Journal
/
생화학
/
Modellering af et etzymaktivt websted ved hjælp af molekylær visualisering Freeware
JoVE 신문
생화학
Author Produced
This content is Free Access.
JoVE 신문 생화학
Modeling an Enzyme Active Site using Molecular Visualization Freeware

Modellering af et etzymaktivt websted ved hjælp af molekylær visualisering Freeware

DOI:
10.3791/63170-v

•

14:37 min

•

December 25, 2021

•

, , , , ,
1The University of Texas at Austin, 2Mount Mary University, 3College of St. Benedict/St. John’s University, 4Wabash College

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 01:42Protocol: UCSF ChimeraX
  • 03:14Results: UCSF ChimeraX
  • 03:33iCN3D Protocol
  • 06:38Results: iCN3D
  • 07:02Protocol: Jmol
  • 09:47Results: Jmol
  • 10:08Protocol: PyMOL
  • 12:56Results: PyMOL
  • 14:01Conclusion

Summary

자동 번역

자동 번역

En vigtig færdighed inden for biomolekylær modellering er at vise og kommentere aktive steder i proteiner. Denne teknik demonstreres ved hjælp af fire populære gratis programmer til makromolekylær visualisering: iCn3D, Jmol, PyMOL og UCSF ChimeraX.

Tags

Molecular VisualizationEnzyme Active SiteGlucokinasePDBID 3FGULigandsSubstrate AnalogCatalytic ComplexBinding InteractionsUCSF ChimeraXMolecular ModelingBiological MacromoleculesVisualization Software

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

Kortlægning af bindingssted en aptamer på ATP Brug mikroskala Thermophoresis

Oligopeptidkonkurrenceanalyse for phosphoryleringsstedbestemmelse

Site-Directed mutagenese for In Vitro og i Vivo eksperimenter eksemplificeret med RNA interaktioner i Escherichia Coli

Fluorescerende visualisering af mango-Tagged RNA i polyacrylamid gels via en Poststaining metode

Ekspression, rensning, krystallisering og enzym assays af Fumarylacetoacetat hydrolase-domæne-holdige proteiner

Evaluering af protein-protein interaktioner ved hjælp af en on-membran fordøjelse teknik

Karakterisering på molekyleniveau ved hjælp af robuste biokemiske tilgange af et nyt kinase protein

Enkeltcelleanalyse af transskriptionsaktive alleler efter enkeltmolekyle FISH

Site Specifik lysin acetylering af Histoner for nukleosom rekonstitution ved hjælp af genetisk kode ekspansion i Escherichia coli

Samtidig visualisering af dynamikken i tværbundne og enkelte mikrotubuli in vitro ved hjælp af TIRF-mikroskopi

Read Article