzt werden, um spontan (~20 nm) NLPs zusammenzusetzen. Bei Co-Translation mit einem interessierenden Membranprotein bilden das NLP und das Membranprotein einen löslichen Nanopartikelkomplex, wobei das Membranprotein in die NLP-Lipiddoppelschicht eingebettet ist. Somit ist das Membranprotein für nachgelagerte Anwendungen leichter zugänglich, da es in löslichen, diskreten Partikeln enthalten ist. Dieser Ansatz kann funktionelle oligomere Proteinkomplexe innerhalb der NLP-Doppelschicht2 erzeugen und die Antigenkomponente eines Untereinheitsimpfstoffs herstellen, der anschließend mit lipophilen Adjuvantien gemischt wird, um einen Nanopartikel-Impfstoff mit kolokalisiertem Antigen und Adjuvans zu bilden, der für die In-vivo-Bewertung geeignet ist.
Dieses aktuelle Verfahren ist eine Modifikation eines zuvor veröffentlichten Protokolls3. Wesentliche Modifikationen konzentrieren sich auf das Scale-up der zellfreien Reaktion und die anschließende Aufreinigung des Protein-NLP-Komplexes. Eine weitere Modifikation beinhaltet die Zugabe eines amphiphilen Polymers, das als Telodendrimer bekannt ist, das zunächst mit den Lipiden vermischt wird, bevor es zur zellfreien Reaktion hinzugefügt wird. Die Co-Translation der Plasmide in Gegenwart des Telodendrimers und der Lipide erzeugt ein Telodendrimer NLP (tNLP). Die Zugabe des Telodendrimers trägt auch dazu bei, die Größe und Monodispersität der resultierenden tNLP-Nanopartikel zu modulieren4. Dieses Protokoll ist speziell für groß angelegte Impfstoffstudien optimiert, um ein membrangebundenes Untereinheits-Antigenprotein, Chlamydien MOMP5,6, herzustellen. Die Methode erzeugt rekombinantes MOMP, das mit tNLP assoziiert ist, um einen hochlöslichen MOMP-tNLP-Komplex zu bilden, der die MOMP-Oligomerisierung beibehält. Eine typische 3-ml-Scale-up-Produktion ergibt >1,5 mg gereinigtes MOMP. Das zellfrei hergestellte MOMP-tNLP ist für eine schnelle adjuvante Zugabe für In-vivo-Immunogenitätstests geeignet.
Chlamydien sind die häufigste sexuell übertragbare Infektion, die sowohl Männer als auch Frauen betrifft. Obwohl sich die Impfstoffforschung zu Chlamydien über Jahrzehnte erstreckt, ist ein sicherer und wirksamer Impfstoff, der auf die Massenproduktion skaliert werden kann, nach wie vor schwer zu finden13. Das Chlamydien-MOMP gilt als Hauptkandidat als schützendes Impfantigen; MOMP ist jedoch stark hydrophob und anfällig für falsche Faltungen14,15. Weitere Studien haben gezeigt, dass MOMP in oligomeren Zuständen existiert, die für seine Immunogenität unerlässlich sind11. Hier wird eine validierte, zellfreie Co-Expressionsmethode beschrieben, die oligomeres MOMP produziert, das in tNLP-Nanopartikeln als Impfstoff gebildet wird, mit Ausbeuten von ca. 1,5 mg gereinigtem MOMP pro 3 ml Lysat. Dieses vollständig zusammengetragene Verfahren kann für die industrielle Produktion weiter skaliert werden, was seine Aussichten als nützlicher Ansatz für die Herstellung von Impfstoffen erhöht.
Wir haben bereits über die Verwendung der zellfreien Expression zur Herstellung von Membranproteinen, die in NLPseingebettet sind, 3,16 sowie über die Expression in Telodendrimer-stabilisierten Scheiben veröffentlicht. Diese letztere Technik erzeugte jedoch Membranproteinpartikel mit größerer Heterogenität und geringerer Löslichkeit. 4 Darüber hinaus ist die Immunogenität von MOMP-Telodendrimer-Partikeln im Vergleich zu MOMP-tNLP-Partikeln unklar6.
Dieses Verfahren kann angepasst werden, um die Expression von bakteriellen Membranproteinen zu erhöhen, die vielversprechende Kandidaten als Antigene für den Einsatz in Subunit-Impfstoffen sind. Dieses Verfahren erzeugt nicht nur ein gelöstes bakterielles Membranprotein, sondern die gesamte Nanopartikelstruktur ist auch für eine weitere Modifikation mit einer Vielzahl von lipophilen Impfstoffadjuvantien zugänglich, einschließlich, aber nicht beschränkt auf CpG, das an einen Cholesterinanteil oder FSL-1 konjugiert ist. Die Expression anderer Antigenkandidaten aus Bakterien ist möglich, obwohl Parameter wie Expressionstemperatur, Lipidwahl und Art des Expressionssystems möglicherweise untersucht werden müssen, um optimale Ausbeuten zu erzielen.
Darüber hinaus sind die Wahl und das Verhältnis der Plasmide in diesem Prozess entscheidend. Beide verwendeten Plasmide sollten aus dem gleichen Rückgrat aufgebaut sein. Wenn die Inserts annähernd gleich lang sind, können die Verhältnisse auf der Masse des zugegebenen Plasmids basieren, wie hier beschrieben. Die Verhältnisierung auf der Grundlage von Molen führt jedoch zu reproduzierbareren Ergebnissen, insbesondere bei der Skalierung der Reaktionen. Verhältnisse, die bei Reaktionen im Bildschirmmaßstab gut funktionieren (< 0,5 ml), sind möglicherweise nicht auf größere Reaktionen anwendbar und erfordern möglicherweise zusätzliche Optimierungen. Nicht-Membranproteine können weiterhin mit zellfreien Kits exprimiert werden, benötigen jedoch möglicherweise nicht das Lipid-Nanopartikel (Co-Expression), um ein lösliches Produkt zu produzieren. Während dieses Protokoll die Adjuvantierung mit CpG und FSL-1 beschreibt, ist dieses System für die Formulierung mit anderen lipophilen Adjuvantien oder das Mischen mit löslichen Adjuvantien nach Wunsch zugänglich.
Es ist wichtig, bei der Einrichtung der zellfreien Expressionsreaktion eine Kontamination zu vermeiden, da dies die Ausbeute beeinträchtigen kann. Alle Zusätze zur Reaktion, einschließlich der Plasmide selbst, sollten hochrein sein. Darüber hinaus sollten die exprimierten Proteine nur mit Materialien und Lösungen in Kontakt kommen, die frei von Endotoxin-Kontamination sind. Eine Endotoxin-Kontamination in Formulierungskandidaten kann zu inkonsistenten und falschen Ergebnissen immunologischer Assays führen und in ausreichenden Mengen schädlich sein. Obwohl hier nicht beschrieben, kann eine zusätzliche Reinigung nach der Nickelaffinitätschromatographie erforderlich sein, wenn viele Verunreinigungen in nachfolgenden Analyseschritten wie z. B. DURCH SDS-PAGE beobachtet werden. Dies könnte mit SEC erreicht werden, obwohl die Bedingungen möglicherweise von Formulierung zu Formulierung optimiert werden müssen.
The authors have nothing to disclose.
Diese Arbeit wurde durch den Zuschuss des Public Health Service R21 AI20925 und U19 AI144184 des National Institute of Allergy and Infectious Diseases unterstützt. Diese Arbeit wurde unter der Schirmherrschaft des U.S. Department of Energy vom Lawrence Livermore National Laboratory unter dem Vertrag DE-AC52-07NA27344 [LLNL-JRNL-822525, LLNL-VIDEO-832788] durchgeführt.
1,2-dimyristoyl-sn-glycero-3-phosphocholine (DMPC) as powder | Avanti Polar Lipids | 850345 | |
1.5 mL endotoxin-free centrifuge tubes | Eppendorf | 2600028 | |
1 M Trizma hydrochloride solution | Millipore Sigma | T2194 | |
Acetic acid, glacial, ACS reagent, ≥99.7% | Millipore Sigma | 695092 | |
Bio-Dot apparatus | Bio-Rad | 1706545 | |
Buffer Dam for XCell SureLock | Life Technologies | EI0012 | |
C24 Incubator shaker | New Brunswick Scientific | ||
Cell-Free Expression System: RTS 500 ProteoMaster E. coli HY Kit | BiotechRabbit | BR1400201 | |
cOmplete His-Tag Purification Resin | Roche Molecular Diagnostics | 5893682001 | |
cOmplete, EDTA-free Protease Inhibitor Cocktail | Roche Molecular Diagnostics | 4693132001 | |
CpG-ODN1826 | Biosearch Technologies | T9449 | |
D-(+)-Trehalose dihydrate | Millipore Sigma | 71509 | |
Dialysis tubes D-Tube Dialyzer Maxi | Millipore Sigma | 71508-3 | |
Disposable, polypropylene fritted columns 10 mL capacity | Bio-Rad | 7311550EDU | |
Dulbecco’s Phosphate-buffered Saline (PBS) | Millipore Sigma | D8537 | |
Electrophoresis Power Supply | |||
Endosafe PTS cartridge | Thermo Fisher Scientific | NC9594798 | |
Endosafe-PTS Testing System | Charles River | ||
Gel wash solution: 10% methanol, 7% acetic acid | |||
HCl and NaOH solutions for pH adjustment | |||
HPLC with UV-vis diode array detector | Shimadzu | ||
HyClone HyPure culture-grade water | VWR | 82007-328 | |
iBlot 2 Dry Blotting System | Life Technologies | ||
iBlot 2 Transfer Stacks, PVDF | Life Technologies | IB24001 | |
Image Studio V2.0 software | Li-COR Biiosciences | ||
Imidazole | Millipore Sigma | I5513 | |
Immun-Blot PVDF Membrane | Bio-Rad | 1620177 | |
LI-COR Odyssey Fc imager | Li-COR Biiosciences | ||
Lyophilizer | Labconco | ||
Methanol (≥99.9%) | Millipore Sigma | 34860 | |
Microcentrifuge | |||
Microwave oven | |||
NanoDrop One/OneC Microvolume UV-Vis Spectrophotometer | Thermo Fisher Scientific | ND-ONE-W | |
NuPAGE 4 to 12%, Bis-Tris, 1.0 mm | Life Technologies | NP0321 | |
NuPAGE LDS Sample Buffer (4x) | Life Technologies | NP0007 | |
NuPAGE MES SDS Running Buffer (20x) | Life Technologies | NP000202 | |
NuPAGE Sample Reducing Agent (10x) | Life Technologies | NP0009 | |
Odyssey Blocking Buffer in TBS containing 0.2% Tween 20 | Li-COR Biosciences | 927-50000 | |
Orbital Shaker | |||
PBS-T (1x PBS, 0.2% Tween 20, pH 7.4) | |||
PEG5K-CA8 Telodendrimer (custom synthesis product) | |||
pIVEX2.4d vector | Roche Molecular Diagnostics | ||
Plasmid Maxi Kit | Qiagen | 12162 | |
Primary antibody: MAb40 (monoclonal antibody to the variable domain 1 (VD1) of C. muridarum MOMP, de la Maza laboratory)4 | |||
Primary antibody: MAbHIS, Penta-His antibody | Qiagen | 34660 | |
Probe sonicator | |||
Qubit 3.0 Fluorometer | Life Technologies | Q33216 | |
Qubit Protein Assay Kit | Life Technologies | Q33212 | |
Rainin Pipette tips: LTS 1000 µL | Rainin | 17002428 | |
Rainin Pipette tips: LTS 20 µL | Rainin | 17002429 | |
Rainin Pipette tips: LTS 200 µL | Rainin | 17002426 | |
Rainin Pipettes | Rainin | ||
Secondary antibody: IRDye 800CW goat (polyclonal) anti-mouse IgG (heavy and light) | Li-COR Biosciences | 926-32210 | |
SeeBlue Plus2 Pre-stained Protein Standard | Life Technologies | LC5925 | |
Sodium chloride NaCl | Millipore Sigma | S7653 | |
Sodium phosphate monobasic NaH2PO4 | Millipore Sigma | S0751 | |
Superdex 200, 5/150 GL column | Cytiva | GE28-9909-45 | |
Synthetic diacylated lipoprotein-TLR2/6 FSL-1 | Invivogen | tlrl-fsl | |
SYPRO Ruby Protein Gel Stain | Life Technologies | S12001 | |
TWEEN 20 | Millipore Sigma | P1379 | |
UV light source | |||
Vacufuge Bench Top Centrifuge | Eppendorf | ||
Vortexer | |||
VWR 15 mL conicals (89039-666) | VWR | ||
VWR 50 mL conicals (89039-656) | VWR | ||
XCell SureLock Mini-Cell (Life Technologies ) | Life Technologies | EI0001 |