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Une approche par graphe de connaissances pour élucider le rôle des voies organellaires dans la maladie via des rapports biomédicaux
JoVE 신문
생화학
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JoVE 신문 생화학
A Knowledge Graph Approach to Elucidate the Role of Organellar Pathways in Disease via Biomedical Reports

Une approche par graphe de connaissances pour élucider le rôle des voies organellaires dans la maladie via des rapports biomédicaux

DOI:

07:35 min

October 13, 2023

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Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:09Running the Docker Container
  • 01:53Preparing the Diseases and Proteins
  • 03:16Analyzing the Results
  • 04:20Predictive Analysis
  • 05:40Results: Top Protein‐Disease and Pathway‐Disease Associations and Application of Deep Learning for Knowledge Graph Completion
  • 06:40Conclusion

Summary

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Un protocole informatique, CaseOLAP LIFT, et un cas d’utilisation sont présentés pour étudier les protéines mitochondriales et leurs associations avec les maladies cardiovasculaires telles que décrites dans les rapports biomédicaux. Ce protocole peut être facilement adapté pour étudier les composants cellulaires et les maladies sélectionnés par l’utilisateur.

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