Journal
/
생화학
/
نمذجة موقع نشط إنزيم باستخدام التصور الجزيئي مجانية
JoVE 신문
생화학
Author Produced
This content is Free Access.
JoVE 신문 생화학
Modeling an Enzyme Active Site using Molecular Visualization Freeware
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

نمذجة موقع نشط إنزيم باستخدام التصور الجزيئي مجانية

DOI:
10.3791/63170-v

•

14:37 min

•

December 25, 2021

•

, , , , ,
1The University of Texas at Austin, 2Mount Mary University, 3College of St. Benedict/St. John’s University, 4Wabash College

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 01:42Protocol: UCSF ChimeraX
  • 03:14Results: UCSF ChimeraX
  • 03:33iCN3D Protocol
  • 06:38Results: iCN3D
  • 07:02Protocol: Jmol
  • 09:47Results: Jmol
  • 10:08Protocol: PyMOL
  • 12:56Results: PyMOL
  • 14:01Conclusion

Summary

자동 번역

자동 번역

مهارة رئيسية في النمذجة الجزيئية الحيوية هو عرض والتعليق على المواقع النشطة في البروتينات. وقد أثبتت هذه التقنية باستخدام أربعة برامج شعبية مجانية للتصور الجزيئي الكلي: iCn3D، Jmol، PyMOL، وUCSF ChimeraX.

Tags

Molecular VisualizationEnzyme Active SiteGlucokinasePDBID 3FGULigandsSubstrate AnalogCatalytic ComplexBinding InteractionsUCSF ChimeraXMolecular ModelingBiological MacromoleculesVisualization Software

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

رسم خريطة الموقع ملزم لأبتمر على ATP عن طريق الميكروسكيل Thermophoresis

أوليغوببتيد مسابقة الفحص لتحديد موقع الفسفرة

الطفرات موقع الموجه لفي المختبر وفي فيفو التجارب المتمثلة بالتفاعلات الحمض النووي الريبي في الإشريكيّة القولونية

التصور الفلورسنت من الحمض النووي الريبي المانجو الموسومة في المواد الهلامية البولي أكريلاميد عن طريق طريقة بوستينينغ

التعبير، تنقية، تبلور، واختبارات إنزيم من البروتينات التي تحتوي على مجال الهيدرولاز اتاتس

تقييم تفاعلات البروتين والبروتين باستخدام تقنية الهضم على الغشاء

توصيف على المستوى الجزيئي باستخدام نهج كيميائية حيوية قوية لبروتين كيناز جديد

تحليل خلية واحدة من الأليل النشطة نسخيا بواسطة جزيء واحد FISH

موقع محدد ليسين أسيتيل الهستونات لإعادة تشكيل النوكليوسوم باستخدام توسيع الشفرة الوراثية في الإشريكية القولونية

التصور المتزامن لديناميكيات الأنابيب الدقيقة المتقاطعة والمفردة في المختبر بواسطة مجهر TIRF

Read Article