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Modelando um site ativo enzimático usando freeware de visualização molecular
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JoVE 신문 생화학
Modeling an Enzyme Active Site using Molecular Visualization Freeware

Modelando um site ativo enzimático usando freeware de visualização molecular

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•

14:37 min

•

December 25, 2021

DOI:

10.3791/63170-v

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10.3791/63170-v

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14:37 min
December 25, 2021

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1The University of Texas at Austin, 2Mount Mary University, 3College of St. Benedict/St. John’s University, 4Wabash College

Summary

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Uma habilidade fundamental na modelagem biomolecular é exibir e anotar locais ativos em proteínas. Esta técnica é demonstrada usando quatro programas gratuitos populares para visualização macromolecular: iCn3D, Jmol, PyMOL e UCSF QuimeraX.

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Molecular VisualizationEnzyme Active SiteGlucokinasePDBID 3FGULigandsSubstrate AnalogCatalytic ComplexBinding InteractionsUCSF ChimeraXMolecular ModelingBiological MacromoleculesVisualization Software

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Procko, K., Bakheet, S., Beckham, J. T., Franzen, M. A., Jakubowski, H., Novak, W. R. P. Modeling an Enzyme Active Site using Molecular Visualization Freeware. J. Vis. Exp. (178), e63170, doi:10.3791/63170 (2021).

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