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Un flujo de trabajo integrado de identificación y cuantificación en un metaboloma no dirigido basado en el control FDR
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JoVE 신문 생화학
An Integrated Workflow of Identification and Quantification on FDR Control-Based Untargeted Metabolome
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Un flujo de trabajo integrado de identificación y cuantificación en un metaboloma no dirigido basado en el control FDR

DOI:
10.3791/63625-v

•

05:35 min

•

September 20, 2022

•

, , ,
1Key Laboratory of Functional Protein Research of Guangdong Higher Education Institutes and MOE Key Laboratory of Tumor Molecular Biology, Institute of Life and Health Engineering, College of Life Science and Technology,Jinan University, 2Chi-Biotech Co. Ltd.

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 01:07Preparing Metabolomics Datasets
  • 02:21Metabolite Identification and Differential Analysis
  • 03:49Results: Quantitative Analysis by MetaX
  • 04:52Conclusion

Summary

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Construimos un flujo de trabajo metabolómico no dirigido que integró XY-Meta y metaX juntos. En este protocolo, mostramos cómo usar XY-Meta para generar una biblioteca espectral señuelo a partir de la referencia de espectros de acceso abierto, y luego realizamos el control FDR y usamos el metaX para cuantificar los metabolitos después de identificar los espectros metabolómicos.

Tags

FDR ControlUntargeted MetabolomeXY-MetaTarget-decoy StrategyMetabolite IdentificationFalse Positive ReductionBiomarker DiscoveryGNPS DatabaseProteoWizardRaw Data ConversionNIST LibraryXY-Meta ProgramMetaX SoftwareQuantitative AnalysisPCA PlotPeak Annotation

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