RNA-fluorescens in situ hybridisering (FISH) for å visualisere mikrobiell kolonisering og infeksjon i Caenorhabditis elegans tarmer

Tarmmikrober, inkludert ekstracellulære bakterier og intracellulære patogener som Orsay-viruset og mikrosporidia (sopp), er ofte forbundet med ville Caenorhabditis nematoder . Denne artikkelen presenterer en protokoll for å oppdage og kvantifisere mikrober som koloniserer og/eller infiserer C. elegans nematoder, og for måling av patogenbelastning etter kontrollerte infeksjoner i laboratoriet.