Journal
/
Genética
/
Kartlegging Alzheimers sykdom varianter til deres mål gener bruke beregningsorientert analyse av Kromatin Configuration
JoVE Journal
Genética
This content is Free Access.
JoVE Journal Genética
Mapping Alzheimer’s Disease Variants to Their Target Genes Using Computational Analysis of Chromatin Configuration

Kartlegging Alzheimers sykdom varianter til deres mål gener bruke beregningsorientert analyse av Kromatin Configuration

DOI:
10.3791/60428-v

•

04:41 min

•

January 09, 2020

•

, , ,
1Department of Genetics,University of North Carolina, 2Neuroscience Center,University of North Carolina, 3Thurston Arthritis Research Center,University of North Carolina, 4Department of Cell Biology and Physiology,University of North Carolina

Capítulos

  • 00:05Título
  • 01:00Generation of a Granges Object for Credible SNPs and Positional Mapping
  • 01:53Developmental Expression Trajectories
  • 02:18Cell-type Expression Profiles and Gene Annotation Enrichment Analysis
  • 02:46Results: Determination and Characterization of Putative Target Genes of AD GWS Loci
  • 03:52Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Vi presenterer en protokoll for å identifisere funksjonelle implikasjoner av ikke-koding varianter identifisert av Genova-brede foreningen studier (GWAS) ved hjelp av tredimensjonale kromatin interaksjoner.

Tags

Alzheimer’s DiseaseGWASChromatin ConfigurationComputational AnalysisTarget GenesSNPsHi-CGene ExpressionCell-type ExpressionGene Annotation Enrichment

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

Kartlegging av RNA-RNA-interaksjoner globalt ved bruk av biotinylert psoralen

Sekvensiell Salt utdrag for analyse av Bulk Chromatin bindende egenskaper Chromatin endre komplekser

Analyse av c-KIT ligand-promotoren ved bruk av kromatinimmunutfelling

Retroviral skanning: Mapping MLV Integrering Sites for å definere Cell-spesifikke Regulatory Regioner

Kartlegging genomet hele tilgjengelig Chromatin i primære menneskelige T-lymfocytter av ATAC-Seq

Immunostaining for DNA modifikasjoner: beregningsorientert analyse av AC Confocal bilder

Bruke Sniper-Cas9 å minimere Off-målet effekter av CRISPR-Cas9 uten tap av på målet aktivitet Via regissert evolusjon

En in vitro-protokoll for evaluering av MicroRNA nivåer, funksjoner og assosierte mål gener i tumor celler

In vivo funksjonell studie av sykdom-Associated sjeldne Human varianter bruke Drosophila

Identifikasjon av sirkulær RNAs ved hjelp av RNA-sekvensering

Read Article