이 프로토콜은 waterborne의 검출을위한 다른 단계로 접선 흐름 중공 섬유 ultrafiltration 샘플 농도 시스템의 사용 및 열 분해를 설명<em> Cryptosporidium</em>과<em> Giardia</emEPA 방법 1623을 사용하여> 종.
Cryptosporidium 및 Giardia 종, 그 원인 waterborne diarrheal 질병 발생은 전세계 원생 동물문 가장 널리 두 가지입니다. 나은이 병원체의 유행을 특성화하기 위해 EPA 방법 1623가 개발하고 미국의 식수에서 이러한 유기체의 수준을 모니터링하는 데 사용된 것은 12 공급하고 있습니다. 방법은 세 가지 주요 부분으로 구성되어 있으며, 첫 번째는 원시 표면의 물이 적어도 10 패가 필터링되는 시료 농도입니다. 생물과 덫에 파편 나서 필터에서 eluted 및 추가 샘플을 집중 centrifuged있다. 메서드의 두 번째 부분은 농축 물 샘플은 특히 농축 잔해에서 기생충의 특정 제거 허용 Cryptosporidium oocysts과 Giardia의 cysts에 바인딩 immunomagnetic 구슬에 적용됩니다 immunomagnetic 분리 절차를 사용합니다. 이러한 (OO) cysts 그러면 산성 분해 proce에 의해 자석 구슬로 떨어뜨려졌다dure. 메서드의 마지막 부분 (OO) cysts는 슬라이드, 스테인드에 적용하고, 현미경으로 열거됩니다 immunofluorescence 염색법과 열거입니다.
Envirochek 필터 (막 공사, 앤아버 미시건), Envirochek HV 필터 (막 공사), Filta – 맥스 필터 (IDEXX, 웨스트 브룩, MA) : 방법 1623은 물 속에 Cryptosporidium oocysts과 Giardia의 cysts를 캡처 목록에 명시된 4 가지 시료 농도 시스템을 가지고 또는 연속 흐름 원심 분리 (Haemonetics, Braintree, MA). 그러나, Cryptosporidium 및 Giardia (OO) 낭종의 recoveries는 1,14를 사용한 소스 물 매트릭스 및 필터에 따라 매우 다양합니다. 새로운 접선 흐름 중공 섬유 ultrafiltration (HFUF) 시스템은 최근 Cryptosporidium oocysts를 복구에서보다 효율적이고보다 강력한 것으로 표시되었습니다 각종 수상 매트릭스에서 Giardia의 cysts는, 또한, 다른 캡슐 필터 옵션을보다 저렴S는 동시에 1-3,5-8,10,11을 여러 병원균을 집중하실 수 있습니다. 또한, 힐 및 동료에 의해 이전의 연구들은 직접 Envirochek HV 필터 4 비해 HFUF 크게 Cryptosporidium oocysts의 recoveries를 개선한다는 보여주었다. 현재의 방법에 대한 추가적인 수정은 또한 방법의 성능을 향상시키기 위해보고되었습니다. 열 분해하여 산성 분해 절차를 교체하는 것은 어떤 매트릭스 9,13의 자석 구슬에서 Cryptosporidium를 분리에서보다 효과적인 것으로 표시되었습니다.
이 프로토콜은 열 분해 단계로 새로운 HFUF 여과 시스템을 사용하는 수정된 방법 1623에 대해 설명합니다. 이 수정된 방법으로 HFUF의 사용은 현재 EPA 방법 1,623 여과 옵션 저렴한 대안이며, 여러 생물의 농도를 허용함으로써 더 많은 유연성을 제공합니다.
접선 흐름 중공 섬유 ultrafiltration은 Cryptosporidium의 oocysts와 물에서 Giardia의 cysts의 초기 농도에 대한 대안과 효과적인 기술입니다. 중공 섬유 ultrafiltration은 기존의 필터보다 저렴합니다. 그것이 다른 수상 매트릭스의 다양한 Cryptosporidium oocysts과 Giardia의 cysts을 집중하는 능력을 가지고 있기 때문에 그것은 EPA 방법 1623에 사용되는 현재의 여과 기술에 대한 유용한 대안입니다. 대부분의 다른 여과 방식과 마찬가지로 중공 섬유 ultrafiltration은 매우 흐린 샘플과 오염하는 경향이있다. 높은 수압에 필터가 오염으로부터 초래 하리라는 않으므로 그것은 여과 실행하는 동안 압력을 모니터링하는 것이 좋습니다. Cryptosporidium oocysts과 Giardia의 cysts 이외에 중공 섬유 ultrafiltration은 박테리아와 바이러스 1-3,5,8을 집중시킬 것으로 표시되었습니다. 중공 섬유 ultrafiltration O이 방법에 utlined은 하나의 샘플에서 여러 생물을 집중하는 데 사용할 수 있습니다. 그것은 200 및 250 ML 사이에 최종 볼륨을 취득하면 (OO) 낭종의 손실을 초래할 수도 여분 원심 분리 단계 있으므로 농도 절차에서 중요한 마지막 단계, (단계 2.2) 피할 수있다는 것을 주목할 것입니다. retentate 병으로 모든 oocysts 또는 cysts를 강제로 충분한 액체 부피 없을 것이다 때문에 그러나 병의 볼륨이 너무 낮게 떨어뜨 수 있도록하는 것은 recoveries에 불리한 영향을 미칠 수 있습니다. 따라서 그것은 200 및 250 ML 사이에 최종 볼륨을 유지하는 것이 좋습니다.
열 분해는 방법 1623의 산성 분해 단계에 대한 대안입니다. 이 대안이 단계는 Cryptosporidium oocyst 복구를 개선하고 하천이나 시약 물 9 중 격리 때 메서드 편차를 줄이기 위해 표시되었습니다. 산성 및 열 분해 방법 나란히 비교 시연 그 dissocia에 열을 사용소리지르는 immunomagnetic 구슬의 생물은 Cryptosporidium 및 Giardia 모두 높은 뜻 recoveries을 생산했다. 또한, Cryptosporidium 및 Giardia recoveries의 정밀도 산성 분리 구에 비해 열 분해로 처리된 시료에서 더했습니다.
농도 단계로 HFUF의 설립은 여러 유기체를 집중하는 능력을 제공함으로써 더 많은 유연성을 허용합니다. 또한 그것은 현재의 방법 1,623 여과 옵션에 대한 저렴한 대안입니다.
The authors have nothing to disclose.
우리는 그의 기술 지원이 원고와 더그 해밀턴의 비판적 검토를 위해 앤은 그림과 마이클 짐머만 감사드립니다.
Equipment/Reagent | Vendor | Catalog # |
Asahi Kasei Rexeed 25 S/R wet hollow-fiber ultrafilters | Dial Medical | REXEED25S/R |
I/P 73 (Masterflex R-3603), or equivalent | Cole Parmer | EW-06408-73 |
L/S 24 (Masterflex Platinum-Cured), or equivalent | Cole Parmer | EW-96410-24 |
L/S 15 (Masterflex Platinum-Cured), or equivalent | Cole Parmer | EW-96410-15 |
L/S 36 (Masterflex Platinum-Cured), or equivalent | Cole Parmer | EW-96410-36 |
I/P Precision Brushless Drive | Cole Parmer | EW-77410-10 |
I/P Easy Load Pump Head | Cole Parmer | EW-77601-10 |
Black HDPE Tee, 1/4″x 3/8″ x 3/8″ | US Plastics | 62064 |
Masterflex T-connector L/S 15-25 | Cole Parmer | EG-30613-12 |
Nalgene heavy-duty pp 1 L bottle | Cole Parmer | EW-06257-10 |
10 ml pipettes | Fisher Scientific | 13-678-11C |
Nalgene filling/venting cap for 1/4″ tubing, 53B | Cole Parmer | EW-06258-10 |
Pressure gauge | Cole Parmer | A-680-46-10 |
Straight coupling, NPT(F), 1/4″ | Cole Parmer | EW-06469-18 |
NPT branch tee, natural pp | Cole Parmer | A-30610-75 |
Pinch clamps, 1/2″ | Cole Parmer | EW-06833-00 |
Custom fit DIN adapters | Molded Products Corp | MPC-855NS.250 |
Ring stand | Fisher Scientific | 14-670B |
Ring stand clamps | Fisher Scientific | 05-769-6Q |
Keck ramp clamp, 14mm | Cole Parmer | EW-06835-10 |
Sodium polyphosphate | Sigma Aldrich | 305553 |
Sodium thiosulfate pentahydrate | Sigma Aldrich | 72050 |
Antifoam Y-30 emulsion | Sigma Aldrich | A5758 |
Tween-80 | Sigma Aldrich | P1754 |
10 L Collapsible high-density polyethylene cubitainer | VWR | IR314-0025 |
Centrifuge bottle rack | Fisher Scientific | 05-663-103 |
250 ml conical centrifuge tubes | Corning | 430776 |
Disposable funnel | Cole Parmer | U-6122-10 |
Wash bottle | Cole Parmer | U-06252-40 |
Centrifuge | Beckman Coulter | Allegra X-15R |
Swinging bucket rotor | Beckman Coulter | ARIES SX4750 |
Centrifuge bucket adapters for 250 ml conical tubes | Beckman Coulter | 349849 |
200 μl large bore pipette tips | Fisher Scientific | 02-707-134 |
VacuShield Filter | Gelman | 629-4402 |
5 ml pipettes | Fisher Scientific | 13-678-11D |
Dynabeads: Cryptosporidium/Giardia combo kit | IDEXX | 73002 |
50 ml conical centrifuge tubes | Falcon | 352098 |
Dynal L10 flat sided tubes | IDEXX | 74003 |
Timer | VWR | 23609-202 |
Dynal MPC-6 magnet | IDEXX | 12002D |
1 ml pipettes | VWR | 53283-700 |
1.5 ml low adhesion microcentrifuge tubes | Fisher Scientific | 02-681-320 |
1000 μl pipette & corresponding barrier tips | Gilson | P1000/DF1000ST |
100 μl pipette & corresponding barrier tips | Gilson | P100/DF100ST |
9 inch Pasteur pipettes | VWR | 14672-412 |
Dynal MPC-S magnet | IDEXX | 12020D |
Vortex | VWR | 14216-188 |
Dynabeads rotator mixer | IDEXX | 94701 |
Heat block | Fisher Scientific | 11-718-2 |
Lab Armor Beads | Lab Armor | 42370-750 |
Digital thermometer | Fisher Scientific | 15-077-60 |
Phosphate-buffer saline 1X pH 7.4 (1X PBS) | Sigma | P4417 |
Single Spot slides | IDEXX | 30201 |
Cover glass | Corning | 287018 |
EasyStain direct kit | BTF | – |
10 μl pipette & corresponding barrier tips | Gilson | P10 & DF10ST |
4′,6′-Diamidino-2-phenyl indole dihydrochloride (DAPI) | Sigma | D9542 |
Clear nail polish | Fisher Scientific | S30697 |
Methanol | Fisher Scientific | L6815 |
Kimwipes | Kimberly Clark | 34155 |
Incubator | Boekel Scientific | 133000 |
slide warmer | Fisher Scientific | 11-474-521 |
Immersion oil, Type A ND= 1.515 | Nikon | MXA20234 |
Nikon 90i microscope with DIC capabilities | Nikon | MBA 77000 |
Plan APO 100X oil objective | Nikon | MRD01901 |
Plan Achro 20X | Nikon | MRL00202 |
FITC filter | Nikon | 96302 |
DAPI filter | Nikon | 96301 |
X-cite fluorescence illuminator | Nikon | 87540 |
Lens paper | Nikon | 76997 |
Biohazard disposable bag | Fisher Scientific | 01-829D |
Biohazard sharps container | Fisher Scientific | 14-827-117 |
3 % hydrogen peroxide | VWR | BDH3540-2 |
Bleach | Fisher Scientific | 1952030 |
Wypall | Kimberly Clark | 34790 |