В этой статье описывается процесс сборки и работы сканирующего фотосинтетического биореактора, который может использоваться совместно с другими методами для оценки соответствующих параметров кинетического роста. Эта система постоянно контролирует pH, свет и температуру с помощью датчиков, блока сбора данных и управления и программного обеспечения для сбора данных с открытым исходным кодом.
Оптимальная конструкция и работа фотосинтетических биореакторов (PBR) для культивирования микроводорослей необходимы для улучшения экологической и экономической эффективности производства биотоплива на основе микроводорослей. Модели, которые оценивают рост микрогалактики в разных условиях, могут помочь оптимизировать дизайн и работу PBR. Чтобы быть эффективными, параметры роста, используемые в этих моделях, должны быть точно определены. Эксперименты по выращиванию водорослей часто ограничиваются динамическим характером среды культуры, и для точного определения кинетических параметров необходимы системы управления. Первым шагом в настройке контролируемого пакетного эксперимента является сбор и мониторинг живых данных. В этом протоколе описывается процесс сборки и работы сканирующего фотосинтетического биореактора, который можно использовать для проведения экспериментов по выращиванию микрогалактик. В этом протоколе описывается, как определять размер и собирать планшетный PBR с акриловым покрытием. В нем также описывается, как настроитьRe PBR с непрерывным контролем pH, света и температуры с использованием блока сбора и управления данными, аналоговых датчиков и программного обеспечения для сбора данных с открытым исходным кодом.
Из-за растущей озабоченности по поводу глобального изменения климата и конечных ресурсов ископаемого топлива правительства разрабатывают политику сокращения потребления ископаемого топлива и поощряют разработку новых устойчивых транспортных топлив. Агентство по охране окружающей среды Соединенных Штатов разработало стандарт возобновляемого топлива (RFS), в соответствии с которым к 2022 году из возобновляемых источников топлива будет приходиться 36 из 140 миллиардов галлонов американской топливной смеси. Источники и трансформационные технологии будут необходимы для удовлетворения этих и Будущие стандарты в области возобновляемых источников энергии 1 .
Использование биотоплива на основе микроводорослей может помочь удовлетворить национальные RFS при одновременном снижении выбросов парниковых газов 2 . Биотопливо на основе микроводорослей имеет несколько преимуществ по сравнению с биотопливом первого поколения на основе наземных продовольственных культур, таких как кукуруза и соевые бобы. В отличие от биотоплива первого поколения, водоросли-bПоскольку биотопливо потребляет меньше земли, воды и связанных с продовольствием ресурсов, поскольку водоросли можно выращивать круглый год и на бесплодных землях с использованием соленой воды или сточных вод. Микроводоросли имеют высокие темпы роста по сравнению с наземными культурами и могут накапливать высокие уровни липидов, которые могут быть легко преобразованы в биодизель 3 . В настоящее время не существует промышленных установок для производства водорослей и биотоплива из-за высоких издержек энергоемких производственных процессов, которые состоят из культивирования водорослей, разделения липидов и переработки липидов в биодизель. Необходимы дополнительные исследования, чтобы сделать эти процессы более эффективными и устойчивыми.
PBR, которые являются оптически прозрачными закрытыми установками для производства фототрофных микроорганизмов в искусственной среде, считаются одним из наиболее перспективных методов культивации 3 . Тем не менее, в нынешних конструкциях по-прежнему отсутствует объемная производительность, необходимая для производства процесса производства водорослей и биотопливаБолее эффективны и экономически привлекательны 4 . Мощные математические модели, которые учитывают световую освещенность и затухание, транспортировку питательных веществ и CO 2 , а также рост микроводорослей, могут значительно облегчить оптимизацию конструкции и работы PBR. Для определения видоспецифических параметров роста для этих моделей оптимизации требуются эксперименты по наращиванию скамьи.
Кинетические испытания требуют тщательного мониторинга и контроля экспериментальных установок для предотвращения непреднамеренных ингибиторов роста. Учитывая фотосинтетический характер водорослей ( т. Е. Их потребление CO 2 и поглощение света), поддержание контролируемых условий особенно затруднено в настольных PBR. Как показано в уравнении 1 , количество растворенного СО 2 в ростовой среде, обычно обозначаемое как ( Уравнение 2 ), будет, как минимум,Функция: 1) парциального давления CO 2 и константы равновесия Генри, которая определяет количество газа, которое растворяется в растворе ( уравнение 3 ); 2) начальный химический состав среды роста, который влияет на видообразование и активность ионов карбоната и рН ( уравнения 4 и 5 ); И 3) температура, которая воздействует на уравнения 3-5 5 .
Различные фазы и химическое образование углерода создают проблему для измерения и поддержания постоянной концентрации растворенного углерода в пределах PBR, которыйLe, сохраняя другие условия постоянными ( например, pH увеличивается, поскольку водоросли потребляют CO 2 , а увеличение растворенного субстрата CO 2 может привести к кислой среде, которая препятствует росту).
Дополнительный уровень сложности для контроля условий во время кинетических испытаний водорослей включает интенсивность света внутри PBR. Средняя интенсивность света внутри PBR зависит не только от интенсивности падающего света, но и от конструкции ( например, материала, формы, глубины и смешивания), абсорбции компонентов биомассы водорослей (особенно хлорофилла) Рассеивающие свойства водорослевых клеток. По мере роста водорослей средняя интенсивность света будет уменьшаться. Это изменение интенсивности света, вызванное увеличением общих клеток и биомассы, увеличением содержания хлорофилла на клетку или и тем, и другим, может в конечном итоге вызвать метаболический ответ, такой как увеличение производства хлорофиллаНа клетку или использование продуктов для хранения углеводов и липидов для энергии 7 . Непосредственный мониторинг интенсивности света внутри реактора дает бесценную информацию. Эти данные могут помочь обеспечить сохранение условий в пределах определенного диапазона и могут быть использованы для оценки параметров роста водорослей и абсорбции в сочетании с другими измерениями ( например, биомасса, концентрация хлорофилла, глубина реактора, падающий свет и т . Д.).
Понимание того, как растут водоросли в определенных условиях, требует, чтобы в экспериментальных кинетических экспериментах контролировались рН, растворенный СО 2 , интенсивность света и температура. Многие установки роста водорослей не оборудованы для мониторинга условий в объеме, необходимом для калибровки кинетических моделей, что делает процесс моделирования чрезвычайно сложным 8 . Несмотря на то, что многие компании предлагают комплексные PBR с автоматизацией и контролем, эти сканерыЕ настройки могут быть чрезвычайно дорогими (~ 20 000 долларов США) и могут не учитывать все экспериментальные соображения данного исследовательского вопроса.
Первым шагом в создании системы обратной связи для пакетного эксперимента является сбор данных в реальном времени. Настоящая статья призвана продемонстрировать, как построить и настроить настольную PBR, оборудованную непрерывным светом, pH и контролем температуры. Эта настройка мониторинга в реальном времени может помочь обеспечить условия эксперимента в пределах желаемого диапазона, по усмотрению исследователя. Хотя этот протокол не описывает конкретные механизмы управления, эти пошаговые инструкции обеспечивают базовую основу для структуры сбора данных, требуемой до того, как могут быть реализованы более сложные контрольные обратные связи.
Эта система PBR предлагает возможность контролировать и контролировать экспериментальные эксперименты по кинетическому росту в масштабе всей скважины, позволяя получить более повторяемые результаты экспериментальных анализов, используемых для количественного определения роста. Однако понимание ограничений и неопределенностей измерений датчиков имеет решающее значение для обеспечения того, чтобы показания датчика точно отражали условия реактора. Это понимание включает базовые знания принципов измерения, связанных с датчиками, процесса и частоты калибровки, неопределенности измерения и того, что датчик может и не может измерить. Например, электрический отклик для описанного здесь светочувствительного датчика неравномерно распределен по видимому диапазону спектра, и на выход датчика могут потребоваться некоторые поправочные коэффициенты, в зависимости от того, как будут анализироваться данные этого датчика.
Температурные уровни и вариации также чрезвычайно важны, так как изменения температуры могут резкоФлюидизацию отклика датчика. Важное значение имеет также понимание потенциальных помех, которые могут повлиять на показания датчиков. Эта помеха может представлять собой окружающий электрический шум из здания или может быть обусловлена измерительной средой ( например, ионы натрия могут резко влиять на показания рН при значениях рН более 10) 12 . Более того, погружение нескольких зондов в раствор, особенно высокоионный и проводящий раствор соли, также является потенциальным источником помех. Электроды, которые измеряют рН (или ионную силу, растворенный кислород, растворенный СО 2 и т . Д.), Особенно чувствительны к окружающим электрическим шумам и могут быть легко возмущены. Сигнальное кондиционирование, используемое для защиты электродного сигнала, не может гарантировать, что другие факторы не будут мешать показаниям зонда. В рамках контроля качества для проверки t следует использовать другое лабораторное оборудование, такое как ручной pH-зонд, ручной спектрометр и термометр.Показания датчика и убедиться, что система настроена и работает правильно.
Другим ограничением, которое необходимо решить, является возможное воздействие водорослей и / или среды культивирования на датчики. Например, если мусор или пузырьки водорослей покрывают фотодиодный рецептор светочувствительного датчика, это повлияет на показания. Точно так же pH-электроды чрезвычайно чувствительны и требуют особой осторожности для обеспечения точных показаний. Эти электроды работают путем измерения разности напряжений во внутреннем соединении из-за накопления ионов H + ; Для поддержания точных измерений требуется гидратированный буферный слой внутри зонда 12 . В зависимости от условий в реакторе этот слой будет изнашиваться, и отклик датчика может измениться в течение эксперимента, когда зонд погружен в воду. В предварительных испытаниях выходное напряжение рН не дрейфовало более чем на 0,2 единицы рН в течение 20-дневного эксперимента, Но необходимо провести дальнейшие оценки, чтобы охарактеризовать это изменение чувствительности сенсора и установить максимальное время экспериментального эксперимента, особенно если требуются мелкие корректировки / количественные значения рН.
Многие современные настольные системы PBR, созданные для анализа роста водорослей, не контролируют и не контролируют внутреннюю культуральную среду настолько жестко, насколько это необходимо, чтобы понять, как разные факторы влияют на рост водорослей, поскольку создание таких систем может быть сложной задачей. Этот протокол может помочь облегчить более контролируемые эксперименты, предоставив пошаговые инструкции для построения PBR с мониторингом в реальном времени. Более того, эти данные в реальном времени могут использоваться не только для лучшего контроля экспериментальных условий, но и могут быть использованы для оценки кинетики роста ( например, показания оптической плотности в качестве эталона для общих темпов роста).
Контролируемые экспериментальные системы могут помочь сделать исследования водорослей более воспроизводимыми. Сканирующая шкала PBR sEtrops, которые контролируются и контролируются, могут повысить эффективность эксперимента, минимизируя непреднамеренные артефакты в экспериментальном дизайне и могут помочь в продвижении усилий по превращению водорослевого биотоплива в устойчивый альтернативный источник топлива.
The authors have nothing to disclose.
Авторы признают Национальный научный фонд «Новые рубежи в исследованиях и инновациях» (Премия № 1332341) за финансирование этого исследования. Авторы также хотели бы поблагодарить д-ра Эндрю Гришофа, а также сообщества поддержки LabJack и DAQFactory за их помощь и помощь, предлагаемые на протяжении всего этого процесса.
Cast acrylic sheets | McMaster Carr | 8560K244 | 7/8'' thick, 12×36'', optically-clear, the size of sheets purchased will depend on reactor dimensions. |
Acrylic cement | McMaster Carr | 7517A4 | Scigrip plastic pipe cement, #4SC nonwhitening for acrylic. Not needed if gaskets and screws are used for PBR assembly. |
Acrylic cement applicator needle | McMaster Carr | 75165A136 | Acrylic cement applicator needle, 25 Gauge, 1", Stainless steel, PTFE lined. |
Plastic dispensing bottle for acrylic cement | McMaster Carr | 7544A67 | Plastic dispensing bottle, 2-oz size, packs of 5. |
Viscous acrylic cement | McMaster Carr | 7515A11 | Scigrip plastic pipe cement. Medium-bodied acrylic cement to seal in any gaps within PBR body. |
PG-13.5 thread tap | McMaster Carr | 2485A14 | Can be used to help secure pH electrode to lid (if applicable). |
PBR and lid | NCSU Precision Machine Shop | Karam Algae 3.2L Reactor Revision E | This machine shop is open to public for business. Contact shop manager. |
pH sensor | Hamilton | 238643 | EasyFerm Plus 120, autoclavable, millivolt output. |
Light sensor | Apogee Instruments | SQ-225 | Amplified 0-5 volt electric calibration quantum sensor, water-proof. |
Temperature sensor | LabJack | EI1034 | Stainless steel, water-proof temperature sensor. |
pH transmitter wire with BNC end | Sigma-Aldrich | HAM355173-1EA | This wire will vary with type of pH probe. Make sure wire is compatible with pH probe and has BNC connector end. |
Unity gain pre-amplifier | Omega Engineering | PHTX-21 | Signal processing amplifier for pH electrode needed for high-impedance pH readings. |
Coaxial adapter, BNC female-to-binding post | Amazon | SMAKN B00NGD5K80 | For connecting pH signal from pre-amplifier to microcontroller. |
Capacitor (1000 uF) | Amazon | Nichicon BCBI4950 | For low-pass filter. |
Resistor (1000 ohm) | Radio Shack | 2711321 | For low-pass filter. |
Hookup wire | RadioShack | 2781222 | For making low-pass filters, connecting sensors to microcontroller, and wiring motor. |
Heat shrink tubing | RadioShack | 2781611 | For low-pass filter assembly. |
Data acquisition and control unit | LabJack | LabJack U6 | To process electrical signal from sensors and communicate with data acquisition and control software. |
DAQFactory data acquisition software | DAQFactory | DAQFactory Express Release 5.87c Build: 2050 | Free to download, for up to 10 channels. |
Mini DC-gearmotor | McMaster Carr | 6331K31 | Motor for mixer impeller. |
Impeller and shaft | N/A | N/A | Email authors for 3D files. |
Variable DC power supply | Amazon | Tekpower HY1803D | Variable DC power supply, 0-18V @ 0-3A. |
Grow Lamp | HydroGrow | SOL-1 | This exact model is no longer available. |
Incubator | Thermo Scientific | Precision Model 818 | This particular incubator can withstand an internal heat source since this unit's cooling compressors run non-stop regardless of temperature setting. |